Upgrade of sample exchanger to accelerate protein X-ray crystal structure analysis

• Project/Area Number: 20560251
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Intelligent mechanics/Mechanical systems
• Research Institution: High Energy Accelerator Research Organization
• Principal Investigator: HIRAKI Masahiko High Energy Accelerator Research Organization, 物質構造科学研究所, 研究機関講師 (20282676)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): WAKATSUKI Soichi 高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 教授 (00332114) ; KATO Ryuichi 高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 准教授 (50240833) ; KAWASAKI Masato 高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 准教授 (00342600) ; IGARASHI Noriyuki 高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 准教授 (80300672) ; MATSUGAKI Naohiro 高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 助教 (50342598) ; YAMADA Yusuke 高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 助教 (20391708)
• Project Period (FY): 2008 – 2010
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2010)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2010: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2009: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2008: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
• Keywords: X線結晶構造解析 / タンパク質 / ロボティクス / 知能機械 / 校正 / 蛋白質

Research Abstract

We developed a sample exchange system that was able to insert sample holders to cassettes in a liquid nitrogen Dewar. The developed system was operated stably with only 0.1% troubles after the calibration of the system. In addition, the X-ray diffraction data of protein crystals stored by the developed system were enough for structure analysis.

Research Products

• [Journal Article] Fully Automated Data Collection Using PAM and the Development of PAM/SPACE Reversible Cassettes (2010)
  • Author(s): Masahiko Hiraki, Shokei Watanabe, Leonard M.G.Chavas, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Soichi Wakatsuki, Masahiro Fujihashi, Kunio Miki, Seiki Baba, Go Ueno, Masaki Yamamoto, Mamoru Suzuki, Atsushi Nakagawa, Nobuhisa Watanabe, Isao Tanaka
  • Journal Title: American Institute of Physics Vol.1234 Pages: 673-676
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Fully Automated Data Collection Using PAM and the Development of PAM/SPACE Reversible Cassettes (2010)
  • Author(s): Masahiko Hiraki
  • Journal Title: American Institute of Physics Volume: 1234 Pages: 673-676
  • Peer Reviewed
• [Presentation] タンパク質結晶自動交換ロボットPAM (2011)
  • Author(s): 平木雅彦、Leonard M.G.Chavas、山田悠介、松垣直宏、五十嵐教之、若槻壮市
  • Organizer: 日本結晶学会年会
  • Place of Presentation: 大阪大学コンベンションセンター、大阪
  • Year and Date: 2011-12-03
• [Presentation] タンパク質結晶自動交換ロボットPAM (2011)
  • Author(s): 平木雅彦
  • Organizer: 第24回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
  • Place of Presentation: 茨城県、つくば国際会議場
  • Year and Date: 2011-01-08
• [Presentation] タンパク質結晶自動交換ロボットPAM (2011)
  • Author(s): 平木雅彦、Leonard M.G.Chavas、山田悠介、松垣直宏、五十嵐教之、若槻壮市
  • Organizer: 第24回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
  • Place of Presentation: つくば国際会議場、茨城
• [Presentation] タンパク質結晶自動交換ロボットPAM (2010)
  • Author(s): 平木雅彦
  • Organizer: 日本結晶学会年会
  • Place of Presentation: 大阪府、大阪大学コンベンションセンター
  • Year and Date: 2010-12-03
• [Presentation] Upgrade of High-throughput Sample Exchange Robots PAM and Development of PAM/SPACE Reversible Cassettes (2010)
  • Author(s): Masahiko Hiraki, Shokei Watanabe, Leonard M.G.Chavas, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Soichi Wakatsuki, Masahiro Fujihashi, Kunio Miki, Seiki Baba, Go Ueno, Masaki Yamamoto, Mamoru Suzuki, Atsushi Nakagawa, Nobuhisa Watanabe, Isao Tanaka
  • Organizer: 回折構造生物学に関する国際シンポジウムISDSB2010
  • Place of Presentation: パリSUD大学、フランス
  • Year and Date: 2010-05-28
• [Presentation] Upgrade of High-throughput Sample Exchange Robots PAM and Development of PAM/SPACE Reversible Cassettes (2010)
  • Author(s): Masahiko Hiraki
  • Organizer: ISDSB2010 (International Symposium on Diffraction Structural Biology)
  • Place of Presentation: フランス、パリSUD大学
  • Year and Date: 2010-05-28
• [Presentation] 蛋白質結晶自動交換ロボットの現状と今後の予定 (2010)
  • Author(s): 平木雅彦、Leonard M.G.Chavas、山田悠介、松垣直宏、五十嵐教之、若槻壮市
  • Organizer: 第27回PFシンポジウム
  • Place of Presentation: つくば国際会議場、茨城
  • Year and Date: 2010-03-09
• [Presentation] 結晶交換システムPAMの高度化 (2010)
  • Author(s): 平木雅彦、山田悠介、松垣直宏、Leonard M.G.Chavas、五十嵐教之、若槻壮市
  • Organizer: 第23回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
  • Place of Presentation: イーグレ姫路、兵庫
  • Year and Date: 2010-01-08
• [Presentation] 第23回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム (2010)
  • Author(s): 平木雅彦
  • Organizer: 結晶交換システムPAMの高度化
  • Place of Presentation: 姫路
  • Year and Date: 2010-01-08
• [Presentation] タンパク質結晶交換ロボットPAM (2010)
  • Author(s): 平木雅彦、Chavas Leonard M.G.、山田悠介、松垣直宏、五十嵐教之、若槻壮市
  • Organizer: PF研究会「放射光利用による構造生物の将来像」
  • Place of Presentation: KEK小林ホール、茨城
• [Presentation] Current status and developments of macromolecular crystallography beamlines at the Photon Factory (2009)
  • Author(s): Masahiko Hiraki, Leonard Chavas, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Soichi Wakatsuki
  • Organizer: アジア結晶学会AsCA2009
  • Place of Presentation: 北京Jing Yi Hotel,中国
  • Year and Date: 2009-10-24
• [Presentation] Current status and development of macromolecular crystallography beamlines at the Photon Factory (2009)
  • Author(s): Masahiko HIRAKI
  • Organizer: AsCA2009 (Joint Conference of the Asian Crystallographic Association and Chinese Crystallographic Society)
  • Place of Presentation: 北京(中国)
  • Year and Date: 2009-10-24
• [Presentation] Fully-automated data collection using PAM and development of PAM/SPACE reversible cassettes (2009)
  • Author(s): Masahiko Hiraki, Shokei Watanabe, Leonard M.G.Chavas, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Soichi Wakatsuki, Masahiro Fujihashi, Kunio Miki, Seiki Baba, Go Ueno, Masaki Yamamoto, 鈴木守, Atsushi Nakagawa, Nobuhisa Watanabe, Isao Tanaka
  • Organizer: 放射光装置に関する国際会議SRI2009
  • Place of Presentation: メルボルン国際会議場,オーストラリア
  • Year and Date: 2009-10-01
• [Presentation] Fully-automated data collection using PAM and development of PAM/SPACE reversible cassettes (2009)
  • Author(s): Masahiko HIRAKI
  • Organizer: SRI09 (The 10th International Conference on Synchrotron Radiation Instrumentation)
  • Place of Presentation: メルボルン(オーストラリア)
  • Year and Date: 2009-10-01
• [Presentation] PF構造生物ビームラインにおける全自動解説データ収集の実現への取り組み (2009)
  • Author(s): 平木雅彦、山田悠介、松垣直宏、五十嵐教之、若槻壮市
  • Organizer: 第26回PFシンポジウム
  • Place of Presentation: つくば国際会議場、茨城
  • Year and Date: 2009-03-25
• [Presentation] PF構造生物ビームラインにおける全自動回折データ収集の実現への取り組み (2009)
  • Author(s): 平木雅彦
  • Organizer: 第26回PFシンポジウム
  • Place of Presentation: エポカルつくば(茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2009-03-25
• [Presentation] タンパク質結晶交換ロボットによる測定の自動化とサンプル用カセットの共通化 (2009)
  • Author(s): 平木雅彦、山田悠介、松垣直宏、五十嵐教之、若槻壮市、藤橋雅宏、上野剛、馬場清喜、鈴木守
  • Organizer: 第22回PF日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京大学山上会館、東京
  • Year and Date: 2009-01-11
• [Presentation] タンパク質結晶交換ロボットによる測定の自動化とサンプル用カセットの共通化 (2009)
  • Author(s): 平木雅彦
  • Organizer: 第22回 日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京大学(東京都文京区)
  • Year and Date: 2009-01-11
• [Presentation] Approach for auto-mated data collection at the Photon Factory macromolecular crystal-lography beamlines (2008)
  • Author(s): Masahiko Hiraki, Naohiro Matsugaki, Yusuke Yamada, Noriyuki Igarashi, Yurii Gaponov, Shokei Watanabe, Wataru Uda, Kumiko Sasajima, Nobuo pHonda, Soichi Wakatsuki
  • Organizer: 国際結晶学会IUCr2008
  • Place of Presentation: グランキューブ大阪国際会議場、大阪