Cloning and Expression of Marine Natural Product Biosynthetic by Function Based Screening

• Project/Area Number: 20810022
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Living organism molecular science
• Research Institution: Kumamoto University
• Principal Investigator: FUJITA Masaki Kumamoto University, 大学院・先導機構, 特定事業教員 (30505251)
• Project Period (FY): 2008 – 2009
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2009)
• Budget Amount: ¥3,302,000 (Direct Cost: ¥2,540,000、Indirect Cost: ¥762,000); Fiscal Year 2009: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2008: ¥1,742,000 (Direct Cost: ¥1,340,000、Indirect Cost: ¥402,000)
• Keywords: 海洋天然物 / 生合成 / メタゲノム / 生合成遺伝子 / 生理活性物質 / 異宿主生産 / 色素生合成 / 薬剤耐性 / 生物有機化学

Research Abstract

Metagenomics is a promising method to obtain useful genes from environmental samples. In order to prove that metagenomics is applicable to produce marine natural products, high quality marine metagenomic library consist of about 100 thousands clones was constructed. More than 300 pigment producing clones were screened from the library and their biosynthetic genes and products were characterized.

Research Products

• [Presentation] 海洋メタゲノムライブラリの構築と新規低分子化合物生合成遺伝子の探索 (2010)
  • Author(s): 藤田雅紀
  • Organizer: 第130回日本薬学会年会
  • Place of Presentation: 岡山・岡山大学
  • Year and Date: 2010-03-29
• [Presentation] 海洋メタゲノムライブラリの構築と新規低分子化合物生合成遺伝子の探索 (2010)
  • Author(s): 藤田雅紀、酒井淳司、市川洋一、大塚雅巳
  • Organizer: 第130回日本薬学会年会
  • Place of Presentation: 岡山(岡山大学)
• [Presentation] 異宿主発現法による新規海洋天然物の探索と生産研究 (2009)
  • Author(s): 藤田雅紀
  • Organizer: 第32回日本分子生物学会
  • Place of Presentation: 神奈川・パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2009-12-11
• [Presentation] 異宿主発現法を利用した新規生理活性物質Pantocin C の生産とその機能 (2009)
  • Author(s): 藤田雅紀
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2009-12-10
• [Presentation] 異宿主発現法による新規生理活性物質の探索と生産研究 (2009)
  • Author(s): 藤田雅紀
  • Organizer: メディシナルケミストリーシンポジウム
  • Place of Presentation: 東京・東京大学
  • Year and Date: 2009-11-26
• [Presentation] Cloning and Heterologous Expression of Novel Antibiotic Pantocin C Biosynthetic Gene Cluster (2009)
  • Author(s): 藤田雅紀
  • Organizer: 日韓天然物化学談話会
  • Place of Presentation: 神奈川・和光純薬研修所
  • Year and Date: 2009-08-28
• [Presentation] 海洋メタゲノムライブラリの作成と薬剤耐性を指標にした新規生理活性物質生合成遺伝子の探索 (2009)
  • Author(s): 藤田雅紀、酒井淳司、市川洋一、大塚雅巳
  • Organizer: 第129回日本薬学会年会
  • Place of Presentation: 京都(京都国際会館)
  • Year and Date: 2009-03-28
• [Presentation] 海洋メタゲノムライブラリの作成と薬剤耐性を指標にした新規生理活性物質生合成遺伝子の探索 (2009)
  • Author(s): 藤田雅紀
  • Organizer: 日本薬学会第129年会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2009-03-28
• [Presentation] 異宿主発現法を用いた新規抗菌物質Pnatocin Cの生産と同定 (2009)
  • Author(s): 藤田雅紀
  • Organizer: 第一回早稲田大学創校研究機構ケミカルバイオロジー研究所シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2009-02-04
• [Presentation] 異宿主発現法による新規生理活性物質の探索と生産研究 (2009)
  • Author(s): 藤田雅紀、Jon Clardy、酒井淳司、市川洋一、大塚雅巳
  • Organizer: 第32回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神奈川(パシフィコ横浜)
• [Presentation] 干潟微生物からのメタゲノムライブラリ作成および機能生遺伝子の探索 (2009)
  • Author(s): 藤田雅紀、酒井淳司、市川洋一、大塚雅巳
  • Organizer: 第26回日本薬学会九州支部大会
  • Place of Presentation: 福岡(九州大学)
• [Presentation] Jon Clardy Cloning and Heterologous Expression of Novel Antibiotic Pantocin C Biosynthetic Gene Cluster (2009)
  • Author(s): Masaki Fujita
  • Organizer: 第5回日韓天然物化学談話会
  • Place of Presentation: 神奈川(和光純薬研修所)
• [Presentation] 海洋メタゲノムライブラリの作成と薬剤耐性遺伝子を指標とした新規生理活性物質生合成遺伝子の探索 (2009)
  • Author(s): 藤田雅紀、酒井淳司、市川洋一、大塚雅巳
  • Organizer: 第23回海洋生物活性談話会
  • Place of Presentation: 神奈川(東京大学三崎臨海実験所)
• [Presentation] 異宿主発現法を利用した新規生理活性物質Pantocin Cの生産とその機能 (2008)
  • Author(s): Masaki Fujita、Jon Clardy
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 兵庫(神戸国際会議場)
  • Year and Date: 2008-12-10
• [Presentation] 異宿主発現法を用いた新規抗菌物質Pantocin Cの生産と同定 (2008)
  • Author(s): 藤田雅紀・Jon Clardy
  • Organizer: 第43回天然物化学談話会
  • Place of Presentation: 大阪(エキスポパーク)
  • Year and Date: 2008-07-28
• [Presentation] 線虫C. elegansの耐性幼虫フェロモン (2008)
  • Author(s): 藤田雅紀・Rebecca Bucher, Frank Schroeder, Jon Clardy
  • Organizer: モデル生物の化学生態学第3回化学生態学研究会
  • Place of Presentation: 北海道(ホテル湯の川)
  • Year and Date: 2008-07-05
• [Presentation] 異宿主発現法で得られた新規抗菌物質Pantocin Cの構造と生合成遺伝子 (2008)
  • Author(s): 藤田雅紀・Jon Clardy
  • Organizer: 第6回次世代を担う有機化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京(日本薬学会長居記念館)
• [Remarks]
  • URL: http://sendou.kuma-u.jp/research/fujita.html
• [Remarks]
  • URL: http://sendou.kuma-u.jp/research/fujita.html