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Development of Point of Care Testing for Infectious Diseases Based on DNA Walkers with Precisely Designed Nanoparticles

Research Project

Project/Area Number 20H02589
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 28050:Nano/micro-systems-related
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

Oishi Motoi  筑波大学, 数理物質系, 准教授 (90419242)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥18,070,000 (Direct Cost: ¥13,900,000、Indirect Cost: ¥4,170,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2020: ¥10,400,000 (Direct Cost: ¥8,000,000、Indirect Cost: ¥2,400,000)
Keywords金ナノ粒子 / ナノ界面 / DNA ナノマシン / 診断 / 感染症 / DNA / ナノマシン / ナノ粒子
Outline of Research at the Start

これまでウイルスおよび細菌を病原体とする感染症を迅速かつ高感度で「その場」診断できるシステムがないのが現状である。本研究の概要は、申請者が独自に開発した「ナノ界面構築法」によりポリエチレングリコール(PEG)とDNAを共固定することでDNAのハイブリダイゼーション能を100%引き出したDNA/PEG化金ナノ粒子を精密に調製し、DNA鎖交換反応を介して標的核酸が(粒子間ではなく)同じ粒子内の界面のみを歩くように高速移動するDNAウォーカーを構築し、かつ感染症由来の核酸を目視にて「その場」検出できるシステムを開発する研究である。

Outline of Final Research Achievements

The purpose of this study is to precisely prepare DNA/PEGylated gold nanoparticles in which polyethylene glycol (PEG) and DNA are co-immobilized by the "nano-interface construction method" originally developed by me and to construct DNA walkers in which target nucleic acids move only at the interface in the same particle via DNA strand exchange reaction, and that can detect nucleic acids of infectious origin. In this study, I established a long-term storage method for DNA/PEGylated gold nanoparticles, which is the key to this research, and prepared DNA/PEGylated gold nanoparticles with various interface structures to clarify the correlation between the interface structure and DNA walking. In addition, optimized DNA walkers were used to detect target nucleic acids.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、様々な分野で用いられているDNA化金ナノ粒子(DNA/PEG化金ナノ粒子を含む)の長期保存法を初めて確立した。これにより、ナノ診断およびナノバイオテクノロジーの分野におけるDNA化金ナノ粒子の応用が今まで以上に展開されると思われる。また、本研究では、DNA/PEG化金ナノ粒子の界面構造(特にDNA密度)とDNAウォーキングの相関、および標的核酸の検出能の相関を明らかにすることができた。これにより、今後、感染症を迅速かつ高感度で「その場」診断できるシステムの開発が可能となると思われる。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Journal Article] Long-term Cryopreservation of Ready-to-Use DNA-Modified Gold Nanoparticle Derivatives: Effect of Preservation Temperature on Their DNA Dissociation and Functional Stability2022

    • Author(s)
      Shotaro Juji and Motoi Oishi
    • Journal Title

      Bulletin of the Chemical Society of Japan

      Volume: 95 Issue: 3 Pages: 410-412

    • DOI

      10.1246/bcsj.20210437

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Acceleration of DNA Hybridization Chain Reactions on 3D Nano-interfaces of Magnetic Particles and Their Direct Application in the Enzyme-Free Amplified Detection of microRNA2021

    • Author(s)
      Motoi Oishi and Shotaro Juji and
    • Journal Title

      ACS Applied Materials & Interfaces

      Volume: 13 Issue: 30 Pages: 35533-35544

    • DOI

      10.1021/acsami.1c09631

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] DNAバルジループ構造の導入によりバックグラウンドを低減させたDNAサーキットの構築2022

    • Author(s)
      菅原匠、大石基
    • Organizer
      第82回分析化学討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] バルジループを導入した DNA サーキットの最適化と酵素フリー な核酸検出2022

    • Author(s)
      菅原匠、大石基
    • Organizer
      分析化学会第71年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 核酸の 1 分子検出を目指した DNA 化金ナノ 粒子固定化ガラス基板の調製と評価2022

    • Author(s)
      木佐木大希 、大石基
    • Organizer
      第12回CSJ化学フェスタ2022
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Au-S結合によってDNAを修飾した金ナノ粒子誘導体の 長期保存における安定性の評価2021

    • Author(s)
      十字祥太郎、大石基
    • Organizer
      日本分析化学会第70年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Point of Care Testing (POCT) for Nucleic Acids at Room Temperature & without Enzymes2020

    • Author(s)
      Motoi Oishi
    • Organizer
      BioJapan 2020 in Yokohama
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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