| Project/Area Number |
20H03243
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
|
| Allocation Type | Single-year Grants |
|---|
| Section | 一般 |
|---|
| Review Section |
Basic Section 43060:System genome science-related
|
|---|
| Research Institution | Kyushu University |
|---|
Principal Investigator |
|
|---|
| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
|
| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
|
| Budget Amount *help |
¥17,680,000 (Direct Cost: ¥13,600,000、Indirect Cost: ¥4,080,000)
Fiscal Year 2022: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2020: ¥7,540,000 (Direct Cost: ¥5,800,000、Indirect Cost: ¥1,740,000)
|
|---|
| Keywords | DNAメチル化 / エピジェネティクス / ヒストン翻訳後修飾 / 次世代シークエンサー / マルチオミクス解析 / メチル基転移酵素 / エピゲノム / シークエンシング / ライブラリー調製 / DNAメチル基転移酵素 / メチローム / エンコーディング / シングルセル解析 |
|---|
| Outline of Research at the Start |
単一細胞を対象としたオーミクス解析が進展し、複数のデータセットを同一の細胞から取得することが可能になってきた。しかし、多種多様な解析対象があるエピゲノム解析においては、複数のデータセットを同時に取得することは未だに困難である。そこで本研究はメチローム解析技術をエピゲノム解析のための共通プラットフォームとして用い、複数のエピゲノム情報を単一細胞から同時に取得する手法を実現する。特定の分子やその翻訳後修飾状態を認識して近傍の特定のDNA配列に対してメチル基を導入する人工分子を作成することで、DNAに対してDNAメチル化としてエピゲム情報を記録する技術を確立する。
|
| Outline of Final Research Achievements |
To establish a technique for detecting multiple epigenomes using DNA methylation footprinting, we first established multiple methyltransferases (MTases) of different recognition sequences. Then, by adapting the SpyTag-SpyCatcher system, we established a technology for connecting an antibody with an MTase. In addition, we have developed a technique for efficiently recovering high-quality DNA from formalin-fixed tissues. Furthermore, we have also developed a technique for recovering naturally paired heavy and light chains of IgGs from B cells derived from pre-immuned animals with the target epigenome as an antigen.
|
| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
エピゲノムによるゲノムの発現制御にはさまざまな層の分子が関与しており、それぞれの連関が重要であると認識されている。しかし、一つのクロマチン分子上の複数層のエピゲノムがどのように配置されているのかをゲノム規模に分析するため手法は現時点では確立されていない。本研究ではDNAメチル化フットプリンティングを基盤として、認識配列の重ならない複数のメチル基転移酵素を用いて、同時に複数のエピゲノムを計測するためのユニークな技術開発を行ってきた。この技術が完成すれば、複数層のエピゲノムを関連付けてより深くゲノムの発現制御を理解することが可能になるだろうと考えられる。
|
