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Elucidation of deposition modeling mechanism responsible for bacterial microtube formation

Research Project

Project/Area Number 20K05846
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38040:Bioorganic chemistry-related
Research InstitutionYokohama National University

Principal Investigator

Takeda Minoru  横浜国立大学, 大学院工学研究院, 教授 (40247507)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Keywords有鞘細菌 / 構造形成多糖 / チオペプチドグリカンリアーゼ / ヒアルロン酸リアーゼ / Sphaerotilus montanus / マイクロチューブ / アセチル化 / 多様性 / 微細造形 / 多糖
Outline of Research at the Start

有鞘細菌は、糸状に連なった細胞列を包み込むマイクロチューブ(鞘)を形成する特徴を持つ細菌である。そして、それらの鞘は多数の細胞の連携によって細胞外で形成される秩序だった微細構造体である。鞘は末端で伸長するものと全域で伸長するものの二種類に大別できる。本研究では、積層造形方式の3Dプリンターのように末端で伸長する鞘を持つSphaerotilus属を主な研究対象とする。そして、鞘の形成(鞘形成高分子の不溶化)への細胞外酵素の関与を想定しつつ鞘形成機構の解明を目指す。得られる知見は、生物模倣による新規な微細立体造形技術の確立への素地となると期待される。

Outline of Final Research Achievements

The aim of this study was to get an idea of a new microfabrication technique using polysaccharide-based polymers from aquatic bacteria that form microtubes outside the cell. The target for investigation was a type of microtubes that extends at the end. This type of microtube was thought to consist of sugars and amino acids, but a new finding suggests that it is also possible to assemble a microtube with a polymer only composed of sugars. It was also suggested that a balance of negative and positive charges should be established for microtube formation. It was also confirmed that the microtubule-degrading enzyme has a unique specificity. In addition, a microtube-forming bacterium probably represents a novel taxon was found in a wastewater treatment plant.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、細菌による菌体外でのマイクロチューブを形成に関して研究を行い、下記の学術的成果を得た。すわなち、マイクロチューブ形成には高分子間の静電的相互作用が重要であることを明らかにした。また、マイクロチューブ分解酵素が新しい種類の酵素である可能性を示した。さらに、新規な有鞘細菌を発見した。そして、下記のような波及効果が期待される。マイクロチューブ形成細菌は排水処理の根幹を成す活性汚泥の沈降性悪化との関連が知られており、マイクロチューブ形成機構の理解は対処法を立案にあたって有意義である。ナノテクノロジーの分野では、水中での微細造形手法の開発に展開できる可能性がある。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Gwangju University(韓国)

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Journal Article] A heterodimeric hyaluronate lyase secreted by the activated sludge bacterium<i>Haliscomenobacter hydrossis</i>2022

    • Author(s)
      Mori Tomomi、Masuzawa Nozomi、Kondo Keiko、Nakanishi Yuta、Chida Shun、Uehara Daiki、Katahira Masato、Takeda Minoru
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 87 Issue: 3 Pages: 256-266

    • DOI

      10.1093/bbb/zbac207

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural determination of the sheath-forming polysaccharide of Sphaerotilus montanus using thiopeptidoglycan lyase which recognizes the 1,4 linkage between α-d-GalN and β-d-GlcA2021

    • Author(s)
      Kashiwabara Daisuke、Kondo Keiko、Usami Ryoji、Kan Daisuke、Kawamura Izuru、Kawasaki Yuta、Sato Michio、Nittami Tadashi、Suzuki Ichiro、Katahira Masato、Takeda Minoru
    • Journal Title

      International Journal of Biological Macromolecules

      Volume: 183 Pages: 992-1001

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2021.05.001

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 微好気環境を好む新規な有鞘細菌の単離と分類学的特徴付け2022

    • Author(s)
      成原栞、萩尾葵、秋本凌輔、武田穣
    • Organizer
      第74回日本生物工学会大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Functionalization of amino sugar-containing polysaccharides using environmental microbes2021

    • Author(s)
      Hiroki Morita, Keiko Kondo, Shun Chida, Masato Katahira, Minoru Takeda
    • Organizer
      The 12th International Symposium of Advanced Energy Science
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 脱N-アセチル化された両性多糖に特異的な新規多糖リアーゼ2021

    • Author(s)
      武田 穣、宇佐美 亮児、柏原 大輔、近藤 敬子、片平 正人
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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