Analysis of natural reservoir of Escherichia albertii, an emerging zoonotic pathogen
Project/Area Number |
20K06396
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Section | 一般 |
Review Section |
Basic Section 42020:Veterinary medical science-related
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Research Institution | Osaka Metropolitan University (2022) Osaka Prefecture University (2020-2021) |
Principal Investigator |
日根野谷 淳 大阪公立大学, 大学院獣医学研究科, 准教授 (20548490)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
山崎 伸二 大阪公立大学, 生命環境科学研究科, 教授 (70221653)
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Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
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Keywords | Escherichia albertii / アライグマ / 自然宿主 / Eacdt / stx2 / 志賀毒素 / 野生動物 / アルバーティ細菌 / 新興人獣共通感染症菌 |
Outline of Research at the Start |
本研究では、新興人獣共通感染症細菌Escherichia albertiiの自然界での動態およびヒトへの感染経路の解明、延いては本菌の感染予防法の構築に寄与すべく、野生動物、特にアライグマが自然宿主である可能性について分子疫学研究により評価する。具体的には、①アライグマにおけるE. albertiiの保菌調査を行う。また、保菌率とアライグマの個体情報(季節性、地域性、性差、年齢)との関係性を解析する。②アライグマ分離株と、ヒト臨床分離株の細菌学的特徴を比較解析する。③高病原性が予想される株は動物感染モデルでの評価も加えて、それらの病原性も調べる。
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Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、アライグマが新興人獣共通感染症細菌Escherichia albertiiの自然宿主の1つとなっているかどうか評価することを目的としており、大阪府で捕獲されたアライグマを対象に本菌の分子疫学研究を行っている。昨年度まで未実施であった解析を加えると、アライグマは調査年度、生息地域、性別、年齢 (成体か子供で区別) に関係なく安定して高率に本菌を保菌していることが明らかになった。また、被検材料として用いている直腸スワブであるため正確な検査便重量は算出できないものの、本菌特異的real time-PCRで定量検出したところ、アライグマの中にはsuper shedder (>10^4個以上/g糞便) に該当する個体が多数存在することも確認できた。一方、複数種のE. albertii が分離される個体も認められため、E. albertiiの混合感染 (個体内多様性) についても調べた。一部の個体について、個体あたり最大75株のE. albertii を分離し、分離株のタイピングを行ったところ、調べた個体の4割程度で2種類以上の遺伝子型を示すE. albertii が同定された。分離株の細菌学的性状としては、いずれの分離株も多剤耐性株はなく、調べた抗菌薬に感受性であった。病原遺伝子としては、臨床分離株と同様にeae陽性で、一部の菌株はEccdt-Iやstx2陽性であった。PFGEによる分離株の系統解析では、アライグマは多様なE. albertii を保菌し、一部では個体間で同一のパルソタイプを示す菌株も認められた。これらの結果は、アライグマがE. albertii を保菌・維持する自然宿主の1つであり、何らかの経路を介してヒトへの感染源となりうる重要な保菌動物である可能性を示していると考えられた。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
2022年度は、前年度末に採取した検体からのE. albertii の分離、分離株の細菌学的性状解析および遺伝学的系統解析を予定していた。分離および細菌学的性状解析は予定通り実施し、データを取得できた。一方、菌株の遺伝学的系統解析については一部の菌株でPFGEを実施できていない状況で、全ゲノムシークエンスに基づく系統解析も終えることができなかった。今年度も引き続き新型コロナウイルス感染症により教育研究業務に大きな影響が出たことが原因で、上記の予定していた内容を完遂することができなかった。これらのことから本研究の進捗状況を「やや遅れている」と判断した。また、国際学会での成果発表を見送ったことも含めて、予算にも余剰金が生じることとなった。
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Strategy for Future Research Activity |
前年度までに完遂できなかったパルスフィールドゲル電気泳動による分離株のタイピングおよび遺伝学的系統解析を優先的に実施する。また、新たに得られた臨床分離株、その他の分離株についても同様に解析を行う。その中から選抜した菌株については全ゲノムシークエンスを取得し、より高解像度にアライグマ保有株およびヒト臨床分離株の特徴を解析する。これらにより、アライグマの自然宿主およびヒトへの感染源としての重要性を評価する。
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Report
(3 results)
Research Products
(21 results)
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[Journal Article] Detection, Isolation, and Molecular Characterization of <i>Escherichia albertii</i> from Wild Birds in West Japan2022
Author(s)
Hinenoya Atsushi, Awasthi Sharda Prasad, Yasuda Noritomo, Nagano Keigo, Hassan Jayedul, Takehira Keiji, Hatanaka Noritoshi, Saito Shun, Watabe Takashi, Yoshizawa Miki, Inoue Haruna, Yamasaki Shinji.
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Journal Title
Japanese Journal of Infectious Diseases
Volume: 75
Issue: 2
Pages: 156-163
DOI
NAID
ISSN
1344-6304, 1884-2836
Year and Date
2022-03-31
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Piperine, an active ingredient of white pepper, suppresses the growth of multidrug‐resistant toxigenic Vibrio cholerae and other pathogenic bacteria.2022
Author(s)
Manjunath G.B., Awasthi S.P., Zahid M.S.H., Hatanaka N., Hinenoya A., Iwaoka E., Aoki S., Ramamurthy T., Yamasaki S.
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Journal Title
Letters in Applied Microbiology
Volume: 74
Issue: 4
Pages: 472-481
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Identification of a recently dominant sublineage in Salmonella 4,[5],12:i:- sequence type 34 isolated from food animals in Japan.2021
Author(s)
Arai Nobuo, Sekizuka Tsuyoshi, Tamamura-Andoh Yukino, Barco Lisa, Hinenoya Atsushi, Yamasaki Shinji, Iwata Taketoshi, Watanabe-Yanai Ayako, Kuroda Makoto, Akiba Masato, Kusumoto Masahiro.
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Journal Title
Frontiers in Microbiology
Volume: 12
Pages: 690947-690947
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Prevalence of mobile colistin resistance (mcr) genes in extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli isolated from retail raw foods in Nha Trang, Vietnam.2021
Author(s)
Le Phong Quoc, Awasthi Sharda Prasad, Hatanaka Noritoshi, Hinenoya Atsushi, Hassan Jayedul, Ombarak Rabee Alhossiny, Iguchi Atsushi, Tran Nga Thuy Thi, Dao Khanh Van Thi, Vien Mai Quang, Le Huy Xuan, Do Hung Thai, Yamamoto Yoshimasa, Yamasaki Shinji.
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Journal Title
International Journal of Food Microbiology
Volume: 346
Pages: 109164-109164
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Prevalence, serovar, and antimicrobial resistance of nontyphoidal Salmonella in vegetable, fruit, and water samples in Ho Chi Minh City, Vietnam.2021
Author(s)
Nguyen Dao Thi Anh, Awasthi Sharda Prasad, Hoang Phuong Hoai, Nguyen Phuc Do, Jayedul Hassan, Hatanaka Noritoshi, Hinenoya Atsushi, Van Dang Chinh, Faruque Shah M., Yamasaki Shinji.
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Journal Title
Foodborne Pathogens and Disease
Volume: 18
Issue: 5
Pages: 354-363
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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