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Elucidating a novel patterning mechanism regulated by EPFL2 peptide

Research Project

Project/Area Number 20K15807
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 44020:Developmental biology-related
Research InstitutionYokohama City University

Principal Investigator

Tameshige Toshiaki  横浜市立大学, 木原生物学研究所, 特任助教 (20725006)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords植物発生学 / 形態形成 / 葉 / オーキシン / ペプチド
Outline of Research at the Start

植物ホルモンのオーキシンが組織の中で濃淡のパターンを生じることで、葉や根の形成、葉の形態などが制御されており、このパターン形成機構を解明することは植物発生学の中心的課題である。オーキシンを輸送するタンパク質であるPIN1によってパターンが形成されるという機構はよく知られているが、それだけでは説明できない側面もあり、解明が待たれている。本研究ではこの未知のパターン形成機構においてペプチドホルモンであるEPFL2が重要な役割を果たすことに注目し、その詳細を分子生物学実験とコンピュータシミュレーションにより解明する。

Outline of Final Research Achievements

Auxin have multifaceted function in determining developmental patterns of plants. Auxin patterns are thought to be mostly formed through auxin polar transport, while little is known about the patterning mechanisms not directly related to polar transport. In this study, I attempted to elucidate the mechanism of auxin pattern regulation by EPFL2, a peptide conserved in a wide range of plants. I found that loss of the EPFL2 gene function results in abnormalities in the number of serration. The auxin accumulation pattern formed prior to serration formation was also abnormal in terms of the interval length between the peaks. Computational approach revealed that such developmental changes caused by EPFL2 can be explained by a mathematical model.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

植物の形は古来より人の自然観や美意識を形作る上で重要であり続けてきた。植物の形を作る上で主要な働きをする植物ホルモンであるオーキシンは、局所に蓄積し、あるいは蓄積しないことで、濃淡を生み、特定の位置に凹凸などの形態を形成する。そうしたオーキシンのパターンを決める仕組みとして従来知られていなかったEPFL2ペプチドによるメカニズムについて研究を進めた。EPFL2の機能を、分子生物学実験およびコンピュータシミュレーションの観点から解析することで、葉の形態を決めるオーキシンパターンがどのように制御されているのか、新たなレイヤーでの制御があることを明らかにした。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2021

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] The boundary-expressed <i>EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-LIKE2</i> gene encoding a signaling peptide promotes cotyledon growth during <i>Arabidopsis thaliana</i> embryogenesis2021

    • Author(s)
      Fujihara Rina、Uchida Naoyuki、Tameshige Toshiaki、Kawamoto Nozomi、Hotokezaka Yugo、Higaki Takumi、Simon Rudiger、Torii Keiko U、Tasaka Masao、Aida Mitsuhiro
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 38 Issue: 3 Pages: 317-322

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.21.0508a

    • NAID

      130008091603

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • Year and Date
      2021-09-25
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] An Affordable Image-Analysis Platform to Accelerate Stomatal Phenotyping During Microscopic Observation2021

    • Author(s)
      Toda Yosuke、Tameshige Toshiaki、Tomiyama Masakazu、Kinoshita Toshinori、Shimizu Kentaro K.
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 12

    • DOI

      10.3389/fpls.2021.715309

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 気孔のハイスループット計測システムの開発とコムギ気孔形質2021

    • Author(s)
      爲重 才覚
    • Organizer
      超分野植物科学研究会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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