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Research on the molecular mechanisms of the heterophylly of an aquatic plant Callitriche palustris

Research Project

Project/Area Number 20K15816
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Hiroyuki Koga  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (30783865)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords水草 / ミズハコベ / 異形葉性 / 新規ゲノム解析 / アワゴケ属 / イケノミズハコベ / アメリカアワゴケ
Outline of Research at the Start

植物はしばしば、環境によって異なる形の葉を作る能力、異形葉性を備えている。とくに水辺に育成する被子植物(水草)には、陸生時と沈水時で著しく異なる形の葉を作る種が多く知られているが、そのメカニズムはほとんどわかっていない。そこで本研究では水草の葉の示す顕著な表現型可塑性、異形葉性の詳細な分子機構を解明することを目的とする。本研究では、オオバコ科の水草、ミズハコベをモデルとして、異形葉性を制御する植物ホルモンの下流因子と、異形葉の各表現型と関連のある遺伝子群の特定から、本種で異形葉性を制御する遺伝子ネットワークの概容、そしてその特異性を明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

Plants often have the ability to produce various leaf shapes depending on their environment, which is called heterophylly. In particular, many aquatic plants can form leaves with significantly different shapes when grown on land or submerged in water. However, the mechanisms underlying this phenomenon are poorly understood. In this study, we aimed to elucidate the detailed molecular mechanisms of heterophylly and conducted research using the aquatic plant, Callitriche palustris (Plantaginaceae). We have analyzed the molecular mechanisms of this species, focusing on genomic and transcriptomic perspectives. We also established a transformation system for closely related species to improve the research infrastructure.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

水草の進化とそれに伴う異形葉性の進化は、様々な系統で独立に起こっており、多様な系統で異形葉性のメカニズムを明らかにすることで、収斂進化の背景にある生物進化の一般性や創造性の本質へアプローチできる。これまで、いくつかの系統の水草で異形葉性の分子メカニズムが調べられてきたが、本研究で、ミズハコベの異形葉性はそのいずれとも異なる性質があることがわかった。今回、ゲノムの解析基盤が整ったことによって、さらにゲノム科学的な観点から水草の可塑性の進化の仕組みを調べることが出来るようになった。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (36 results)

All 2023 2022 2021 2020 Other

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 5 results) Presentation (24 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results) Remarks (5 results)

  • [Journal Article] Oxicam-type nonsteroidal anti-inflammatory drugs enhance <i>Agrobacterium</i>-mediated transient transformation in plants2022

    • Author(s)
      Choi Seung-won、Kumaishi Kie、Motohashi Reiko、Enoki Harumi、Chacuttayapong Wiluk、Takamizo Tadashi、Saika Hiroaki、Endo Masaki、Yamada Tetsuya、Hirose Aya、Koizuka Nobuya、Kimura Seisuke、Kawakatsu Yaichi、Koga Hiroyuki、Ito Emi、Shirasu Ken、Ichihashi Yasunori
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 39 Issue: 3 Pages: 323-327

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.22.0312a

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • Year and Date
      2022-09-25
    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Looking beyond the gene network ? metabolic and mechanical cell drivers of leaf morphogenesis2022

    • Author(s)
      Nakayama Hokuto、Koga Hiroyuki、Long Yuchen、Hamant Olivier、Ferjani Ali
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 135 Issue: 8

    • DOI

      10.1242/jcs.259611

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    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification of the unique molecular framework of heterophylly in the amphibious plant <i>Callitriche palustris</i> L2021

    • Author(s)
      Koga Hiroyuki、Kojima Mikiko、Takebayashi Yumiko、Sakakibara Hitoshi、Tsukaya Hirokazu
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 33 Issue: 10 Pages: 3272-3292

    • DOI

      10.1093/plcell/koab192

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Callitriche as a potential model system for evolutionary studies on the dorsiventral distribution of stomata2021

    • Author(s)
      Doll Yuki、Koga Hiroyuki、Tsukaya Hirokazu
    • Journal Title

      Plant Signaling & Behavior

      Volume: 16 Issue: 11 Pages: 1978201-1978201

    • DOI

      10.1080/15592324.2021.1978201

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  • [Journal Article] The diversity of stomatal development regulation in Callitriche is related to the intrageneric diversity in lifestyles2021

    • Author(s)
      Doll Yuki、Koga Hiroyuki、Tsukaya Hirokazu
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 118 Issue: 14

    • DOI

      10.1073/pnas.2026351118

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  • [Journal Article] Expression Profiles of ANGUSTIFOLIA3 and SHOOT MERISTEMLESS, Key Genes for Meristematic Activity in a One-Leaf Plant Monophyllaea glabra, Revealed by Whole-Mount In Situ Hybridization2020

    • Author(s)
      Kinoshita Ayaka、Koga Hiroyuki、Tsukaya Hirokazu
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 11 Pages: 1160-1160

    • DOI

      10.3389/fpls.2020.01160

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  • [Journal Article] The molecular framework of heterophylly in Callitriche palustris L. differs from that in other amphibious plants2020

    • Author(s)
      Koga Hiroyuki、Kojima Mikiko、Takebayashi Yumiko、Sakakibara Hitoshi、Tsukaya Hirokazu
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2020.12.19.423571

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  • [Presentation] Multi-platform widely-targeted metabolomics identified candidate metabolites with a potential role in cell number and size coordination during leaf morphogenesis2023

    • Author(s)
      Hiromitsu Tabeta, Hiroyuki Koga, Muneo Sato, Shizuka Gunji, Hirokazu Tsukaya, Masami Yokota Hirai, Ali Ferjani
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      第64回日本植物生理学会年会
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      Yuki Doll, Hiroyuki Koga, Hirokazu Tsukaya
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  • [Presentation] Shapeshifting in the leaf of an amphibious plant Callitriche palustris2022

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      Hiroyuki Koga, Doll Yuki, Hirokzazu Tsukaya
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      the 32rd International Conference on Arabidopsis Research
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  • [Presentation] 水草ミズハコベの異質倍数性ゲノムとその進化2022

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      古賀皓之、ドル有生、塚谷裕一
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      ドル有生、古賀皓之、塚谷裕一
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      日本進化学会年大会 第24回沼津大会
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  • [Presentation] 水草アワゴケ属のユニークな自家受精様式 「内性隣花受精」の形態学的観察2022

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      八廣遥斗,塚谷裕一,古賀皓之
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      日本植物形態学会第 34 回大会
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  • [Presentation] アワゴケ属陸生種のシュート再生の条件検討2022

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      上村智稀,古賀皓之,塚谷裕一
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      日本植物形態学会第 34 回大会
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  • [Presentation] 鍵転写因子の発現パター ン変化は気孔発生様式の多様性を生み出せるか?2022

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      ドル 有生、古賀 皓之、塚谷 裕 一
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      日本植物学会第86回大会
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  • [Presentation] hope-1 変異体の胚軸における遺伝学およびオミクス解析を駆使した分化維持機構の解明2022

    • Author(s)
      白鳥みづき, 高橋和希, 多部田弘光, 古賀皓之, 郡司玄, 佐藤心朗, 堀口吾朗, 平井優美, 塚谷裕一, フェルジャニアリ
    • Organizer
      植物生理学会 第63回大会
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  • [Presentation] 葉の無限成長を可能にする細胞分裂活性維持機構の解析2022

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      森山安武,古賀皓之,塚谷裕一
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      植物生理学会 第63回大会
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  • [Presentation] set 変異は de-etiolated3-1 変異体の矮化及び暗所での光形態形成を抑制する2022

    • Author(s)
      木津亮介, 橋本玲奈, 郡司玄, 古賀晧之, 光田展隆, 花井研哉, 堀口吾朗, 澤進一郎, 塚谷裕一, Ali Ferjani
    • Organizer
      植物生理学会 第63回大会
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  • [Presentation] 水草ミズハコベのゲノム解析2021

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      古賀皓之, ドル有生, 塚谷裕一
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
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  • [Presentation] 水草ミズハコベ水中葉における気孔系譜の樹立抑制2021

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      ドル有生, 古賀皓之, 塚谷裕一
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      日本植物学会第85回大会
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  • [Presentation] de-etiolated3 の矮化を抑圧する変異体の遺伝学的解析2021

    • Author(s)
      木津亮介, 郡司玄, 古賀晧之, 堀口吾朗, 光田展隆, 塚谷裕一, フェルジャニアリ
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
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  • [Presentation] アワゴケ属植物でみつかった気孔発_様式の多様性2021

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      古賀 皓之
    • Organizer
      _本植物形態学会第 33 回総会・_会
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    • Invited
  • [Presentation] Dimorphic leaf development in the aquatic plant Callitriche palustris2021

    • Author(s)
      Hiroyuki Koga
    • Organizer
      新学術領域研究 「植物の周期と変調」国際ウェビナーシリーズ「From Cellular Dynamics to Morphology II」
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Different Expression Patterns of the Key Transcription Factors Underlie the Diverse Patterns of Stomatal Development in the Genus Callitriche (アワゴケ属における気孔発生様式の多様性を生み出す鍵転写因子の発現パターン)2021

    • Author(s)
      ドル 有生、古賀 皓之、塚谷 裕一
    • Organizer
      植物生理学会 第62回大会
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  • [Presentation] Ectopic auxin accumulation and subsequent activation of cell cycling trigger spontaneous callus formation on hope-1 mutant hypocotyls (hope-1 変異体の胚軸上に自発的に生じるカルスは異所的なオーキシンの蓄積とそれに伴う細胞分裂の活性化によって引き起こされる)2021

    • Author(s)
      白鳥 みづき、高橋 和希、多部田 弘光、古賀 皓之、郡司 玄、堀口 吾郎、平井 優美、塚谷 裕一、Ali Ferjani
    • Organizer
      植物生理学会 第62回大会
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] A Novel Transcriptional Network that Underpins Stem Structural and Mechanical Integrity by Regulating Radial Cell Growth (花茎の整合性維持を担う転写因子群に関する形態学的およびトランスクリプトーム解析)2021

    • Author(s)
      浅岡 真理子、坂本 真吾、古賀 皓之、郡司 玄、光田 展隆、塚谷 裕一、澤 進一郎、Olivier Hamant、Ali Ferjani
    • Organizer
      植物生理学会 第62回大会
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  • [Presentation] Investigation of molecular mechanisms which enable indeterminate growth of compound leaves in genera Guarea and Chisocheton (Guarea属やChisocheton属における複葉無限成長の分子機構の解析)2020

    • Author(s)
      森山 安武、塚谷 裕一、古賀 皓之
    • Organizer
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      2020 Research-status Report
  • [Presentation] Comparative transcriptomic approaches toward understanding the evolution of a drastic phenotypic plasticity of leaf in amphibious plants2020

    • Author(s)
      Koga H.
    • Organizer
      JSDB Online Trial Meeting
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 水草ミズハコベの水没に応答した気孔分化抑制におけるABAの役割2020

    • Author(s)
      ドル 有生、古賀 皓之、塚谷 裕一
    • Organizer
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  • [Remarks] 水陸両生の水草ミズハコベが姿を変える仕組みを解明

    • URL

      https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2021/7443/

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  • [Remarks] 無限成長する葉の不思議な性質を発見

    • URL

      https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2020/6972/

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  • [Remarks] 植物の「暮らし」によって気孔の作り方が違う仕組みを解明

    • URL

      https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2021/7287/

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      2020 Research-status Report
  • [Remarks] Researchers notice pattern on surface of leaves

    • URL

      https://www.u-tokyo.ac.jp/focus/en/press/z0508_00170.html

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  • [Remarks] 葉1枚だけで育ち続ける植物 基部の遺伝子発現に秘密

    • URL

      https://www.asahi.com/articles/ASNBG3FX4N8YULBJ003.html

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      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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