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Structural and functional analyses of putative anitioxidant-related proteins from tardigrades

Research Project

Project/Area Number 20K15971
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 47020:Pharmaceutical analytical chemistry and physicochemistry-related
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

Yohta Fukuda  大阪大学, 薬学研究科, 助教 (20783179)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
KeywordsX線結晶構造解析 / 乾眠 / クマムシ / 構造生物化学
Outline of Research at the Start

本研究の目的は、乾燥耐性を持つクマムシに固有な酸化ストレス耐性関連タンパク質の構造と機能をつまびらかにし、酸化ストレス耐性の分子基盤に関する知見を得ることである。クマムシの多くは、乾眠とよばれる状態になることで乾燥に耐え、高放射線量環境下でも生存できる。極度の乾燥状態や高放射線量環境下では細胞が活性酸素種による酸化ストレスにさらされるが、クマムシの酸化ストレス耐性の分子基盤は明らかになっていない。本研究では、主として構造生物化学的手法を用いて、乾燥耐性を持つクマムシに固有な抗酸化関連タンパク質の構造と機能を明らかにし、クマムシの驚異的なストレス耐性の秘密の一端をひもとくことを目指す。

Outline of Final Research Achievements

The aim of this study is structural and functional analyses of tardigrade proteins that are probably related to oxidative stress tolerances. X-ray crystallographic analysis was performed on a tardigrade protein whose expression level is known to increase under desiccated conditions. Although not planned at the time of application, we performed X-ray crystallographic analysis, spectroscopic measurements, and activity measurements of another protein from tardigrades, which is structurally similar to a protein that is thought to be involved in the removal of reactive oxygen species in prokaryotes.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

これまで立体構造的特性が不明であったクマムシ由来のタンパク質の構造を明らかにした。構造が決定されたクマムシタンパク質は、配列相同性からは既知のタンパク質とは異なると目されたが、構造的な類似性からは既知タンパク質と似た機能があると推定され、実際に銅用の生化学的特性を示すことが明らかになった。これはクマムシタンパク質は決して変わり者ではなく、ごく一般的な生物学的枠組みの一部であることを示しており、これらをクマムシの細胞外(例えばヒトなど)で応用するための一歩になったとも考えられる。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2021 2020

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results)

  • [Journal Article] Fast autooxidation of a bis-histidyl-ligated globin from the anhydrobiotic tardigrade,Ramazzottius varieornatus, by molecular oxygen2021

    • Author(s)
      Kobayashi Kazuo、Kim JeeEun、Fukuda Yohta、Kozawa Takahiro、Inoue Tsuyoshi
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: - Issue: 6 Pages: 663-673

    • DOI

      10.1093/jb/mvab003

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural insights into a C2 domain protein specifically found in tardigrades2020

    • Author(s)
      Fukuda Yohta、Inoue Tsuyoshi
    • Journal Title

      Protein Science

      Volume: 30 Issue: 2 Pages: 513-518

    • DOI

      10.1002/pro.4002

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structure of cytochromeb5unique to tardigrades2020

    • Author(s)
      Fukuda Yohta、Kim JeeEun、Inoue Tsuyoshi
    • Journal Title

      Protein Science

      Volume: 29 Issue: 8 Pages: 1829-1835

    • DOI

      10.1002/pro.3896

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2023-01-30  

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