• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Identification of functional domain of MALAT1 lncRNA in heat shock response

Research Project

Project/Area Number 20K15988
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 47030:Pharmaceutical hygiene and biochemistry-related
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Onoguchi Rena  東京大学, アイソトープ総合センター, 特任助教 (30780697)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords長鎖非コードRNA / 核内構造体 / 非コードRNA / 熱ストレス応答
Outline of Research at the Start

申請者はこれまでに通常は核スペックルと呼ばれる核内構造体に局在するMALAT1非コードRNAが、熱ストレスに応答して新規核内構造体HiNoCo-bodyを形成すること、MALAT1が熱ストレス時の細胞生存に必要であることを世界に先駆けて発見した。本研究ではMALAT1の機能配列を同定し、各機能配列に結合するタンパク質を網羅的に解析することで、通常条件と熱ストレス条件のMALAT1の機能ドメインを明らかにすることを目的とする。本研究を通じて「MALAT1が局在を変化させる過程で複数の機能配列を使い分けることにより、細胞の状態変化に迅速に適応する」という熱ストレス応答の新しいモデルの提唱を目指す。

Outline of Final Research Achievements

MALAT1, one of the most abundant and highly conserved long noncoding RNAs, is thought to be critical regulator of cancer progression. In our recent study, we found that heat shock stress induced translocation of MALAT1 from nuclear speckle, one of nuclear bodies, to a distinct nuclear body named HiNoCo body. However, specific RNA domains dictating HiNoCo body formation in heat shock response remain unknown. In this study, we established the cell lines which express the several kinds of deletion mutants of MALAT1 and investigated their localization under heat shock condition. We identified the RNA domain of MALAT1 that is required for localization during heat shock stress.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

機能ドメインの情報が不足している非コードRNAは、タンパク質と異なり一次配列から機能を推定することが困難である。先行研究により、一部の非コードRNAについてはドメイン解析が行われている。MALAT1に関しても核スペックル局在に必要な最小配列は同定されているが、他の領域の機能は不明であった。本研究によって同定された、熱ストレスに応答したMALAT1の局在変化に重要なドメインの情報はこれまでの概念とは異なる非コードRNAによる熱ストレス応答の分子基盤の解明につがなることが期待される。

Report

(3 results)
  • 2022 Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Long noncoding RNA and phase separation in cellular stress response2022

    • Author(s)
      Onoguchi-Mizutani Rena、Akimitsu Nobuyoshi
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 171 Issue: 3 Pages: 269-276

    • DOI

      10.1093/jb/mvab156

    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Journal Article] hnRNPH1-MTR4 complex-mediated regulation of <i>NEAT1v2</i> stability is critical for <i>IL8</i> expression2021

    • Author(s)
      Tanu Tanzina、Taniue Kenzui、Imamura Katsutoshi、Onoguchi-Mizutani Rena、Han Han、Jensen Torben Heick、Akimitsu Nobuyoshi
    • Journal Title

      RNA Biology

      Volume: 18 Issue: sup1 Pages: 537-547

    • DOI

      10.1080/15476286.2021.1971439

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A histone modifier, ASXL1, interacts with NONO and is involved in paraspeckle formation in hematopoietic cells2021

    • Author(s)
      Yamamoto Keita、Goyama Susumu、Asada Shuhei、Fujino Takeshi、Yonezawa Taishi、Sato Naru、Takeda Reina、Tsuchiya Akiho、Fukuyama Tomofusa、Tanaka Yosuke、Yokoyama Akihiko、Toya Hikaru、Kon Ayana、Nannya Yasuhito、Onoguchi-Mizutani Rena、Nakagawa Shinichi、Hirose Tetsuro、Ogawa Seishi、Akimitsu Nobuyoshi、Kitamura Toshio
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 36 Issue: 8 Pages: 109576-109576

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.109576

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification of heat-inducible long noncoding RNA MALAT1-containing novel nuclear (HiNoCo) body2021

    • Author(s)
      Rena Onoguchi-Mizutani , Yoshitaka Kirikae , Yoko Ogura , Tony Gutschner , Sven Diederichs , Nobuyoshi Akimitsu
    • Journal Title

      The journal of Cell Science

      Volume: -

    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Journal Article] Identification of novel heat shock-induced long non-coding RNA in human cells2020

    • Author(s)
      Onoguchi-Mizutani Rena、Kishi Yoshihiro、Ogura Yoko、Nishimura Yuuki、Imamachi Naoto、Suzuki Yutaka、Miyazaki Satoru、Akimitsu Nobuyoshi
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: - Issue: 4 Pages: 497-505

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa126

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 非コードRNAを含有する熱ストレス応答性の新規核内構造体, HiNoCo-bodyの同定2021

    • Author(s)
      小野口玲菜、秋光信佳
    • Organizer
      日本薬学会第141年会(広島)
    • Related Report
      2020 Research-status Report

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi