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Launching platforms for getting new secondary metabolites and revealing mechanism of activating cryptic BGCs

Research Project

Project/Area Number 20K16023
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 47050:Environmental and natural pharmaceutical resources-related
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

Yoshimura Aya  北海道大学, 薬学研究院, 助教 (60866416)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Keywords細胞外膜小胞 / 休眠遺伝子 / 二次代謝産物 / メンブレンベシクル / 休眠生合成遺伝子 / トランスポゾン
Outline of Research at the Start

微生物や植物が作り出す化合物(天然物)は多様な化学構造を持つため医薬品シードとして有用である。最近、ユニークな構造の天然物の取得数は減少しており、多様な構造を持つ天然物群の発見は医薬品開発の重要課題である。近年、微生物のゲノム中には通常の研究室培養条件では発現しない天然物の生合成遺伝子(休眠遺伝子)が多く存在することが明らかになった。休眠遺伝子を覚醒させれば天然物の構造多様性の拡張が期待できる。しかし現在、覚醒方法はほとんどの休眠遺伝子について不明である。本研究ではトランスポゾン変異とメンブレンベシクルを活用して休眠遺伝子を覚醒させ、新たな天然物の取得と覚醒機構の解明を目指す。

Outline of Final Research Achievements

In general, bacterial natural products are biosynthesized from primary metabolites through cascade reactions catalyzed by biosynthetic enzymes encoded in bacterial genomes. Recent significant breakthroughs in sequencing and bioinformatics analyses revealed that bacterial genomes encode many more biosynthetic genes than previously estimated. However, most of them are referred to as cryptic or silent biosynthetic genes that are expressed poorly or not at all in conventional laboratory culture conditions. In this study, we discovered that bacterial membrane vesicles (MVs) can induce natural product production by isolating some natural products from several strains. Moreover, we propose an interbacterial hostile interaction between two distinct Gram-negative bacteria through their own MVs and natural products.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究ではMVsで細菌を刺激することで複数の未開拓天然物を発見した。さらに、MVsと天然物を介した異種細菌間コミュニケーションが存在することを見出し、そのメカニズムを明らかにした。我々が発見した天然物の中にはユニークな生物活性を有する新規天然物が含まれており、それらは創薬シード化合物として期待できる。さらに、MVsと化合物を介して細菌が相互作用することは我々が初めて見出した現象であり、本現象は腸内細菌叢でも見られると予想されることから、MVsと化合物を用いて疾患に関与する細菌を変調させる新たな治療戦略にも資すると期待している。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2023 2022 2021

All Presentation (15 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results)

  • [Presentation] 細菌間相互作用様式の解明を目指した天然物研究2023

    • Author(s)
      吉村彩
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 細菌由来細胞外膜小胞によって生産誘導された抗菌性天然物に関する研究2023

    • Author(s)
      本田拓巳、吉村彩、脇本敏幸
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] LCMSによる細胞外膜小胞が生産誘導する新規天然物の網羅的探索2023

    • Author(s)
      中田隆介、吉村彩、本田拓巳、脇本敏幸
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Studies on natural products induced by bacterial membrane vesicles2022

    • Author(s)
      Aya Yoshimura
    • Organizer
      The 53rd Korean Annual Meeting Society for Pharmacognosy
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 細菌が放出する細胞外小胞による二次代謝産物生産誘導に関する研究2022

    • Author(s)
      吉村彩、佐伯梨緒、中田隆介、冨本将汰、松田研一、脇本敏幸
    • Organizer
      第64回天然有機化合物討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞外小胞が生産誘導する放線菌由来新規抗菌性天然物の探索2022

    • Author(s)
      本田拓巳、吉村彩、中田隆介、松田研一、脇本敏幸
    • Organizer
      第36回日本放線菌学会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 休眠遺伝子活性化による新規抗菌性天然物の取得2022

    • Author(s)
      本田拓巳、 中田隆介、吉村 彩、松田研一、脇本敏幸
    • Organizer
      日本生薬学会第68回年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Xenorhabdus innexi由来天然物と細胞外小胞を介する異種微生物間相互作用メカニズムの解析2022

    • Author(s)
      佐伯梨緒、吉村彩、 脇本敏幸
    • Organizer
      日本生薬学会第68回年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞外小胞によって生産誘導される天然物の網羅的探索2022

    • Author(s)
      中田隆介、吉村彩、脇本敏幸
    • Organizer
      日本生薬学会北海道支部第45回支部例会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 微生物間相互作用により生産誘導される天然物に関する研究2022

    • Author(s)
      佐伯梨緒、吉村彩、脇本敏幸
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 微生物由来メンブレンベシクルが生産誘導する天然物の探索2021

    • Author(s)
      吉村彩、佐伯梨緒、冨本将汰、脇本敏幸
    • Organizer
      第23回 天然薬物の開発と応用シンポジウム
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 細菌の放出する細胞外小胞を利用した休眠遺伝子活性化と新規天然物探索2021

    • Author(s)
      佐伯梨緒、吉村彩、脇本敏幸
    • Organizer
      日本生薬学会第67回年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 細菌が放出する細胞外小胞を利用した休眠遺伝子活性化と新規天然物探索2021

    • Author(s)
      佐伯梨緒、吉村彩、松田研一、脇本敏幸
    • Organizer
      日本薬学会 第141年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 細菌の放出する細胞外小胞を利用した休眠遺伝子活性化と新規天然物探索2021

    • Author(s)
      佐伯梨緒、吉村彩、脇本敏幸
    • Organizer
      第68回 北海道薬学大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report
  • [Presentation] 環境分離株Cryseobacterium属細菌が外部刺激に応答して生産誘導する天然物の単離・構造決定2021

    • Author(s)
      本田拓巳、冨本将汰、Jabal Rahmat Headar、吉村彩、脇本敏幸
    • Organizer
      第68回 北海道薬学大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2024-01-30  

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