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Discovery of pancreatic cancer microenvironments by gene expression mapping and metabolome mapping.

Research Project

Project/Area Number 20K17622
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 55020:Digestive surgery-related
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

TORATA Nobuhiro  九州大学, 大学病院, 臨床検査技師 (00398075)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords遺伝子発現マッピング / メタボロミクスマッピング
Outline of Research at the Start

手術切除標本を用いた研究が行われているが、組織微小環境での位置情報は失われていることが多い。がん細胞だけでなく、免疫細胞やその他の間質細胞の不均一性が、腫瘍の特性や治療抵抗性に関連することが注目されており、局在データの必要性が高まっている。本研究では、RNAをスライドガラス上で捕捉し、組織中の位置情報を持った遺伝子発現解析を実現する10XGENOMICS社のSpatial Transcriptomics技術を用いて、遺伝子発現マッピングを行い、メタボロミクスマッピングと組み合わせることによって、多面的な膵癌組織微小環境の解明し、その制御による新規治療法の開発を目指す。

Outline of Final Research Achievements

To discover of pancreatic cancer microenvironments, correlation between amount of cancer associated fibroblasts(CAF) and pancreatic cancer cell differentiation are analyzed. Positive correlation between cancer cell differentiation and amount of CAF, in which has a potential of cancer cells proliferation, is detected by using human pancreatic cancer organoid assay. Positive correlation between cancer cell differentiation and expression of cholesterol synthesis related genes, especially mevalonate pathway, is also detected by comprehensive gene expression analysis. Additionally, well differentiate pancreatic organoid indicated significant growth suppression by medication of simvastatin which is an inhibitor of HMG-CoA reductase in comparison with poorly differentiated one.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

膵癌は癌の中でもっとも予後不良な癌の一つで、その特徴の一つにdesmoplasiaと呼ばれる豊富な間質増生があり、治療抵抗性や、薬剤送達率低下への関与が明らかにされている。本研究成果は、細胞の相互作用を再現したヒト膵癌オルガノイドを用い、腫瘍微小環境における、腫瘍分化度と癌間質量の関連性を明らかにするだけでなく、cholesterol synthesis関連遺伝子の発現が増加していることを明らかにし、治療ターゲットとしての可能性を見出した点で学術的、社会的意義が高い。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021

All Presentation (9 results)

  • [Presentation] Single cell RNA sequenceを用いたpor2胃癌におけるcancer associated fibroblastのheterogeneityの解明2022

    • Author(s)
      堤親範、大内田研宙、中村祥一、奥田翔、久野恭子、大坪慶志輝、寅田信博、進藤幸治、森山大樹、水内祐介、仲田興平、中村雅史
    • Organizer
      第94回日本胃癌学会総会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 正規表現によるパターンマッチを利用した病理レポート癌取扱い規約因子のデータベース登録2021

    • Author(s)
      寅田信博、水内祐介、大内田研宙、久保真、仲田興平、永井俊太郎、三好圭、岡部安博、小田義直、中村雅史
    • Organizer
      第121回日本外科学会定期学術集会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] scRNA-seqを用いた食道扁平上皮癌におけるCD8+T細胞をとりまく免疫微小環境の解明2021

    • Author(s)
      奥田翔、大内田研宙、大坪慶志輝、寅田信博、進藤幸治、森山大樹、水内祐介、仲田興平、永井俊太郎、中村雅史
    • Organizer
      第76回日本消化器外科学会総会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] scRNA-seqを用いたFAPにおけるfibroblastのheterogeneityの解明2021

    • Author(s)
      久野恭子、水内祐介、大内田研宙、奥田翔、大坪慶志輝、寅田信博、永吉絹子、仲田興平、永井俊太郎、中村雅史
    • Organizer
      第76回日本消化器外科学会総会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] シングルセル解析による食道扁平上皮癌内腫瘍浸潤リンパ球の評価2021

    • Author(s)
      中村祥一、大内田研宙、久野恭子、持田郁己、奥田翔、大坪慶志輝、水内祐介、進藤幸治、仲田興平、森山大樹、永井俊太郎、中村雅史
    • Organizer
      第76回日本消化器外科学会総会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 画像認識による未固定大腸癌切除標本中の病変部検出と腫瘍正常識別および深達度予測2021

    • Author(s)
      寅田信博、大内田研宙、諸岡健一、永井俊太郎、水内祐介、河田純、小田義直、中村雅史
    • Organizer
      第29回日本消化器関連学会週間(JDDW 2021)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Single cell RNA sequenceを用いた家族性大腸腺腫症におけるmacrophageのheterogeneityの解明2021

    • Author(s)
      久野恭子、水内祐介、大内田研宙、中村祥一、奥田翔、大坪慶志輝、佐田政史、永吉絹子、寅田信博、進藤幸治、仲田興平、森山大樹、永井俊太郎、中村雅史
    • Organizer
      第29回日本消化器関連学会週間(JDDW 2021)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Single-cell RNA-sequenceを用いた食道扁平上皮癌の免疫環境についての解析2021

    • Author(s)
      奥田翔、大内田研宙、大坪慶志輝、中村祥一、久野恭子、持田郁己、新川智彦、寅田信博、水内祐介、進藤幸治、森山大樹、仲田興平、中村雅史
    • Organizer
      第29回日本消化器関連学会週間(JDDW 2021)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] シングルセル解析による食道癌内の腫瘍浸潤マクロファージの食作用の評価2021

    • Author(s)
      中村祥一、大内田研宙、奥田翔、大坪慶志輝、寅田信博、水内祐介、進藤幸治、仲田興平、森山大樹、中村雅史
    • Organizer
      第29回日本消化器関連学会週間(JDDW 2021)
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2020-04-28   Modified: 2023-01-30  

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