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Approach toward creating a cytoplasmic male sterility line from a normal cultivar by genome-editing of nuclear genes

Research Project

Project/Area Number 20K21300
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 39:Agricultural and environmental biology and related fields
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

Toriyama Kinya  東北大学, 農学研究科, 教授 (20183882)

Project Period (FY) 2020-07-30 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Keywords育種学 / 遺伝学 / 遺伝子 / ゲノム / 植物 / イネ
Outline of Research at the Start

一代雑種品種は、F1が両親に比べ旺盛な生育を示す性質を利用したもので、その育種に細胞質雄性不稔性(ミトコンドリアゲノムと核ゲノムの相性が悪く花粉が死滅する現象)が使われている。その際、細胞質の遺伝資源が限られているため、既存の品種を利用できる新システムの開発が種苗業界から求められている。本研究では核遺伝子のゲノム編集により、普通の栽培品種から、価値の高い細胞質雄性不稔系統を生み出す技術開発に挑戦する。

Outline of Final Research Achievements

Cytoplasmic male sterility (CMS; the phenomenon of pollen death due to incompatibility between the mitochondrial and nuclear genomes) is used in the breeding of F1 hybrid varieties. In this study, we found that cultivated rice varieties also have a cryptic CMS-causing gene, orf288, in the mitochondrial genome, although it is not manifested due to a nuclear Rf gene that suppress the expression of orf288. We demonstrated that CMS is manifested, when the Rf gene has a deletion. This study demonstrated the possibility of generating CMS lines by nuclear genome editing.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

一代雑種品種は、F1が両親に比べ旺盛な生育を示す性質を利用したもので、市販されているほとんどの野菜、トウモロコシ、ソルガムなどは一代雑種品種であり、その育種に細胞質雄性不稔性(CMS;ミトコンドリアゲノムと核ゲノムの相性が悪く花粉が死滅する現象)が使われている。CMS系統は近縁野生種に栽培種を連続戻し交雑することで育種されてきた。しかし、利用できる近縁野生種が限られており、既存の品種を利用できる新システムの開発が種苗業界から求められている。本研究では標準的な普通の栽培品種から、価値の高いCMS系統を生み出す新システムを開発できる可能性を示した。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 3 results) Book (1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] The mitochondrial and plastid genomes of <i>Oryza sativa</i> L. cv. Taichung 652023

    • Author(s)
      Ichida Hiroyuki、Kazama Tomohiko、Arimura Shin-ichi、Toriyama Kinya
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 40 Issue: 1 Pages: 109-112

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.22.1213a

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • Year and Date
      2023-03-25
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] <scp>TALEN</scp> ‐mediated depletion of the mitochondrial gene <i>orf312</i> proves that it is a Tadukan‐type cytoplasmic male sterility‐causative gene in rice2022

    • Author(s)
      Takatsuka Ayumu、Kazama Tomohiko、Arimura Shin‐ichi、Toriyama Kinya
    • Journal Title

      The Plant Journal

      Volume: 未定 Issue: 4 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1111/tpj.15715

    • Related Report
      2022 Annual Research Report 2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Molecular basis of cytoplasmic male sterility and fertility restoration in rice2021

    • Author(s)
      Toriyama K
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 38 Issue: 3 Pages: 285-295

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.21.0607a

    • NAID

      130008091610

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • Year and Date
      2021-09-25
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 細胞質を日本晴に置換したOryza glaberrimaにおけるミトコンドリア遺伝子orf288の発現解析2023

    • Author(s)
      武田信哉, 五十嵐圭介, 岩井裕子, 鳥山欽哉
    • Organizer
      日本育種学会第143回講演会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 台中65号の細胞質およびアフリカイネの核を持つTG-CMSの原因遺伝子解析とその稔性回復様式の調査2022

    • Author(s)
      武田信哉, 市田裕之, 阿部知子, 有村慎一, 風間智彦, 陳孫禄, 金岡義高, 貴島祐治, 鳥山 欽哉
    • Organizer
      第39回日本植物バイオテクノロジー学会(堺)大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞質雄性不稔性Oryza glaberrimaの解析から明らかとなった日本型イネのミトコンドリアに存在するorf288遺伝子の発現制御2022

    • Author(s)
      武田信哉,市田裕之, 阿部知子, 有村慎一, 風間智彦,陳孫禄, 金岡義高, 貴島祐治, 鳥山欽哉
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 台中65号の細胞質を持つOryza glaberrima のCMS原因遺伝子はorf288か2022

    • Author(s)
      武田信哉, 風間智彦, 鳥山欽哉
    • Organizer
      2021年度国立遺伝学研究所・イネ属近縁野生種研究会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 私もできる植物ゲノム編集―CRISPR-Cas9 と TALEN を用いた遺伝子破壊の研究例―2021

    • Author(s)
      鳥山欽哉
    • Organizer
      園芸学会東北支部令和3年度大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] イネの細胞質雄性不稔性と稔性回復の分子基盤2021

    • Author(s)
      鳥山欽哉
    • Organizer
      日本植物バイオテクノロジー学会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 植物ミトコンドリアゲノム編集技術の開発と細胞質雄性不稔原因遺伝子の同定2021

    • Author(s)
      風間智彦・肥塚信也・鳥山欽哉・堤伸浩・有村慎一
    • Organizer
      日本植物バイオテクノロジー学会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 台中65号の細胞質を持つOryza glaberrimaのCMS関連遺伝子の解析2021

    • Author(s)
      武田信哉, 市田裕之, 阿部知子, 有村慎一, 風間智彦, 陳孫禄, 金岡義高, 貴島祐治, 鳥山欽哉
    • Organizer
      日本育種学会第140回講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Book] 植物バイオテクノロジーの基礎知識2021

    • Author(s)
      伊藤幸博、鳥山欽哉
    • Total Pages
      142
    • Publisher
      東北大学出版会
    • ISBN
      9784861633607
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Remarks] 武田信哉さんが日本植物バイオテクノロジー学会学生優秀発表賞を受賞

    • URL

      https://www.agri.tohoku.ac.jp/jp/course_topic/20220913-2/

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 細胞質雄性不稔系統と維持系統の作出方法2023

    • Inventor(s)
      鳥山欽哉・五十嵐圭介・岩井裕子・武田信哉・高塚歩・風間智彦
    • Industrial Property Rights Holder
      東北大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2023-036941
    • Filing Date
      2023
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2020-08-03   Modified: 2024-01-30  

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