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Morphological characteristics of the genome stress-induced chromosomal tether structure

Research Project

Project/Area Number 20K21845
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 63:Environmental analyses and evaluation and related fields
Research InstitutionYamaguchi University (2021-2022)
Hiroshima University (2020)

Principal Investigator

Miyamoto Tatsuo  山口大学, 大学院医学系研究科, 教授 (40452627)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 阿久津 シルビア夏子 (AkutsuSilviaNatsuko)  広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 助教 (10822299)
岩根 敦子  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー (30252638)
山本 卓  広島大学, 統合生命科学研究科(理), 教授 (90244102)
松浦 伸也  広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 教授 (90274133)
Project Period (FY) 2020-07-30 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
KeywordsUFB構造 / BubR1 / FIBーSEM / 集束イオンビーム-走査電子顕微鏡 / 染色体微細構造 / FIB-SEM技術 / ゲノム編集技術 / 放射線感受性
Outline of Research at the Start

電離放射線照射後の分裂期細胞には、セントロメア間にultra-fine bridge (UFB)構造と呼ばれる染色体微細構造が発達する。しかし、UFB構造は極めて動的な構造であり、従来の電子顕微鏡による観察が困難であったために、その超微形態構造は不明のままである。そこで、本研究では、培養細胞におけるゲノム編集技術と集束イオンビーム-走査電子顕微鏡(FIB-SEM)を駆使した動的染色体微細構造解析フローを確立して、多様なゲノムストレスによって誘導される動的なUFB構造の形態特性の解明を研究目的としている。

Outline of Final Research Achievements

In highly repetitive genomic sequences, the replicated DNAs tend to be catenated, and during mitotic phase, these DNA regions are coated by DNA helicase molecules to form ultra-fine bridge (UFB) structures. In this study, we found that UFB structures develop between centromeres in mitotic cells after ionizing radiation. We also found that the mitotic checkpoint molecule BubR1 is required for the formation of radiation-induced UFB structures, and that chromosome fragmentation is enhanced in cells lacking BubR1 after irradiation. In this study, we established an intracellular microscopic observation flow using FIB-SEM.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

UFB構造は、ゲノム安定性を維持する上で必要な構造である。本研究では、放射線によってUFB構造が誘導されること、分裂期チェックポイントBubR1はUFB構造の形成を介して放射線による染色体断片化を回避する活性があることを見出した。これらの知見は、新たな放射線発がんの分子機構の理解を深めるだけでなく、放射線治療で生じるUFB構造を標的とした革新的な医薬品開発に繋がることが期待される。また、本研究で整備したFIB-SEMによる細胞微細構造解析フローは、染色体構造の可塑性や形態的多様性の理解を進めるための重要な解析手法と位置付けられ、さらに発展していくと考えられる。

Report

(4 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (27 results)

All 2023 2022 2021 2020

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 9 results) Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] High-efficient CRISPR/Cas9-mediated gene targeting to establish cell models of ciliopathies2023

    • Author(s)
      Hosoba Kosuke、Morita Tomoka、Zhang Ying、Kishi Hiroko、Yamamoto Takashi、Miyamoto Tatsuo
    • Journal Title

      Methods in Cell Biology

      Volume: 175 Pages: 85-95

    • DOI

      10.1016/bs.mcb.2022.07.020

    • ISBN
      9780443185861
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cholesterol in the ciliary membrane as a therapeutic target against cancer2023

    • Author(s)
      Kimura Sotai、Morita Tomoka、Hosoba Kosuke、Itoh Hiroshi、Yamamoto Takashi、Miyamoto Tatsuo
    • Journal Title

      Frontiers in Molecular Biosciences

      Volume: 10 Pages: 1160415-1160415

    • DOI

      10.3389/fmolb.2023.1160415

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] AT-hook DNA-binding motif-containing protein one knockdown downregulates EWS-FLI1 transcriptional activity in Ewing’s sarcoma cells2022

    • Author(s)
      Takao Kitagawa, Daiki Kobayashi, Byron Baron, Hajime Okita, Tatsuo Miyamoto, Rie Takai, Durga Paudel, Tohru Ohta, Yoichi Asaoka, Masayuki Tokunaga, Koji Nakagawa, Makoto Furutani-Seiki, Norie Araki, Yasuhiro Kuramitsu, Masanobu Kobayashi
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Issue: 10 Pages: 0269077-0269077

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0269077

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Elucidation of the etiological mechanisms underlying rare hereditary cilia/centrosome disorders using genome editing technology2022

    • Author(s)
      Morita Tomoka、Hosoba Kosuke、Miyamoto Tatsuo
    • Journal Title

      Gene and Genome Editing

      Volume: 3-4 Pages: 100016-100016

    • DOI

      10.1016/j.ggedit.2022.100016

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Sulforaphane suppresses metastasis of triple-negative breast cancer cells by targeting the RAF/MEK/ERK pathway2022

    • Author(s)
      Zhang Ying、Lu Qian、Li Nan、Xu Ming、Miyamoto Tatsuo、Liu Jing
    • Journal Title

      npj Breast Cancer

      Volume: 8 Issue: 1 Pages: 40-40

    • DOI

      10.1038/s41523-022-00402-4

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] iPSC reprogramming-mediated aneuploidy correction in autosomal trisomy syndromes2022

    • Author(s)
      Akutsu Silvia Natsuko、Miyamoto Tatsuo、Oba Daiju、Tomioka Keita、Ochiai Hiroshi、Ohashi Hirofumi、Matsuura Shinya
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Issue: 3 Pages: 1-20

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0264965

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Imaging of the Ciliary Cholesterol Underlying the Sonic Hedgehog Signal Transduction2022

    • Author(s)
      Miyamoto T, Hosoba K, Akutsu SN, Matsuura S
    • Journal Title

      Methods Mol Biol

      Volume: 2374 Pages: 49-57

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1701-4_5

    • ISBN
      9781071617007, 9781071617014
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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] NBS1 I171V variant underlies individual differences in chromosomal radiosensitivity within human populations2021

    • Author(s)
      Tomioka K, Miyamoto T, Akutsu SN, Yanagihara H, Fujita K, Royba E, Tauchi H, Yamamoto T, Koh I, Hirata E, Kudo Y, Kobayashi M, Okada S, Matsuura S
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 1-13

    • DOI

      10.1038/s41598-021-98673-7

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Premature aging syndrome showing random chromosome number instabilities with CDC20 mutation2020

    • Author(s)
      Fujita Harumi、Sasaki Takashi、Miyamoto Tatsuo、Akutsu Silvia Natsuko、Sato Showbu、Mori Takehiko、Nakabayashi Kazuhiko、Hata Kenichiro、Suzuki Hisato、Kosaki Kenjiro、Matsuura Shinya、Matsubara Yoichi、Amagai Masayuki、Kubo Akiharu
    • Journal Title

      Aging Cell

      Volume: 19 Issue: 11 Pages: 1-13

    • DOI

      10.1111/acel.13251

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 繊毛病の分子細胞生物学2023

    • Author(s)
      宮本達雄
    • Organizer
      メディバイオ事業研究会 第27回講演会
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    • Invited
  • [Presentation] The role of vimentin cleavage in the signal transduction of abnormal vascular smooth muscle contraction2023

    • Author(s)
      Kishi Hiroko, Keisuke Shigenobu, Tatsuo Miyamoto
    • Organizer
      第100回日本生理学会大会
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  • [Presentation] ペルオキシソームを介した繊毛へのコレステロール供給とその破綻2022

    • Author(s)
      宮本達雄
    • Organizer
      第63回日本生化学会 中国・四国支部例会
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    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集技術を用いた 希少性遺伝病の病態解明2022

    • Author(s)
      宮本達雄
    • Organizer
      令和4年度 山口産婦人科学会・山口県婦人科医会 学術講演会
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      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] コレステロール「欠乏」症としての繊毛病2022

    • Author(s)
      宮本達雄
    • Organizer
      AMED CREST/PRIME 脂質領域公開シンポジウム
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    • Invited
  • [Presentation] 機械受容性カルシウムイオンチャネル・Polycystin-2のコレステロール結合サイトの変異解析2022

    • Author(s)
      森田知佳, 木村相泰, 岸博子, 細羽康介, 伊藤浩史, 山本卓, 宮本達雄
    • Organizer
      日本分子生物学会年会第45回年会
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  • [Presentation] Sulforaphane suppresses metastasis of triple-negative breast cancer cells by targeting the RAF/MEK/ERK pathway to inhibit actin stress fiber formation2022

    • Author(s)
      Ying Zhang, Qian Lu, Nan Li, Ming Xu, Tatsuo Miyamoto, Jing Liu
    • Organizer
      第99回日本生理学会大会
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  • [Presentation] Peroxisome-mediated cholesterol trafficking into primary cilia2022

    • Author(s)
      宮本達雄, 細羽康介, 山本卓, 斎藤祐見子, 板橋岳志, 岩根敦子
    • Organizer
      第99回日本生理学会大会
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  • [Presentation] ペルオキシソーム欠損による繊毛シグナル伝達障害の分子機構2021

    • Author(s)
      宮本達雄
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会
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  • [Presentation] ペルオキシソームを介した繊毛へのコレステロール輸送機構2021

    • Author(s)
      宮本達雄, 細羽康介, 板橋岳志, 岩根敦子, 阿久津シルビア夏子, 落合博, 斎藤裕見子, 山本卓, 松浦伸也
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会
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  • [Presentation] ゲノム編集技術の医学への応用2021

    • Author(s)
      宮本達雄
    • Organizer
      日本環境変異原ゲノム学会 公開シンポジウム
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    • Invited
  • [Presentation] 一次繊毛解析に適した数種のGタンパク質共役型受容体の選択と機能解析2021

    • Author(s)
      小林勇喜、西村宣哉、徳永優希、宮本達雄、斎藤祐見子
    • Organizer
      第94回日本薬理学会年会
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  • [Presentation] iPSC reprogramming-mediated aneuploidy correction in autosomal trisomy syndromes2021

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      Silvia Natsuko Akutsu, Tatsuo Miyamoto, Keita Tomioka, Daiju Oba, Hirofumi Ohashi, Shinya Matsuura
    • Organizer
      The 5th International Symposium of the Network-type Joint Usage/Research Center for Radiation Disaster Medical Science
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 繊毛病としてのペルオキシソーム形成不全症・Zellweger症候群2020

    • Author(s)
      宮本達雄、細羽康介、板橋岳志、岩根敦子、阿久津シルビア夏子、落合博、斎藤裕見子、山本卓、松浦伸也
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第65回大会
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  • [Presentation] 染色体分配異常を伴う新規早老症患者におけるCDC20遺伝子変異の同定と分子病態の解析2020

    • Author(s)
      藤田 春美、佐々木 貴史、宮本 達雄、阿久津シルビア夏子、佐藤 尚武、 森 毅彦、中林 一彦、秦 健一郎、鈴木 寿人、小崎 健次郎、松浦 伸也、 松原 洋一、天谷 雅行、久保 亮治
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第65回大会
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  • [Presentation] 機能ゲノミックスを用いた放射線感受性個人差を規定する遺伝素因の探索2020

    • Author(s)
      宮本達雄, 冨岡啓太, 藤田和将, 阿久津シルビア夏子, 工藤美樹, 小林正夫, 岡田賢, 田内広, 松浦伸也
    • Organizer
      日本放射線影響学会第63回大会
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  • [Presentation] Peroxisomes ensure to supply cholesterol into the ciliary membrane : a lesson from a peroxisome-biogenesis disorder Zellweger syndrome2020

    • Author(s)
      Tatsuo Miyamoto, Kosuke Hosoba, Takeshi Itabashi, Atsuko H. Iwane, Silvia Natsuko Akutsu, Hiroshi Ochiai, Yumiko Saito, Takashi Yamamoto, Shinya Matsuura
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
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  • [Book] ゲノム編集と医学・医療への応用2022

    • Author(s)
      山本卓, 宮本達雄, 一戸辰夫, 本庶仁子, 大森司, 加藤和人
    • Total Pages
      200
    • Publisher
      裳華房
    • ISBN
      9784785358730
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2020-08-03   Modified: 2024-01-30  

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