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Development of multi-functional siRNA-aptamer chimera for virus infections

Research Project

Project/Area Number 20K21880
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 90:Biomedical engineering and related fields
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Takahashi Masaki  東京大学, 医科学研究所, 特任准教授 (00549529)

Project Period (FY) 2020-07-30 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2020: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
KeywordsRNAアプタマー / siRNA / ウイルス / キメラ核酸 / アプタマー / ウイルス感染症 / デングウイルス / 機能性核酸 / VLP / ウイルス様粒子
Outline of Research at the Start

DENVやZIKVなど効果的なワクチンや中和抗体の開発が進んでいないウイルス感染症が未だ多く存在する。この現状を変える解決案として、申請者が有する「ウイルス様粒子を活用した膜タンパク質アプタマー開発技術」と一塩基の違いを識別する「特異的RNAi誘導技術」とを融合することで、ウイルスの中和活性部位に特異的かつ強固に結合し感染を防ぎ、感染した場合も細胞内でウイルスゲノムをRNAiで分解する“All-in-One molecule”となる「多重特異性多機能キメラ核酸(Aptamer-siRNA Chimera)」の開発に挑戦する。

Outline of Final Research Achievements

The aim of this study is to generate a new therapeutic agent for viral infection. To address this, we generated siRNA-aptamer chimera molecule multiply achieving viral neutralization and degradation of viral genome. In the study, we focused on a re-emerging virus disease, dengue virus (DENV), as model target, and generated aptamers and siRNA targeting DNEV E-protein and RNA viral genome, respectively. As a result, we succeeded in identifying aptamers with binding and neutralizing activity to DENV, and further succeeded in design of siRNAs degrading DENV genomic RNA sequences. After development of each functional molecule, chimeric nucleic acids were prepared, and their performance as a complex was evaluated by SPR analysis and reporter assay in vitro. A series of assays revealed that chimeric molecule retained both binding activities and RNA interference ability.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ウイルス感染症には、デングウイルスなどの未だ効果的なワクチンや中和抗体が開発できていない再興ウイルス感染症が多く存在する。長期にわたり続く課題の克服には、新たなアプローチによる治療薬開発への挑戦的研究が必要である。その実現のため我々は、上市実績のある機能性核酸「アプタマー」「siRNA」の2つを活用することで、ウイルス中和活性とウイルスゲノム分解活性を併せ持つ「多重特異性多機能キメラ核酸」の開発とその有効性評価を実施した。多様化が進む創薬モダリティの一つとしてキメラ核酸を提案し、その有効性を検証した本成果は今後のウイルス治療分子開発を議論する上で大きな意義を有していると考えられる。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2022 2021 2020

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Nucleic acid ligands act as a PAM and agonist depending on the intrinsic ligand binding state of P2RY22021

    • Author(s)
      Takahashi Masaki、Amano Ryo、Ozawa Michiru、Martinez Anna、Akita Kazumasa、Nakamura Yoshikazu
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 118 Issue: 18

    • DOI

      10.1073/pnas.2019497118

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 膜タンパク質GPCRに対するアプタマー創製法「VLP-SELEX法」の開発2022

    • Author(s)
      高橋理貴
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] チクングニアウイルス様粒子標的RNAアプタマー2022

    • Author(s)
      後藤覚、天野亮、中村義一、高橋理貴
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] VLPを利用したMulti-target SELEXとin silico解析によるデングウイルス中和アプタマーの創製2022

    • Author(s)
      天野亮、一ノ瀬顕子、浜田道昭、中村義一、高橋理貴
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] ウイルス様粒子とin silico解析を用いたデングウイルス中和アプタマーの創製2020

    • Author(s)
      天野亮、一ノ瀬顕子、浜田道昭、中村義一、高橋理貴
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2020-08-03   Modified: 2023-01-30  

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