• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Tag system with exciton controlled fluorescent probes for spatio-temporal analysis of live cell RNAs

Research Project

Project/Area Number 21750182
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

KUBOTA Takeshi  The Institute of Physical and Chemical Research, 岡本独立主幹研究ユニット, 基幹研究所研究員 (40455340)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2010: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2009: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Keywords蛍光イメージング / RNA / 人工核酸 / マイクロインジェクション / 蛍光核酸 / 人工酸 / ハイブリダイゼーション
Research Abstract

Probe-tag pair system was applied to develop a technique for visualizing live cell mRNA localization. The probe was a doubly fluorescent dye labeled oligonucleotide to have a fluorescent enhancement property in the presence of the complementary DNA/RNA strand. The tag structure was a complementary sequence to the probe, and it was inserted into a target mRNA strand. The fluorescent probe was microinjected into cells and the tag inserted mRNA was expressed in the same living cells. By using the probe-tag pair, target mRNAs in living cells were successfully visualized.

Report

(3 results)
  • 2010 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (27 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (13 results) Book (2 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Sets of RNA Repeated Tags and Hybridization-Sensitive Fluorescent Probes for Distinct Images of RNA in a Living Cell.2010

    • Author(s)
      Kubota T, Ikeda S, Yanagisawa H, Yuki M, Okamoto A.
    • Journal Title

      PLoS ONE. 5

    • Related Report
      2010 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hybridization-sensitive fluorescent DNA probe with self-avoidance ability.2010

    • Author(s)
      Ikeda S, Kubota T, Yuki M, Yanagisawa H, Tsuruma S, Okamoto A.
    • Journal Title

      Org Biomol Chem. 8

      Pages: 546-551

    • Related Report
      2010 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sets of RNA Repeated Tags and Hybridization-Sensitive Fluorescent Probes for Distinct Images of RNA in a Living Cell2010

    • Author(s)
      Kubota T, Ikeda S, Yanagisawa H, Yuki M, Okamoto A
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 5

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hybridization-sensitive fluorescent DNA probe with self-avoidance ability2010

    • Author(s)
      Ikeda S, Kubota T, Yuki M, Yanagisawa H, Tsuruma S, Okamoto A.
    • Journal Title

      Organic and Biomolecular Chemistry

      Volume: 8 Pages: 546-551

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RNAの細胞内局在化の蛍光イメージング法2010

    • Author(s)
      久保田健, 岡本晃充
    • Journal Title

      組織細胞化学2010

      Pages: 111-121

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Journal Article] Hybridization-Sensitive Fluorescent Probe for Long-Time Monitoring of Intracellular RNA.2009

    • Author(s)
      Kubota T, Ikeda S, Yanagisawa H, Yuki M, Okamoto A.
    • Journal Title

      Bioconjugate Chem 20

      Pages: 1256-1261

    • Related Report
      2010 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Exciton-Controlled Hybridization-Sensitive Fluorescent Probes : New Approach to Multicolor Detection of Nucleic Acids.2009

    • Author(s)
      Ikeda S, Kubota T, Yuki M, Okamoto A.
    • Journal Title

      Angew Chem Int Ed 48

      Pages: 6480-6484

    • Related Report
      2010 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hybridization-Sensitive Fluorescent Probe for Long-Term Monitoring of Intracellular RNA2009

    • Author(s)
      Kubota T, Ikeda S, Yanagisawa H, Yuki M, Okamoto A.
    • Journal Title

      Bioconjugate Chemistry 20

      Pages: 1256-1261

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 光化学的に設計された新規蛍光核酸によるDNA/RNAイメージング2009

    • Author(s)
      久保田健、池田修司、岡本晃充
    • Journal Title

      日本生物物理学会学会誌 49

      Pages: 310-313

    • NAID

      10025976070

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Hybridization dependent detection of transcribed tagged mRNAs in a living cell2010

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2010-09-20
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] タグ-プローブペアを利用した生細胞内mRNAイメージング2010

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      第20回アンチセンスシンポジウム
    • Place of Presentation
      神戸
    • Related Report
      2010 Annual Research Report 2010 Final Research Report
  • [Presentation] Hybridization dependent detection of transcribed tagged mRNAs in a living cell.2010

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Presentation] 「プローブ-タグ」ペアを利用した生細胞内mRNA発現イメージング2010

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      第19回日本バイオイメージング学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Related Report
      2010 Annual Research Report 2010 Final Research Report
  • [Presentation] エキシトンプローブを用いたmRNAイメージング2010

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      第12回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Related Report
      2010 Annual Research Report 2010 Final Research Report
  • [Presentation] 細胞内mRNAの長時間観察を可能にする蛍光核酸プローブ2009

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      第47回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島市
    • Year and Date
      2009-11-01
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] ハイブリダイゼーション依存蛍光核酸プローブによるmRNAのライブセルイメージング2009

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      福岡市
    • Year and Date
      2009-09-15
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞内mRNAの長時間観察を可能にする蛍光核酸プローブ2009

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      第47回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Presentation] ハイブリダイゼーション依存蛍光核酸プローブによるmRNAのライブセルイメージング2009

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      福岡
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Presentation] ON-OFF蛍光オリゴ核酸プローブによるmRNAの長時間連続イメージング2009

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      第18回日本バイオイメージング学会学術集会
    • Place of Presentation
      広島
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Presentation] 核酸検出のためのOn-Off蛍光プローブとその応用2009

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      がん特定領域 若手ワークショップ
    • Place of Presentation
      蓼科
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Presentation] 蛍光オリゴ核酸プローブの開発と生細胞RNAイメージング2009

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      第11回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      新潟
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Presentation] 蛍光オリゴ核酸プローブの開発と生細胞RNAイメージング2009

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 柳澤博幸, 結城瑞恵, 岡本晃充
    • Organizer
      第11回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      新潟市
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Book] 組織細胞化学2010(RNAの細胞内局在化の蛍光イメージング法)2010

    • Author(s)
      久保田健, 岡本晃充
    • Publisher
      日本組織細胞化学会
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Book] 生物物理,49(光化学的に設計された新規蛍光核酸によるDNA/RNAイメージング)2009

    • Author(s)
      久保田健, 池田修司, 岡本晃充
    • Publisher
      日本生物物理学会
    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Remarks] ホームページ等

    • URL

      http://www.riken.jp/lab-www/okamotoiru/indexj.htm

    • Related Report
      2010 Final Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.riken.jp/lab-www/okamotoiru/indexj.htm

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.riken.jp/lab-www/okamotoiru/indexj.htm

    • Related Report
      2009 Annual Research Report

URL: 

Published: 2009-04-01   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi