Study for scoring system of human stem cells based on DNA methylation

• Project/Area Number: 21790372
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Human pathology
• Research Institution: University of Miyazaki (2011-2012); National Research Institute for Child Health and Development (2009-2010)
• Principal Investigator: NISHINO Koichiro 宮崎大学, 農学部, 准教授 (90508144)
• Project Period (FY): 2009 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000); Fiscal Year 2012: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2011: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2010: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000); Fiscal Year 2009: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
• Keywords: ヒト幹細胞 / ヒトiPS細胞 / DNAメチル化 / 診断企画化 / 標準化 / 診断規格化・標準化 / 診断企画化・標準化

Research Abstract

Human somatic stem cells and pluripotent stem cells including iPSCs are considered to be powerful resources in regenerative medicine. To define characters of human stem cells, we determined the DNA methylation profiles and compared among them. Continuous passaging of the iPSCs diminished the differences between iPSCs and ESCs, implying that iPSCs lose the characteristics inherited from the parent cells and adapt to very closely resemble ESCs over time.

Research Products

• [Journal Article] Induced Pluripotent Stem Cells from Human Extra-Embryonic Amnion Cells: Role of DNA Methylation in Maintaining Stemness (2012)
  • Author(s): Nishino Kand Umezawa A
  • Journal Title: Stem Cells and Cancer Stem Cells Pages: 59-65
• [Journal Article] iPS 細胞におけるメチル化動態 (2012)
  • Author(s): 西野光一郎、梅澤明弘
  • Journal Title: 医学のあゆみ Volume: 第243巻 Pages: 321-322
• [Journal Article] iPS 細胞とゲノムメチル化ダイナミクス (2012)
  • Author(s): 西野光一郎、梅澤明弘
  • Journal Title: 実験医学増刊 Volume: 第30巻 Pages: 1556-1561
• [Journal Article] Induced Pluripotent Stem Cells from Human Extra-Embryonic Amnion Cells: Role of DNA Methylation in Maintaining Stemness (2012)
  • Author(s): Koichiro Nishino
  • Journal Title: Stem Cells and Cancer Stem Cells Volume: Vol. 4 Pages: 59-65
• [Journal Article] iPS細胞におけるメチル化動態 (2012)
  • Author(s): 西野 光一郎
  • Journal Title: 医学のあゆみ Volume: 243巻 Pages: 321-322
• [Journal Article] iPS細胞とゲノムメチル化ダイナミクス (2012)
  • Author(s): 西野 光一郎
  • Journal Title: 実験医学増刊 Volume: 30巻 Pages: 1556-1561
• [Journal Article] DNA methylation dynamics in human induced pluripotent stem cells over time (2011)
  • Author(s): Nishino K, Toyoda M, Yamazaki-Inoue M, Fukawatase Y, Chikazawa E,Sakaguchi H, Akutsu H, Umezawa A
  • Journal Title: PLoS Genetics
• [Journal Article] iPS 細胞とゲノムメチル化 (2011)
  • Author(s): 西野光一郎、梅澤明弘
  • Journal Title: 医学のあゆみ Volume: 第239巻 Pages: 1259-1264
• [Journal Article] DNA methylation dynamics in human induced pluripotent stem cells over time (2011)
  • Author(s): Nishino K, et al
  • Journal Title: PLoS Genetics Volume: 7 Issue: 5 Pages: e1002085-e1002085
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1002085
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] iPS細胞とゲノムメチル化 (2011)
  • Author(s): 西野光一郎, 他
  • Journal Title: 医学の歩み Volume: 第239巻 Pages: 1259-1264
• [Journal Article] エピジェネティクスと疾患(再生医療とエピジェネティクスの接点) (2010)
  • Author(s): 梅澤明弘、西野光一郎
  • Journal Title: 実験医学増刊 Volume: 第28巻 Pages: 2546-2551
• [Journal Article] エピジェネティクスと疾患(再生医療とエピジェネティクスの接点) (2010)
  • Author(s): 梅澤明弘・西野光一郎
  • Journal Title: 実験医学増刊 Volume: 28巻増刊 Pages: 2546-2551
• [Presentation] ヒト胎児性がん細胞のエピジェネティクス (2012)
  • Author(s): 西野光一郎、梅澤明弘
  • Organizer: 第6回 日本エピジェネティクス研究会
  • Place of Presentation: 千代田区
• [Presentation] ヒト胎児性がん細胞のエピジェネティクス (2012)
  • Author(s): 西野 光一郎
  • Organizer: 第6回 日本エピジェネティクス研究会年会
  • Place of Presentation: 学術総合センター（東京都）
• [Presentation] ヒト iPS 細胞の長期培養における異常メチル化動態の解析 (2011)
  • Author(s): 西野光一郎、豊田雅士、山崎-井上麻由、深渡瀬嘉洋、近澤英美、坂口啓成、阿久津英憲、梅澤明弘
  • Organizer: 第5回 日本エピジェネティクス研究会
  • Place of Presentation: 熊本市
• [Presentation] 胎児性がん細胞のエピジェネティクス (2011)
  • Author(s): 梅澤明弘、西野光一郎
  • Organizer: 大阪大学タンパク質研究所セミナー 「疾患におけるエピゲノム異常の分子機構」
  • Place of Presentation: 吹田市
• [Presentation] ヒトiPS細胞の長期培養における異常メチル化動態の解析 (2011)
  • Author(s): 西野光一郎, 他
  • Organizer: 第5回日本エピジェネティクス研究会
  • Place of Presentation: 熊本市
• [Presentation] 胎児性がん細胞のエピジェネティクス (2011)
  • Author(s): 梅澤明弘・西野光一郎
  • Organizer: 大阪大学タンパク質研究所セミナー「疾患におけるエピゲノム異常の分子機構」
  • Place of Presentation: 吹田市(招待講演)
• [Presentation] ヒト iPS 細胞における幹細胞特異的DNA メチル化可変領域の同 (2010)
  • Author(s): 西野光一郎、豊田雅士、山崎-井上麻由、深渡瀬嘉洋、近澤英美、坂口啓成、牧野初音、阿久津英憲、梅澤明弘
  • Organizer: 第4回 日本エピジェネティクス研究会
  • Place of Presentation: 米子市
• [Presentation] Defining hypo-methylated region of stem cell-specific promoters despite general hyper-methylation status in human iPS cells (2010)
  • Author(s): Koichiro Nishino, Masashi Toyoda, Mayu Yamazaki-Inoue, Hatsune Makino, Yoshihiro Fukawatase, Emi Chikazawa, Yoriko Takahashi, Hidenori Akutsu and Akihiro Umezawa
  • Organizer: 第16回 日本遺伝子治療学会国際大会
  • Place of Presentation: 宇都宮市
• [Presentation] ヒトiPS細胞における幹細胞特異的DNAメチル化可変領域の同定 (2010)
  • Author(s): 西野光一郎・豊田雅士・山崎-井上麻由・深渡瀬嘉洋・近澤英美・坂口啓成・牧野初音・阿久津英憲・梅澤明弘
  • Organizer: 第4回 日本エピジェネティクス研究会
  • Place of Presentation: 米子
• [Presentation] Defining hypo-methylated region of stem cell-specific promoters despite general hyper-methylation status in human iPS cells (2010)
  • Author(s): Koichiro Nishino, Masashi Toyoda, Mayu Yamazaki-Inoue, Hatsune Makino, Yoshihiro Fukawatase, Emi Chikazawa, Yoriko Takahashi, Hidenori Akutsu, Akihiro Umezawa
  • Organizer: 第16回 日本遺伝子治療学会
  • Place of Presentation: 宇都宮
• [Remarks] 宮崎大学農学部獣医機能生化学研究室
  • URL: http://www.agr.miyazaki-u.ac.jp/~vet/Vet_biochem/