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Analysis of temporal and spatial control of mRNA translation that is mediated by subcellular structures and novel RNA processing

Research Project

Project/Area Number 21H02398
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 43010:Molecular biology-related
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

Kotani Tomoya  北海道大学, 理学研究院, 准教授 (70419852)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山本 雄広  慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 講師 (50383774)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2023: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2022: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2021: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Keywords卵母細胞 / mRNA / 翻訳制御 / 細胞内微細構造 / RNAプロセシング
Outline of Research at the Start

遺伝子機能を正確に制御するために「翻訳制御」は極めて重要な役割を持つ。我々は翻訳制御機構を解析する画期的な技術を世界に先駆けて独自に確立し、本研究分野に新たな局面を切り開いてきた。本研究は、受精後の個体形成において翻訳制御が果たす役割と、これら一連の生命現象における翻訳制御システムの原理を解き明かすことを目的とする。得られる成果は、生物がどのように翻訳制御機構を統合し個体を作り出すのか、その全貌を知る糸口となると期待される。

Outline of Final Research Achievements

Oocytes of many animals accumulate thousands of mRNAs that are translationally repressed to direct embryonic development. This study aimed to clarify the molecular mechanisms that regulate the translation of these dormant mRNAs during oogenesis and embryogenesis. In this study, we identified a previously unknown RNA processing that shortens the 3’ end sequences of mRNAs. We then demonstrated that this RNA processing promotes the translational activation of dormant mRNAs. We also found that the dormant mRNAs form granular structures during oogenesis and embryogenesis. The changes in internal structures and states of these RNA granules control the translation of assembled mRNAs. Our results revealed that the developmental processes after fertilization are directed by the previously unknown mechanisms.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

翻訳による遺伝子機能制御は、生物のあらゆる組織・器官において重要な役割を持つと考えられるが、その研究は容易ではない。本研究における成果は、動物の卵が受精し、発生プロセスを進行させるために重要な翻訳制御機構の一端を解明したもので、個体形成の根源的な仕組みに迫るものと言える。その成果は基礎生物学的な研究に資するのみでなく、不妊の原因解明や生殖医療の発展、家畜動物の出産率向上など多くの分野に貢献することが期待される。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2024 2023 2022 2021 Other

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (18 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Visualizing the translational activation of a particular mRNA in zebrafish embryos using in situ hybridization and proximity ligation assay2024

    • Author(s)
      Sato Keisuke、Kotani Tomoya
    • Journal Title

      STAR Protocols

      Volume: 5 Issue: 2 Pages: 102951-102951

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2024.102951

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Mature mRNA processing that deletes 3' end sequences directs translational activation and embryonic development2023

    • Author(s)
      Yuki Takada, Ludivine Fierro, Keisuke Sato, Takahiro Sanada, Anna Ishii, Takehiro Yamamoto and Tomoya Kotani
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 9 Issue: 47 Pages: 1-18

    • DOI

      10.1126/sciadv.adg6532

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of embryonic RNA granules that act as sites of mRNA translation after changing their physical properties2022

    • Author(s)
      Sato Keisuke、Sakai Moeko、Ishii Anna、Maehata Kaori、Takada Yuki、Yasuda Kyota、Kotani Tomoya
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Issue: 6 Pages: 104344-104344

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.104344

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Tdrd3 regulates the progression of meiosis II through translational control of Emi2 mRNA in mouse oocytes.2021

    • Author(s)
      Takei N, Sato K, Takada Y, Iyyappan R, Susor A, Yamamoto T, and Kotani T.
    • Journal Title

      Current Research in Cell Biology

      Volume: 2 Pages: 100009-100009

    • DOI

      10.1016/j.crcbio.2021.100009

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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    • Author(s)
      眞田崇弘, 小谷友也
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      日本動物学会第94回山形大会
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      眞田崇弘, 小谷友也
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      第46回日本分子生物学会年会
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      第46回日本分子生物学会年会
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      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] A novel molecular mechanism of zebrafish mRNA regulation in the early developmental stage2023

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      Fierro Ludivine, 高田裕貴, 佐藤圭祐, 小谷友也
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      第46回日本分子生物学会年会
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  • [Presentation] マウス初期発生における新規の母性mRNA転写後制御機構2022

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      高田裕貴, 山本雄広, 小谷友也
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      佐藤圭祐, 前畑香織, 安田恭大, 小谷友也
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      日本発生生物学会第55回金沢大会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Translational control of pou5f3 mRNA through shortening the 3’-end sequences during early development in zebrafish2022

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      Ludivine FIERRO, Yuki TAKADA, Tomoya KOTANI
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      日本発生生物学会第55回金沢大会
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  • [Presentation] ゼブラフィッシュ初期発生におけるRNA顆粒構造の維持と相転移による翻訳制御機構2022

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      佐藤圭祐, 前畑香織, 安田恭大, 小谷友也
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      日本動物学会第93回早稲田大会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] マウス胚発生においてhnRNP DとPatl2は母性mRNAの翻訳を制御する2022

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      眞田崇弘, 高田裕貴, 小谷友也
    • Organizer
      日本動物学会第93回早稲田大会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Zebrafish pou5f3 mRNA shortening as a translational regulation process, but not clearance, in the early development2022

    • Author(s)
      Ludivine FIERRO, Yuki TAKADA, Keisuke SATO, Tomoya KOTANI
    • Organizer
      第3回フランス合同ミーティング
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      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] マウス初期発生におけるhnRNP DとPatl2による母性mRNAの翻訳制御2022

    • Author(s)
      眞田崇弘, 高田裕貴, 小谷友也
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 3’非翻訳領域末端の短縮による母性Pou5f1/Oct4 mRNA新規翻訳制御機構の解明2021

    • Author(s)
      高田裕貴, 小谷友也
    • Organizer
      日本動物学会第92回米子大会(web開催)
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] ゼブラフィッシュ初期発生に重要なpou5f3 mRNA翻訳の時空間的制御機構2021

    • Author(s)
      佐藤圭祐, 小谷友也
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      日本動物学会第92回米子大会(web開催)
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] マウス卵母細胞におけるTdrd3を介したEmi2 mRNAの時期特異的な翻訳制御2021

    • Author(s)
      武井夏海, 佐藤圭祐, 高田裕貴, Iyyappan Rajan, Susor Andrej, 山本雄広, 小谷友也
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] マウス卵形成および胚発生における母性mRNAの3’非翻訳領域の短縮を介した新規翻訳制御機構2021

    • Author(s)
      高田裕貴, 山本雄広, 小谷友也
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 脊椎動物の初期発生におけるmRNAの時空間翻訳制御機構2021

    • Author(s)
      佐藤圭祐, 前畑香織, 酒井萌子, 高田裕貴, 安田恭大, 小谷友也
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
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      2021 Annual Research Report
  • [Remarks] 固相のRNA分子倉庫が液相のタンパク質合成工場に

    • URL

      https://www.hokudai.ac.jp/news/2022/06/rna.html

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      2022 Annual Research Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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