ポリジェニックリスクスコアを用いた自殺リスクの予測と遺伝学的解明
| Project/Area Number |
21H02852
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 52030:Psychiatry-related
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| Research Institution | Kobe University (2023)
Yokohama City University (2021-2022) |
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Principal Investigator |
菱本 明豊 神戸大学, 医学研究科, 教授 (50529526)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
秋山 雅人 九州大学, 医学研究院, 講師 (10757686)
曳野 圭子 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 特別研究員 (10789580)
大塚 郁夫 神戸大学, 医学部附属病院, 講師 (40722880)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥17,290,000 (Direct Cost: ¥13,300,000、Indirect Cost: ¥3,990,000)
Fiscal Year 2023: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2022: ¥5,980,000 (Direct Cost: ¥4,600,000、Indirect Cost: ¥1,380,000)
Fiscal Year 2021: ¥6,110,000 (Direct Cost: ¥4,700,000、Indirect Cost: ¥1,410,000)
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| Keywords | 自殺 / ポリジェニックリスクスコア / ゲノムワイド関連解析 / GWAS |
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| Outline of Research at the Start |
自殺についての遺伝学的知見の獲得は自殺者試料の収集が困難なため世界的に大幅に遅れている。申請者らは国内唯一・世界最大規模の自殺者DNA試料とゲノムワイド関連解析（GWAS）データを有し、GWASデータから算出できる個人ごとの自殺ポリジェニックリスクスコア（PRS）が、個人の自殺リスクを予測できる可能性を見出した。本研究では、自殺者/自殺未遂者試料の追加GWASを実施し①日本人集団において自殺PRSがどの程度の確度で自殺リスクを予測できるか、②アジア人種において各精神疾患や喫煙・飲酒・身長・体重などの様々なヒト表現型がどの程度自殺と遺伝的リスクを共有しているか、の2点を精細に検討する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
自殺についての遺伝学的知見の獲得は、自殺者試料の収集が困難なため他精神科領域に比して世界的に遅れていた。申請者らは国内唯一・単一機関として世界最大規模の自殺者DNA試料とゲノムワイド関連解析(genome-wide association study; GWAS)データを有し、自殺にポリジェニック（多遺伝子性）要因が存在することや、GWASデータから算出できる個人ごとの自殺ポリジェニックリスクスコア(polygenic risk score; PRS)が個人の自殺リスクと相関する可能性を見出していた。本研究では、自殺者/自殺未遂者試料の追加ジェノタイピングを実施し、アジア最大の自殺GWASデータを構築した。アジア人集団の自殺GWASとして初めてゲノムワイド有意水準を超えて自殺リスクに関連するSP4遺伝子プロモーター領域SNP（single nucleotide polymorphism）を同定した。また自殺者及びバイオバンクジャパンのGWASデータを用いた体細胞モザイク解析による「自殺者における常染色体及びX染色体モザイクの異常増加」という先駆的な知見を見出すことに成功した。さらに国際自殺ゲノムコンソーシアムにアジア最大の自殺者GWASデータを提供し、過去最大の43,871例の人種横断的な自殺行動者GWASを実施し、複数の自殺関連遺伝子領域を同定した。Base datasetとして用いる申請者ら自身の日本人自殺GWASをスケールアップするほど、自殺PRSの予測精度が向上することを見出した。
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| Research Progress Status |
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(3 results)
Research Products
(71 results)
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[Journal Article] Association of SLC6A3 variants with treatment-resistant schizophrenia: a genetic association study of dopamine-related genes in schizophrenia2024
Author(s)
Kogure M, Kanahara N, MIyazawa A, Shiko Y, Otsuka I, Matsuyama K, Takase M, Kimura M, Kimura H, Ota K, Idemoto K, Tamura M, Oda Y, Yoshida T, Okazaki S, Yamasaki F, Nakata Y, Watanabe Y, Niitsu T, Hishimoto A, Iyo M.
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Journal Title
Front Psychiatry
Volume: 14
Pages: 1334335-1334335
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Accelerated epigenetic aging in alcohol dependence2024
Author(s)
Shirai T, Okazaki S, Otsuka I, Miyachi M, Tanifuji T, Shindo R, Okada S, Minami H, Horai T, Mouri K, Hishimoto A.
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Journal Title
Journal of Psychiatric Research
Volume: 173
Pages: 175-182
DOI
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Peer Reviewed
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[Journal Article] Improving polygenic prediction in ancestrally diverse populations2022
Author(s)
Ruan Yunfeng、Lin Yen-Feng、Feng Yen-Chen Anne、Chen Chia-Yen、Lam Max、Guo Zhenglin、Ahn Yong Min、Akiyama Kazufumi、Arai Makoto、Baek Ji Hyun、Chen Wei J.、Chung Young-Chul、Feng Gang、Fujii Kumiko、et al. 50名、Stanley Global Asia Initiatives
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Journal Title
Nature Genetics
Volume: 54
Issue: 5
Pages: 573-580
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Association between the examination rate of treatment-resistant schizophrenia and the clozapine prescription rate in a nationwide dissemination and implementation study.2022
Author(s)
Yasui-Furukori N, Muraoka H, Hasegawa N, Ochi S, Numata S, Hori H, Hishimoto A, Onitsuka T, Ohi K, Hashimoto N, Nagasawa T, Takaesu Y, Inagaki T, Tagata H, Tsuboi T, Kubota C, Furihata R, Iga JI, Iida H, Miura K, Matsumoto J, Yamada H, Watanabe K, Inada K, Shimoda K, Hashimoto R.
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Journal Title
Neuropsychopharmacol Rep
Volume: 42(1)
Issue: 1
Pages: 3-9
DOI
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[Journal Article] Improvements in the degree of understanding the treatment guidelines for schizophrenia and major depressive disorder in a nationwide dissemination and implementation study.2021
Author(s)
Numata S, Nakataki M, Hasegawa N, Takaesu Y, Takeshima M, Onitsuka T, Nakamura T, Edagawa R, Edo H, Miura K, Matsumoto J, Yasui-Furukori N, Kishimoto T, Hori H, Tsuboi T, Yasuda Y, Furihata R, Muraoka H, Ochi S, Nagasawa T, Kyou Y, Murata A, Katsumoto E, Ohi K, Hishimoto A, Inada K, Watanabe K, Hashimoto R.
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Journal Title
Neuropsychopharmacol Rep.
Volume: -
Issue: 2
Pages: 199-206
DOI
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