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Involvement of chromatin structure and histone variants in reprogramming of gene expression

Research Project

Project/Area Number 21H04752
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Medium-sized Section 42:Veterinary medical science, animal science, and related fields
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

Aoki Fugaku  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 客員共同研究員 (20175160)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 井上 梓  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, チームリーダー (60814910)
Project Period (FY) 2021-04-05 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥42,250,000 (Direct Cost: ¥32,500,000、Indirect Cost: ¥9,750,000)
Fiscal Year 2023: ¥13,000,000 (Direct Cost: ¥10,000,000、Indirect Cost: ¥3,000,000)
Fiscal Year 2022: ¥13,000,000 (Direct Cost: ¥10,000,000、Indirect Cost: ¥3,000,000)
Fiscal Year 2021: ¥16,250,000 (Direct Cost: ¥12,500,000、Indirect Cost: ¥3,750,000)
Keywords遺伝子発現リプログラミング / ヒストン変異体 / 全能性 / 受精卵 / リプログラミング / 着床前初期胚 / クロマチン構造 / 1細胞期胚 / 遺伝子発現プログラム / 初期胚 / 未受精卵 / 遺伝子発現
Outline of Research at the Start

1)受精前後におけるヒストン変異体の置換と遺伝子発現の変化との関連を明らかにする。
2) ヒストン変異体のノックダウンなどにより置換を阻害し、クロマチン構造および遺伝子発現のリプログラミングへの影響を解析する。
3)遺伝子発現のリプログラミングに関与することが明らかになったヒストン変異体の置換について、これを調節する因子を同定することで遺伝子発現のリプログラミングを調節するメカニズムの解明を行う。

Outline of Final Research Achievements

After fertilization, differentiated oocytes are transformed to totipotent zygotes. In this process, reprogramming of gene expression accompanied with the change in chromatin structure occurs. The purpose of this project is to clarify the mechanism of regulating reprogramming by focusing histone variants which are involved in the regulation of chromatin structure and gene expression. The results showed that H3.3, H2A.X/TH2A and H1foo/H1a as the variants of H3, H2A and H1, respectively, are abundant in totipotent 1-cell stage embryos. The chromatin structure composed of these variants are loosened, which caused a promiscuous gene expression.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本来、遺伝子発現のプログラムは不可逆的なものであるが、受精の前後で一度だけリセットされる必要がある。これにより、分化した卵から全能性のある受精卵へと変化する。このように生命を次世代に引き継ぐために起こる重要な生命現象が遺伝子発現のリプログラミングであるが、本研究の学術的意義は、このメカニズムの一端を明らかにしたことである。
また、現在のところiPS細胞およびクローン動物作成の成功率が低いが、これはリプログラミングに異常があることがその主な原因と考えられる。したがって、本研究の成果は効率的なiPS細胞およびクローン動物の作成法に新たな途を開くものと考えられる。

Report

(5 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Comments on the Screening Results   Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 3 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Involvement of linker histone variant H1a in the regulation of early preimplantation development in mice2023

    • Author(s)
      FUNAYA Satoshi、WANG Yuan、SUZUKI Masataka G.、IKAWA Masahito、AOKI Fugaku
    • Journal Title

      Journal of Reproduction and Development

      Volume: 69 Issue: 3 Pages: 178-182

    • DOI

      10.1262/jrd.2023-013

    • ISSN
      0916-8818, 1348-4400
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Involvement of the linker histone H1Foo in the regulation of oogenesis2022

    • Author(s)
      Satoshi Funaya, Yuria Kawabata, Kenta Sugie, Ken-Ichiro Abe, Yutaka Suzuki, Masataka G Suzuki, Fugaku Aoki
    • Journal Title

      Reproduction

      Volume: 164 Pages: 19-29

    • DOI

      10.1530/rep-21-0233

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cell cycle-dependent radiosensitivity in mouse zygotes2022

    • Author(s)
      Wang Yuan、Oda Shoji、Suzuki Masataka G.、Mitani Hiroshi、Aoki Fugaku
    • Journal Title

      DNA Repair

      Volume: 117 Pages: 103370-103370

    • DOI

      10.1016/j.dnarep.2022.103370

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Zygotic gene activation in mice: profile and regulation2022

    • Author(s)
      AOKI Fugaku
    • Journal Title

      Journal of Reproduction and Development

      Volume: 68 Issue: 2 Pages: 79-84

    • DOI

      10.1262/jrd.2021-129

    • NAID

      130008141670

    • ISSN
      0916-8818, 1348-4400
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Asymmetrical deposition and modification of histone H3 variants are essential for zygote development2021

    • Author(s)
      Kawamura Machika、Funaya Satoshi、Sugie Kenta、Suzuki Masataka G、Aoki Fugaku
    • Journal Title

      Life Science Alliance

      Volume: 4 Issue: 8 Pages: e202101102-e202101102

    • DOI

      10.26508/lsa.202101102

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Involvement of H2A variants in DNA damage response of zygotes2023

    • Author(s)
      Wang Y, Aoki F
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Laboratory
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] H3.1/3.2 regulate the establishment of zygotic gene expression2023

    • Author(s)
      Funaya S, Aoki F
    • Organizer
      56th Annual meeting of Society for the Study of Reproduction
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 胚性遺伝子発現プログラムにおけるダブルホメオボックス遺伝子の役割2023

    • Author(s)
      青木不学
    • Organizer
      公開シンポジウム「全能性プログラム:デコーディングからデザインへ」
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Involvement of histone variants H3.1/3.2 in the progression of gene expression program in early mouse embryos2022

    • Author(s)
      Aoki F, Funaya S
    • Organizer
      The International Symposium "Totipotency and Germ Cell Development"
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] マウス発生におけるH2A変異体の関与2021

    • Author(s)
      青木不学
    • Organizer
      全能性プログラム:デコーディングからデザインへ
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 受精前後における遺伝子発現リプログラミングに関する研究2021

    • Author(s)
      青木不学
    • Organizer
      第114回日本繁殖生物学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] マウス受精後における遺伝子発現リプログラミングへのH3.1/3.2の関与2021

    • Author(s)
      船屋智史,青木不学
    • Organizer
      第114回日本繁殖生物学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Cell-cycle phase dependent radiosensitivity of zygotes2021

    • Author(s)
      Yuan WANG, Fugaku AOKI
    • Organizer
      第114回日本繁殖生物学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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