| Project/Area Number |
21H04782
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Medium-sized Section 45:Biology at organismal to population levels and anthropology, and related fields
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| Research Institution | University of the Ryukyus |
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Principal Investigator |
山平 寿智 琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 教授 (20322589)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
安齋 賢 京都大学, 農学研究科, 特定准教授 (20779467)
北野 潤 国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 教授 (80346105)
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| Project Period (FY) |
2021-04-05 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥42,120,000 (Direct Cost: ¥32,400,000、Indirect Cost: ¥9,720,000)
Fiscal Year 2023: ¥13,260,000 (Direct Cost: ¥10,200,000、Indirect Cost: ¥3,060,000)
Fiscal Year 2022: ¥15,210,000 (Direct Cost: ¥11,700,000、Indirect Cost: ¥3,510,000)
Fiscal Year 2021: ¥13,650,000 (Direct Cost: ¥10,500,000、Indirect Cost: ¥3,150,000)
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| Keywords | 種分化 / 多様性 / 性淘汰 / 性染色体 / メダカ |
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| Outline of Research at the Start |
本研究は，メダカ科魚類をモデル系に，性染色体の置換と分化が，熱帯における二次性徴形質の多様化に果たす役割を検証することを目的とする．そのために，本科魚類全種の性染色体の同定と組換え抑制領域の解析を行い，熱帯の種ほど性染色体の置換が頻繁でかつ非組換え領域の分化が大きいかを検証する．次に，スラウェシ島のマリリ種群４種６集団を対象に，本種群の多様化の歴史推定と性染色体置換の具体的なプロセスの解明，ならびに二次性徴形質の原因遺伝子の同定とそれが性染色体に座乗しているかの検証を行う．さらに，ゲノム編集個体を用いた配偶者選好実験によって，性淘汰がオスの二次性徴形質の進化の推進力であることの検証も行う．
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| Outline of Annual Research Achievements |
種多様性の緯度勾配を説明する仮説として，熱帯は種分化速度が速いとする”種分化仮説”が近年注目を集めている．熱帯では，強い性淘汰圧がオスの二次性徴形質の多様化を促進する推進力になっているという実証研究が蓄積しつつある．しかし，二次性徴形質を異なる方向に進化させる遺伝機構は不明である．二次性徴形質に関わる遺伝子が性染色体と連鎖することで性特異的発現が達成されているなら，性染色体の置換は二次性徴形質の質的な変化をもたらすと考えられる. 本研究は，メダカ科魚類をモデル系に，性染色体の置換と分化が，熱帯における二次性徴形質の多様化に果たす役割を検証することを目的とする．
本年度は，昨年度に引き続き，性染色体未同定である種を対象に，ゲノムワイド性連鎖解析を行った．具体的には，ティウメダカの室内飼育系統から得られた雌雄をpool-seqに，また野外から採集されたニグリマスメダカとネブローサスメダカの雌雄を全ゲノムシーケンスにかけた．その結果，これらの種では，スラウェシ島固有種で多く見られる性染色体（日本のメダカの連鎖群24番）とは別の染色体が，性染色体に相当していることが判明した．これら３種は中央スラウェシの古代湖群で交雑を繰り返してきたことが知られていることから（Sutra et al. 2019），交雑と性染色体置換との関係が浮かび上がってきた．また，ポソ湖のメダカ（ポソ種群）を対象に，体色や体型などの二次性徴形質の原因遺伝子を特定すべく，種間交配系統を用いてQTLマッピングを行った．その結果，これらの形質の責任遺伝子座は特定できたものの，それらは性染色体以外の染色体に座乗していることが判明した．さらに，ポソ種群について全ゲノム配列を新規決定し，大規模な染色体再配置の有無を確認すべく解析を進めている．
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
コロナ渦で採集調査が延期になったが，過去に採集したサンプルを使って解析を進めることができた．また，ポソ種群については室内交配実験も予定通り終了し，いくつかの種について二次性徴形質の責任遺伝座を特定することもできた．
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| Strategy for Future Research Activity |
ポソ種群についてはほぼ予定通りのデータが得られ，論文を執筆する段階に来ている．来年度は，トウティ種群を対象に，GWASなどの解析を進める予定である．
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Report
(3 results)
Research Products
(26 results)
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[Journal Article] Multiple colonizations and hybridization of a freshwater fish group on a satellite island of Sulawesi2023
Author(s)
Mandagi Ixchel F., Sumarto Bayu K. A., Nuryadi Handung, Mokodongan Daniel F., Lawelle Sjamsu A., Masengi Kawilarang W. A., Nagano Atsushi J., Kakioka Ryo, Kitano Jun, Ansai Satoshi, Kusumi Junko, Yamahira Kazunori
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Journal Title
Molecular Phylogenetics and Evolution
Volume: 184
Pages: 107804-107804
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Ghost introgression in ricefishes of the genus Adrianichthys in an ancient Wallacean lake2023
Author(s)
Yamahira Kazunori, Kobayashi Hirozumi, Kakioka Ryo, Montenegro Javier, Masengi Kawilarang W. A., Okuda Noboru, Nagano Atsushi J., Tanaka Rieko, Naruse Kiyoshi, Tatsumoto Shoji, Go Yasuhiro, Ansai Satoshi, Kusumi Junko
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Journal Title
Journal of Evolutionary Biology
Volume: 36
Issue: 10
Pages: 1484-1493
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Species divergence and repeated ancient hybridization in a Sulawesian lake system2021
Author(s)
Ixchel F. Mandagi, Ryo Kakioka, Javier Montenegro, Hirozumi Kobayashi, Kawilarang W. A. Masengi, Nobuyuki Inomata, Atsushi J. Nagano, Atsushi Toyoda, Satoshi Ansai, Masatoshi Matsunami, Ryosuke Kimura, Jun Kitano, Junko Kusumi, Kazunori Yamahira
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Journal Title
JOURNAL OF EVOLUTIONARY BIOLOGY
Volume: 34
Issue: 11
Pages: 1767-1780
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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