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Development of intracellular microRNA imaging technology using SATIC method

Research Project

Project/Area Number 21K05317
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 37030:Chemical biology-related
Research InstitutionNihon University

Principal Investigator

KUWAHARA Masayasu  日本大学, 文理学部, 教授 (40334130)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 藤田 博仁  日本大学, 文理学部, 助手 (60822244)
片岡 由佳  日本大学, 文理学部, 助手 (20978796)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥780,000 (Direct Cost: ¥600,000、Indirect Cost: ¥180,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
KeywordsmiRNA / バイオマーカー / イメージング / 等温遺伝子増幅法 / グアニン四重鎖 / Point of Care Testing
Outline of Research at the Start

動物や植物の細胞において、20残基程度のオリゴヌクレオチドで構成されるマイクロRNA(miRNA)は、一種の小さな非タンパク質コード化リボ核酸である。それらはヒトの癌を含むさまざまな病状で重要な役割を果たすことが知られている。さまざまな癌細胞に存在するmiRNAは、癌の診断と治療に関する豊富な情報を提供する上で関連するバイオマーカーとなる。本研究では、グアニン四重鎖(G4)に選択的に結合して強い蛍光を発する独自開発した色素(チオフラビンT誘導体)に着眼し創出したバイオマーカー検出法(SATIC法)を応用することで、miRNAの細胞イメージング技術の開発を検討する。

Outline of Final Research Achievements

The form of the initiation complex that is the starting point of the nucleic acid amplification reaction in the SATIC method was examined in various ways based on the prediction of nucleic acid stability using nearest neighbor parameters, and thereby, the sequences were optimized. Furthermore, aiming at simultaneous detection of multiple samples, a FRET type fluorescent probe (ThT-SB) was newly designed and synthesized with ThT as the donor and styrylbenzothiazole (SB) as the acceptor. Then, it was confirmed that the emission wavelength was red-shifted in the presence of guanine quadruplex (G4) generated by the nucleic acid amplification method. When assays were performed using cells with the nucleic acid amplification reagents, fluorescence emission from the nucleus and cytoplasm was confirmed only in the presence of target RNA.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

近年、さまざまな疾患や生化学的プロセスの低侵襲的な診断に利用できるバイオマーカーとして、血清や血漿などの体液中のRNAが注目されており、最近では、定量PCR法を改良したアッセイ法を用いることで、感度および特異性とともに信頼性の高いRNAプロファイリングを行うことが可能となった。一方、細胞内miRNAイメージングについては今後の技術革新が期待されているところである。本開発において細胞サンプルで標的RNAが特異的に検出されたことから、既存の方法・原理と一線を画す独自の核酸増幅法による細胞内miRNAイメージングシステムの実効可能性が示唆された。

Report

(3 results)
  • 2023 Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2023 2022 2021

All Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Book (1 results)

  • [Presentation] 等温核酸増幅反応における増幅子の同定と性能評価2023

    • Author(s)
      久保 千尋, 藤田 博仁,桑原正靖
    • Organizer
      日本化学会 第103春季年会 (2023)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Detection systems that start with the ternary initiation complex formation2022

    • Author(s)
      Masayasu Kuwahara
    • Organizer
      FIBER International Summit for Nucleic Acids 2022 (FISNA2022)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 新規バイオマーカー検出法(SATIC 法)の開発と今後2021

    • Author(s)
      桑原正靖
    • Organizer
      第94回日本内分泌学会学術総会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 等温遺伝子増幅法におけるマルチプレックス検出に向けたグアニン四重鎖結合性蛍光色素の検討2021

    • Author(s)
      藤田博仁,田村美雪,桑原正靖
    • Organizer
      日本化学会 第102春季年会 (2022)
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] マラカイトグリーン結合性DNAアプタマーのセレクションおよび蛍光特性評価2021

    • Author(s)
      田村美雪,藤田博仁,桑原正靖
    • Organizer
      日本化学会 第102春季年会 (2022)
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Book] Detection systems using the ternary complex formation of nucleic acids (Handbook of chemical biology of nucleic acids)2022

    • Author(s)
      Hiroto Fujita, Masayasu Kuwahara
    • Total Pages
      18
    • Publisher
      Springer, Singapore
    • ISBN
      9789811613135
    • Related Report
      2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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