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Mechanism for diversifying the branched structure of GPI elucidated by interdisciplinary research in glycochemistry and glycobiology

Research Project

Project/Area Number 21K05401
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 38040:Bioorganic chemistry-related
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

Tanaka Hide-Nori  岐阜大学, 糖鎖生命コア研究所, 助教 (20725064)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 藤田 盛久  岐阜大学, 糖鎖生命コア研究所, 教授 (30532056)
平田 哲也  岐阜大学, 高等研究院, 特任助教 (90780651)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Keywords糖脂質GPI / 糖鎖合成 / 蛍光プローブ / 糖転移酵素 / B3GALT4 / PGAP4 / 蛍光ラベル
Outline of Research at the Start

本研究では、糖鎖合成化学と糖鎖生化学の融合的アプローチにより、糖脂質GPI側鎖構造多様化の鍵を握る糖転移酵素B3GALT4の酵素学的特性を明らかにし、GPI側鎖構造の多様化メカニズムを解明する。B3GALT4は過去に糖脂質GM1生合成酵素として報告されているため、本研究成果はB3GALT4によるGPIとGM1の生合成制御メカニズムの解明に繋がる。

Outline of Final Research Achievements

GPI is a glycolipid that is widely conserved among eukaryotes. It has a common core structure among eukaryotes, and mammalian GPI has a side chain with GlcNAc, followed by Gal, and Sia. It is also known that the side chain structure varies depending on the type of protein. In recent years, it has been revealed that the Gal transferase that works in GPI side chain elongation is the sphingoglycolipid GM1 synthase B3GALT4. In this study, we aimed to elucidate the mechanism of diversification of GPI side chain structure by interdisciplinary research in glycochemistry and glycobiology. To clarify the enzymatic properties of B3GALT4, we aimed to chemically synthesize GPI-GalNAc, which serves as the enzyme substrate, and worked on the synthesis of each unit.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

糖脂質GPIは細胞内で小胞体とゴルジ体に存在する19の酵素群によって生合成されるが、これら生合成酵素の酵素学的性質は未だに何一つとして解析されていない。GPI生合成メカニズム解析が進んでいない原因として挙げられるのが、in vitro酵素活性評価系の構築の難しさである。特に酵素活性評価に必要とされる量の高純度GPI分子を天然から入手できないことが大きな障壁となっていた。本研究では、酵素基質であるGPI分子を高純度かつ大量に供給できる合成基盤を確立することでこの難題を解決し、GPI生合成酵素の酵素学的性質を世界で明らかにする点で学術的意義が高い。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (14 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Direct and Stereoselective Protecting‐Group‐Free <i>N</i>‐ADP‐Ribosylation through Traceless Staudinger Ligation2024

    • Author(s)
      Hagino Rui、Komura Naoko、Imamura Akihiro、Ishida Hideharu、Ando Hiromune、Tanaka Hide‐Nori
    • Journal Title

      European Journal of Organic Chemistry

      Volume: - Issue: 22

    • DOI

      10.1002/ejoc.202400251

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  • [Journal Article] Synthetic Approaches to Ribosyl Adenosine 5′,5′′‐Diphosphate Fragment of Poly(ADP‐ribose)2023

    • Author(s)
      Hagino Rui、Mozaki Keita、Komura Naoko、Imamura Akihiro、Ishida Hideharu、Ando Hiromune、Tanaka Hide‐Nori
    • Journal Title

      European Journal of Organic Chemistry

      Volume: 26

    • DOI

      10.1002/ejoc.202300875

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  • [Journal Article] Protecting-group- and microwave-free synthesis of β-glycosyl esters and aryl β-glycosides of N-acetyl-d-glucosamine2022

    • Author(s)
      Hamaya Yu、Komura Naoko、Imamura Akihiro、Ishida Hideharu、Ando Hiromune、Tanaka Hide-Nori
    • Journal Title

      Bioorganic &amp; Medicinal Chemistry

      Volume: 67 Pages: 116852-116852

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2022.116852

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    • Author(s)
      Hagino Rui、Mozaki Keita、Komura Naoko、Imamura Akihiro、Ishida Hideharu、Ando Hiromune、Tanaka Hide-Nori
    • Journal Title

      ACS Omega

      Volume: 7 Issue: 36 Pages: 32795-32804

    • DOI

      10.1021/acsomega.2c04732

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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 脱ADP-リボシル化酵素活性検出用蛍光プローブとして有用な化合物、その塩、又はそれらの溶媒和物2024

    • Inventor(s)
      田中秀則、萩野瑠衣、海老原章郎
    • Industrial Property Rights Holder
      田中秀則、萩野瑠衣、海老原章郎
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2024
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URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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