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Conservation study of the marine invertebrate brittle star, Ophiothela danae, based on museum specimen DNA

Research Project

Project/Area Number 21K05632
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 39060:Conservation of biological resources-related
Research InstitutionHiroshima Shudo University (2022-2023)
The University of Tokyo (2021)

Principal Investigator

Okanishi Masanori  広島修道大学, 人間環境学部, 助教 (70639278)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 藤田 敏彦  独立行政法人国立科学博物館, 動物研究部, 部長 (70222263)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords系統 / 分類 / 集団遺伝 / MIG seq / クモヒトデ類 / 博物館標本 / 古標本 / ニシキクモヒトデ / 進化 / 海産無脊椎動物 / 棘皮動物 / 海洋保全 / 分子系統解析 / 次世代シーケンサー / MIG-seq / MIg-seq / 潮下帯 / クモヒトデ
Outline of Research at the Start

本研究では、インド―西太平洋海域に生息する小型の海産無脊椎動物である,ニシキクモヒトデ(Ophiothela danae)について,50年前より国立科学博物館(科博)に保管されている日本産の過去の標本と新規採集標本のDNA配列の比較を行う.次世代シーケンサー(NGS)を駆使し、MIg-seq解析を行い、各時代・各地域の個体群の遺伝的多様性の変化とそれに影響を与えた環境要因を検証する。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we conducted a population genetic study on 313 specimens of Ophiothela danae (Ophiuroidea: Echinodermata) collected from various regions of Japan and Southeast Asia between 1975 and 2021, by using MIG seq analysis. We found that ethanol-preserved specimens provided more genetic information than formalin-preserved ones, with this trend being more pronounced in newer specimens. Our analysis indicated that genetic diversity increases in populations located further northeast, suggesting that the distribution center of the O. danae is in temperate regions. This study confirmed the usefulness of museum specimens for MIG seq analysis.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

温暖化やそれに伴う気候変動は,生物の地理分布とその遺伝構造の関係に影響を与えていると考えられる.このような遺伝構造の変遷の解明は,生物多様性の維持に直結する重要な課題といえるが,地球の生命圏の約9割(面積)を占める潮下帯以深の生物に関するこのような研究は少ない.本研究では,これまでにモニタリングが難しかった潮下帯以深に生息する生物の標本を用いることにより,過去から現在までの海洋生物の遺伝構造の変化の理解を進めることに貢献した.

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2024 2023 2021 Other

All Presentation (4 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Presentation] クモヒトデ標本を用いた研究:分類,化石,環境DNAまで2024

    • Author(s)
      岡西政典
    • Organizer
      日本動物学会第95回長崎大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] MIG seq法を用いたニシキクモヒトデ(棘皮動物門:クモヒトデ綱)の遺伝構造解析2023

    • Author(s)
      岡西政典・中濱直之・藤田敏彦・蛭田眞平
    • Organizer
      日本動物学会第94回山形大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 現生・化石の研究から見えてきた相模湾産クモヒトデ類の自然史と環境指標生物としての応用の可能性2021

    • Author(s)
      岡西政典・三井翔太・CHEN Chong・川端美千代・小森いづみ・幸塚久典
    • Organizer
      日本動物学会第92回オンライン大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 相模湾周辺の現生・化石クモヒトデ類の検討~自然史の解明にむけて~2021

    • Author(s)
      岡西政典・三井翔太・川端美千代・小森いづみ・幸塚久典
    • Organizer
      第17回棘皮動物研究集会オンライン大会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Remarks] 広島修道大学 教員情報

    • URL

      https://shu-lab.shudo-u.ac.jp/shuhp/KgApp?kyoinId=ymbsgkodggy

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Remarks] チームてづるもづる

    • URL

      http://www.tezuru-mozuru.com/

    • Related Report
      2021 Research-status Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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