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Analysis of molecular mechanisms in RNA activation

Research Project

Project/Area Number 21K06953
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Review Section Basic Section 49030:Experimental pathology-related
Research InstitutionTokyo Medical University

Principal Investigator

Ohno Shinichiro  東京医科大学, 医学部, 講師 (90513680)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 熊谷 勝義  東京医科大学, 医学部, 助教 (20567911)
黒田 雅彦  東京医科大学, 医学部, 主任教授 (80251304)
原田 裕一郎  東京医科大学, 医学部, 助手 (80570168)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
KeywordsRNA activation / microRNA / RNA pol II pausing / DDX21 / CDK9 / AGO / TNRC6
Outline of Research at the Start

これまで我々は、核内microRNA (miRNA)の機能および生理的意義の解明に取り組んできた。その結果、がん抑制miRNAとして知られるmiR-34aが、がん抑制遺伝子ZMYND10の転写を直接的に誘導する現象を発見した。一般的にmiRNAは、細胞質においてRNA干渉により遺伝子発現を抑制することが広く知られている。一方で、核内miRNAが転写を誘導する現象はRNA activation (RNAa)と呼ばれているが、研究報告は少なく、分子機構の詳細は不明である。したがって本研究は、miR-34aによるZMYND10の誘導機構を評価系として、核内RNAaの分子メカニズムの解明を目的とする。

Outline of Final Research Achievements

The aim of this study was to elucidate the molecular mechanism of transcription activation (RNAa) by microRNAs, which is not well known. In addition to the miRNA/AGO/TNRC6 complex, we identified the DDX21/CDK9 complex as a transcriptional activator. We also identified the release of RNA pol II pausing as the mechanism of transcriptional activation by the DDX21/CDK9 complex. These findings reveal a new role and mechanism for microRNAs in the nucleus.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

miRNAによるRNA干渉は、発生・分化および各種疾病の発症などに関与する重要な機構であることが広く知られている。一方でRNAaは、その解析の難しさから、不明な点が多い現象であり、挑戦的な研究テーマであった。本研究により、転写活性化の分子機構の一端が明らかになったことで、RNAa研究は飛躍的に進歩する可能性がある。またRNAaは、任意の内在性遺伝子の発現を誘導する技術として注目されており、新規の核酸医薬として開発が期待される。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Int'l Joint Research] Northwestern University/Weill Cornell Medicine(米国)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] Northwestern University/Weill Cornell Medicine(米国)

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Journal Article] Nuclear microRNAs release paused Pol II via the DDX21-CDK9 complex2022

    • Author(s)
      Shin-Ichiro Ohno, Keiki Oikawa, Toshiaki Tsurui, Yuichirou Harada, Kana Ono, Mizumo Tateishi, Aashiq Mirza, Masakatsu Takanashi, Kosuke Kanekura, Kumiko Nagase, Yoshihisa Shimada, Yujin Kudo, Norihiko Ikeda, Takahiro Ochiya, Xiaozhong Wang , Masahiko Kuroda
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 12;39(2) Issue: 2 Pages: 110673-110673

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.110673

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Liver-specific DICER1 syndrome model mouse develops cystic liver tumor.2023

    • Author(s)
      大野慎一郎、原田裕一郎、黒田雅彦
    • Organizer
      第112回日本病理学会総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Liver-specific DICER1 syndrome model mouse develops congenital hepatic fibrosis and Caroli’s syndrome2023

    • Author(s)
      大野慎一郎、原田裕一郎、黒田雅彦
    • Organizer
      第82回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] A mouse model of DICER1 syndrome develops hepatic mesenchymal hamartoma.2022

    • Author(s)
      大野慎一郎、原田裕一郞、黒田雅彦
    • Organizer
      第111回日本病理学会総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] A mouse model of DICER1 syndrome develops cirrhosis, bile duct hyperplasia and hepatic tumors2022

    • Author(s)
      大野慎一郎、原田裕一郞、黒田雅彦
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] Model mice that mimic the genotype of DICER1 syndrome develop hepatic mesenchymal hamartoma.2021

    • Author(s)
      大野慎一郎、原田裕一郞、黒田雅彦
    • Organizer
      第110回日本病理学会総会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2025-01-30  

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