| Project/Area Number |
21K07222
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
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| Research Institution | Kagoshima University |
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Principal Investigator |
Yokoyama Seiya 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (20569941)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
谷本 昭英 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 教授 (10217151)
濱田 大治 鹿児島大学, 医歯学域医学系, 助教 (30771480)
東 美智代 鹿児島大学, 医歯学域鹿児島大学病院, 准教授 (60315405)
杉本 知之 滋賀大学, データサイエンス学部, 教授 (70324829)
赤羽 俊章 鹿児島大学, 医歯学総合研究科, 特任研究員 (70754480)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
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| Keywords | 膵臓癌 / 胆管癌 / DNAメチル化 / バイオマーカー / 予後予測 / 機械学習 / PDAC / DNA methylation / MPS / BSAS / prognosis prediction / cholangiocarcinoma / NGS |
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| Outline of Research at the Start |
膵癌は，数ある癌の中でも早期発見はもちろん，治癒を望める段階での診断が困難な難治性の癌である．それゆえ，膵癌の悪性度診断法の確立が望まれている．本課題においては，膵臓癌組織および膵液検体を対象に，膵臓腫瘍の悪性度に関連する一連の糖たんぱく質であるムチンファミリー遺伝子群を含むがん遺伝子・がん抑制遺伝子のDNAメチル化状況を詳細に解析する．同一検体における病理学解析結果や臨床情報を統合し，計算科学的検討を行うことで，膵癌の早期発見や発癌リスク・摘出術の奏功性を含めた悪性度判別法の開発と，その臨床応用へ向けた有用性を評価することを目的とする．
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| Outline of Final Research Achievements |
To overcome the bottlenecks of traditional methylation-specific electrophoresis, we developed a bisulfite amplicon sequencing (BSAS) panel using NGS. This panel enabled DNA methylation analysis in FFPE, LBC, and frozen samples, proving effective for predicting pancreatic cancer malignancy. Additionally, methylation analysis of the MUC1 promoter region was confirmed to be a useful prognostic indicator for pancreaticobiliary cancers.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
従来のメチル化特異的電気泳動法のボトルネックを解消するため、NGSを用いたバイサルファイトアンプリコンシークエンス（BSAS）パネルを開発しました。これにより、FFPE、LBC、凍結検体でのDNAメチル化解析が可能となり、膵臓癌の悪性度予測に有効であることが示されました。MUC1プロモーター領域のメチル化解析が、膵胆道癌の予後指標として有用であることも確認されました。この研究は、膵臓癌の早期診断と治療戦略に革新をもたらし、社会的意義として、患者の生存率向上と治療コストの削減に貢献する可能性があります。
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