Evaluation of minimal residual disease by liquid biopsy in malignant lymphoma for precise therapeutic stratification.
| Project/Area Number |
21K08407
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 54010:Hematology and medical oncology-related
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| Research Institution | Fujita Health University |
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Principal Investigator |
冨田 章裕 藤田医科大学, 医学部, 教授 (80378215)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
佐谷 秀行 藤田医科大学, がん医療研究センター, センター長 (80264282)
安田 貴彦 独立行政法人国立病院機構(名古屋医療センター臨床研究センター), その他部局等, 分子診断研究室長 (20723977)
杉原 英志 藤田医科大学, オープンファシリティセンター, 准教授 (50464996)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
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| Keywords | 悪性リンパ腫 / 遺伝子異常 / リキッドバイオプシー / 遺伝子変異解析 / 遺伝子変異 / 微小残存病変 / 網羅的遺伝子変異解析 |
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| Outline of Research at the Start |
本研究では、MLの中でもすでに遺伝子異常情報がある程度蓄積している病型（びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ホジキンリンパ腫など）を対象とする。同意を得た症例から採取された診断時生検検体（生検体もしくは固定検体）よりゲノムDNAを抽出し網羅的遺伝子変異解析（パネル解析）を行い異常遺伝子の同定を行う。また、初診時および経時的に得られた血漿、血球、その他の体液検体を用いて、MRD解析（デジタルPCR法など）を実施、これらの結果と治療反応性、予後などとの関連性を検討し、MLにおけるMRD解析の意義を検討する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
びまん性大細胞型B細胞リンパ腫（DLBCL）、血管内大細胞型B細胞リンパ腫（IVLBCL）、中枢神経リンパ腫（CNSL）などにおいては、反復する遺伝子異常が既に同定されている。本研究では、これらの患者の生検検体および血漿、脳脊髄液（CSF）、硝子体液などを採取して検体集積を行った。液体検体からは無細胞遊離DNA（cfDNA）を抽出して遺伝子解析を行い、従来法による確定診断前の疾患の検出や診断、治療開始後の微少残存病変（MRD）解析などに有用であるかどうか検討を行った。本解析では、droplet-digital PCR (ddPCR)ほか、全エクソン解析、RNAシーケンスを実施した。
CSF-cfDNAを用いた検討では、MYD88/CD79B変異は検討されたCNSL（N=10）の8割に検出されたが、鑑別を要する中枢神経系感染性疾患や脱髄性疾患（N=20）においては検出されなかった。また、確定診断前に経時的に採取されたCSFを用いた検討では、当該変異が確定診断前に検出可能であることが示され、疾患の早期検出に有用である可能性を示した。変異検出によるCNSL診断については更なる議論を要する。
再発IVLBCL (N=3)における、初診、再発、および経時的検体を用いた解析では、ddPCR を用いたMRD解析により臨床的な再発確認以前に再発兆候を検出できる可能性を示した。また、再発時のcfDNAにて新規獲得もしくは喪失した遺伝子異常を検出可能であり、分子病態の変化を検出可能であることを示した。
抗CD20抗体使用後に CD20 陰性化を獲得した症例における、種々の経時的検体を用いた解析では、血漿cfDNA検体にてMS4A1 (CD20) 遺伝子の変異や構造異常について検出が可能であり、治療抵抗例における遺伝子解析においてリキッドバイオプシーが有用である可能性を示した。
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Report
(3 results)
Research Products
(75 results)
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[Journal Article] Development of TCR-T cell therapy targeting mismatched HLA-DPB1 for relapsed leukemia after allogeneic transplantation.2023
Author(s)
Barakat C, Inagaki Y, Mizuno S, Nishio N, Katsuyama N, Sato Y, Kobayashi M, Ozeki K, Iida H, Tomita A, Sawa M, Demachi-Okamura A, Takahashi Y, Nishikawa H, Akatsuka Y.
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Journal Title
Int J Hematol
Volume: 118
Issue: 2
Pages: 252-266
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] T cell receptor-engineered T cells derived from target human leukocyte antigen-DPB1-specific T cell can be a potential tool for therapy against leukemia relapse following allogeneic hematopoietic cell transplantation2023
Author(s)
Katsuyama N, Kawase T, Barakat C, Mizuno S, Tomita A, Ozeki K, Nishio N, Sato Y, Kajiya R, Shiraishi K, Takahashi Y, Ichinohe T, Nishikawa H, Akatsuka Y
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Journal Title
Nagoya Journal of Medical Science
Volume: 85
Issue: 4
Pages: 779-796
DOI
ISSN
0027-7622
URL
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Prospective comparison of 5- and 7-day administration of azacitidine for myelodysplastic syndromes: a JALSG MDS212 trial2022
Author(s)
Miyazaki Y, Kiguchi T, Sato S, Usuki K, Ishiyama K, Ito Y, Suzuki T, Taguchi J, Chiba S, Dobashi N, Tomita A, Harada H, Handa H, Horiike S, Maeda T, Matsuda M, Ichikawa M, Hata T, Honda S, Iyama S, Suzushima H, Moriuchi Y, Kurokawa T, Yokota K, Ohtake S, Yamauchi T, Matsumura I, Kiyoi H, Naoe T.
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Journal Title
International Journal of Hematology
Volume: 116
Issue: 2
Pages: 228-238
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Liquid biopsy of plasma and cerebrospinal fluid are useful for detection of intravascular lymphoma with central nervous system symptoms alone.2022
Author(s)
Hosoi H, Tanigawa I, Kosako H, Okamoto A, Iwamoto R, Koh J, Mori M, Hiroi T, Mushino T, Murata S, Murata SI, Tomita A, Sonoki T.
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Journal Title
Annals of Hematology
Volume: 101
Issue: 3
Pages: 709-711
DOI
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Clinical characteristics, prognostic factors, and outcomes of patients with essential thrombocythemia in Japan: the JSH-MPN-R18 study2021
Author(s)
Hashimoto Y, Ito T, Gotoh A, Nakamae M, Kimura F, Koike M, Kirito K, Wada H, Usuki K, Tanaka T, Mori T, Wakita S, Saito TI, Kada A, Saito AM, Shimoda K, Sugimoto Y, Kurokawa T, Tomita A, Edahiro Y, Akashi K, Matsumura I, Takenaka K, Komatsu N
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Journal Title
International Journal of Hematology
Volume: 115
Issue: 2
Pages: 208-221
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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