| Project/Area Number |
21K09579
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 56050:Otorhinolaryngology-related
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| Research Institution | University of Fukui |
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Principal Investigator |
菅野 真史 福井大学, 学術研究院医学系部門(附属病院部), 助教 (90444215)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
辻川 哲也 福井大学, 高エネルギー医学研究センター, 准教授 (30380033)
今村 好章 福井大学, 学術研究院医学系部門(附属病院部), 准教授 (40223341)
成田 憲彦 福井大学, 学術研究院医学系部門, 准教授 (80345678)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | PET/MRI / Radiogenomics / nCounter / nCounter解析 / 患者集積完了 / RNA抽出 / RNA品質チェック完了 |
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| Outline of Research at the Start |
放射線画像的特徴と発現している遺伝子の差異を抽出し、治療予後に関する患者データと組み合わせて解析する
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| Outline of Annual Research Achievements |
カンファレンスを行い研究の進捗および方針について確認した。患者選定が終了し舌癌組織標本(FFPEブロック)からRNeasy FFPE Kit(Qiagen)を用いてRNA抽出を行い、さらに品質チェックを行い遺伝子解析可能であることを確認した。RNA抽出が終了した。nCounter解析の準備が完了した。遺伝子解析に必要な物品を前倒し至急で予算を整え購入し納入された。
筑波大学でのｎCounter解析待ちの状態。
造影CT、造影MRI、PET/MRI、PET/CT検査の読影および画像データの抽出を行った。PET/MRIの画像情報として、腫瘍最大径、DOI、腫瘍形態、SUV、エナジー、コントラスト、エントロピー、ヒートマップ、インテンシティー、腫瘍辺縁部の明瞭度・不明瞭度、Normalized Mutual Informationアルゴリズムを用いた線形変換による比較、腫瘍形態の３次元化など２０項目以上の特徴量を抽出した。
病理医専門医（今村）が、組織標本における組織診断ならびにT分類、DOI、浸潤様式、脈管及び神経周囲浸潤の診断を行った。
論文化作業を行っている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
初計画が順調に進んでおり、令和5年度に実施予定だった分のRNA解析も令和4年度に実施する必要が出てきた。このことにより、RNA解析のためのnCounterパネルを5セット（1セット約40万円）購入するため、前倒し請求を行った。現在60症例のnCounter解析作業を行っている。
令和5年度に行う予定であった実験の一部も令和4年度に完了した。
現在論文化作業を行っている
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| Strategy for Future Research Activity |
現在データの集積作業がほぼ完了している。今後データの確認と検証を行う。さらに、解析及び統計学的な検討を進める。解析内容をまとめて研究者全体で討論し論文化作業を行っていく。
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