細胞診アーカイブスのゲノム情報；最難治癌に対する精密医療を目指して
| Project/Area Number |
21K15963
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 53010:Gastroenterology-related
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
大山 広 千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (10814600)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
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| Keywords | 胆道癌 / 膵癌 / 次世代シークエンサー / 遺伝子変異 / がん遺伝子 / 悪性新生物 / ゲノミクス / 胆膵癌 |
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| Outline of Research at the Start |
胆膵癌は80%以上が切除不能であり、予後不良な最難治癌である。ゲノム情報に基づく精密医療（Precision Medicine）時代が到来し、遺伝子変異を標的とした治療による予後の改善が期待されている。ゲノム情報を得るにはホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織が必須であるが、精密医療が最も切望される切除不能胆膵癌は手術検体が存在しないため応用困難である。我々は、FFPEの代替候補として腫瘍細胞を含む胆汁細胞診アーカイブスに着目した。本研究は、細胞診検体とFFPEのゲノム情報が一致するか、治療薬探索が可能か検証し、FFPEのない切除不能胆膵癌への精密医療の実現を目的とする。
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| Outline of Annual Research Achievements |
胆膵癌は予後不良な最難治癌である。がんゲノムプロファイリングによる予後改善が期待されるが、評価に値する必要十分な量の腫瘍組織を獲得することは困難であることが多い。アーカイブされた細胞診検体（ACS）は腫瘍細胞の有無を評価済みであり、直接剥離によりDNA抽出が可能なことから、がんゲノムプロファイリングに適した検体であることが期待される。本研究では、ASCをゲノムプロファイリングに供し、発癌関連遺伝子変異および薬剤適合遺伝子変異の同定可能性について、FFPE組織と比較し、最難治癌に対する精密医療の確立を目指した。
胆膵癌において高頻度に変異が同定される60遺伝子を網羅した胆膵癌パネルを構築しターゲットシークエンスに用いた。胆膵疾患44名からFFPE組織19検体、ACS61検体の計80検体を収集した。抽出されたDNAはTaqMan RNase P Detection Reagents KitとFFPE DNA QC Assay v2を用いて質的・量的検討を実施し、DNA収量、断片化程度は両者同等であることが確認された。
FFPE組織とACSの両者を有する悪性胆膵疾患19名において、収集したFFPE組織19検体、ACS29検体のゲノムプロファイルを比較したところ、発癌関連遺伝子変異は76%の一致率であった。また、ACSのみを有する悪性胆膵疾患15名、良性胆膵疾患10名の計25名において、収集したACS32検体のゲノムプロファイルを検証したところ、感度91%、特異度100%、正診率93%と十分な鑑別能を有していた。さらに、治療標的遺伝子変異ならびに薬剤適合遺伝子変異の同定はACSではそれぞれ74%と32%、FFPE組織ではそれぞれ79%と21%であり、同等であった。
このことから、ACSを用いたゲノムプロファイリングは良悪性鑑別と治療標的薬剤の検出において有用であることが示唆された。
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Report
(3 results)
Research Products
(24 results)
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[Journal Article] Detection of actionable mutations in cytological specimens obtained by endoscopic ultrasound-guided fine needle aspiration with rapid onsite evaluation in pancreatic cancer2022
Author(s)
Ohyama H, Hirotsu Y, Amemiya K, Amano H, Hirose S, Hosoda K, Oyama T, Iimuro Y, Kojima Y, Mikata R, Mochizuki H, Kato N, Omata M
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Journal Title
Annals of Diagnostic Pathology
Volume: 60
Pages: 152008-152008
DOI
Related Report
Peer Reviewed
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