| Project/Area Number |
21K17106
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 57060:Surgical dentistry-related
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
Miyamoto Isao 千葉大学, 医学部附属病院, 助教 (00741836)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2023-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
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| Keywords | tandem duplication / 次世代シークエンサー / 口腔癌抗癌剤耐性 / 次世代シーケンサー / tandem duplicator （ TD ） / スーパーエンハンサー領域 / tandem duplicator / 抗癌剤耐性 / 口腔癌 |
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| Outline of Research at the Start |
2019～2020年度の若手研究において、放射線抵抗性細胞の全ゲノムの検索と
tandem duplicatorの存在を同定し、ゲノム上にマッピングした。さらに、放射線抵抗性 tandem duplicatorを形成する遺伝子の検索を行い、放射線抵抗性が成立するための遺伝子機能の組み合わせの検索・同定を行った。今回は、抗癌剤耐性細胞、分子標的薬耐性細胞を用いて、全ゲノム上における解析によりtandem duplicatorがどのような遺伝子で起きているかを検討し、その分布状態を明らかにし、薬剤抵抗性獲得にどのように関与しているのかを明らかにする。
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| Outline of Final Research Achievements |
We evaluated tandem duplications (TDs) in cetuximab-resistant OSCC cells (SAS-R) and parental OSCC cells (SAS) using NovaSeq 6000 system and DELLY software. We found 941 TD regions in SAS-P and 783 TD regions in SAS-R. Moreover, SAS-R-specific TDs were identified in 10 regions and 17 genes were located in their regions. Among these genes, NLR family pyrin domain containing 7 (NLRP7) was significantly upregulated in cetuximab-resistant OSCC cells of our microarray (GSE114928). Analyzing the relationship between TDs formation and these genes could contribute to a new strategy for overcoming cetuximab resistance.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究のような「系統的に全ゲノム上の遺伝子の発現を制御し，発生，分化，疾患成立，治療抵抗性などに関与しているシステム」の研究が開始されて創薬も絡んだ研究に発展している．本研究も，系統的な複数の遺伝子機能の組み合わせが系統的に疾患を成立させ，各種機能を制御・決定すると考えた点に大きな発想の転換がある．まさに，新規医学・医療技術の開拓を目指した研究であり，臨床応用を見据えた非常に優れた研究である．担癌患者の長期社会復帰などを実現させる可能性があり，社会的意義も大きい．
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