Investigation for unrevealed lytic pathway of polysaccharides initiated with oxidation of a hydroxyl group
Project/Area Number |
21K19070
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Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
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Research Institution | Niigata University |
Principal Investigator |
北岡 本光 新潟大学, 自然科学系, 教授 (60353984)
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Project Period (FY) |
2021-07-09 – 2024-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2022)
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Budget Amount *help |
¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2021: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
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Keywords | β脱離 / セルロース / 酸化 / セロビオースホスホリラーゼ / ピラノースオキシダーゼ / 多糖分解 / 酸化酵素 / LPMO |
Outline of Research at the Start |
酵素によるグリコシル結合の分解は、通常グリコシド結合に直接作用する酵素により行われる。本研究では、1-デオキシ-2-ケトセロビオースに見出されたβ脱離によるグリコシド結合の自発分解が、セルロースのグリコシル結合に直接関与しない水酸基の酸化に起因した自発分解として普遍的に観測できる現象であるかを、モデル化合物を調製することにより検証する。さらに、水酸基の酵素酸化反応がセルロースなどの結晶性多糖分解へ寄与している実例について探索する。
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Outline of Annual Research Achievements |
2021年度に合成に成功した還元末端2位が酸化されたセルロースのモデル化合物である2-ケトセロビオースの中性条件下での分解速度を評価した。2-ケトセロビオースは、中性常温下においてグルコースを遊離して分解した。還元末端側残基はギ酸と考えられる有機酸を遊離してさらに分解が進行しており、六単糖誘導体は単離できなかった。pH7.0, 30℃における半減期は103時間であり、1-デオキシ-2-ケトセロビオースの約1/6程度の速度でβ脱離により分解した。pHおよび温度依存性は1-デオキシ-2-ケトセロビオースと同じ傾向を示した。両者の分解速度の違いは、1-デオキシ-2-ケトセロビオースには見られない2,6-環状化合物および2,5-環状化合物の存在による2位のヘミアセタール化により説明可能であり、2位の未修飾カルボニル基の存在により4位のβ脱離反応が促進されていることが証明された。 還元末端の2位が酸化された、2’-ケトセロビオースおよび中間残基の2位が酸化された、2’-ケトセロトリオース誘導体をホスホリラーゼ系酵素の合成反応により行うことを計画した。酵素合成の基質となる2種の活性化2-ケトグルコース誘導体を酵素合成した。2-ケトグルコシルフルオリドはピラノースオキシダーゼによるα-グルコシルフルオリドの酸化により調製した。また、2-ケト-α-グルコース1-リン酸を、2-ケトグルコースからN-アセチルヘキソサミン1-キナーゼを用いて合成した。両者とも合成された化合物の2位のカルボニル基は水和されていた。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初目的としていた、還元末端2位酸化モデル化合物の中性常温下の分解速度の解析に成功するとともに、非還元末端および中間残基2位酸化モデル化合物酵素合成の基質となる2種の化合物の酵素合成に当初の予定通り成功しているため。
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Strategy for Future Research Activity |
2022年度に調製した2-ケトグルコシルフルオリドまたは2-ケト-α-グルコース1-リン酸を基質として、セロビオースホスホリラーゼ、セロデキストリンホスホリラーゼ、マンノシルβ1,4-グルコースホスホリラーゼのいずれかの酵素を用いることにより、2’-ケトセロビオース誘導体を合成する。さらにセロデキストリンホスホリラーゼにより異分子グルコースを伸長することにより2’-ケトセロトリオース誘導体を調製する。これらの糖の中性条件下での分解特性を調べるとともに分解産物のNMRでの同定を行う。分解産物のNMRでの同定に成功すれば、数種のLPMO等の酸化酵素による反応解析を試みる。セロオリゴ糖に作用させたときの生成物をNMRで確認することにより、結合位置以外を酸化している可能性について検討する。
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Report
(2 results)
Research Products
(1 results)