• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Tracing the evolution of CAM-type photosynthesis: modification of carbon dioxide fixation of crops by genome editing

Research Project

Project/Area Number 21K19120
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 39:Agricultural and environmental biology and related fields
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

Agarie Sakae  九州大学, 農学研究院, 教授 (50304879)

Project Period (FY) 2021-07-09 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
KeywordsCAM / 概日リズム / ゲノム編集 / 光合成 / シスエレメント / DMS-PCR / プライム編集 / C3 / DMS-seq / アイスプラント / 遺伝子組み換え / CAM型光合成 / C3型光合成
Outline of Research at the Start

本研究は,作物の光合成をCAM(Crassulacean Acid Metabolism)型に改変して,耐乾性及び耐塩性を持たせることを目的とする。CAMはサボテンなどが行う光合成の一様式で,夜に気孔を開き昼は気孔が閉じる。そのため,耐乾性及び耐塩性が他の光合成型の植物より著しく高い。作物(C3植物)にCAMを駆動させるために,C3植物にCAM関連遺伝子を導入する従来法に加え,C3植物が本来持っているCAM遺伝子の発現調節部位を編集して,発現する時間を変化させる。これまでのCAM遺伝子の転写調節機構に関する知見を用い,最新のゲノム機能解析やゲノム編集技術をあわせ,炭酸固定機能の改変を試みる。

Outline of Final Research Achievements

This research aims to modify crop photosynthesis to confer extreme drought and salt tolerance. To introduce CAM into C3 plants, the researchers will edit the transcriptional regulatory sequences of CAM genes in C3 plants to place the associated genes under the control of clock genes. To identify the editing sites, they will identify cis-elements and transcription factors that control CAM gene expression and elucidate the factors required for CAM activation. They identified transcriptional regulators of CAM-related genes in C3 plants and identified sequences to be modified by genome editing. They also created vectors for prime editing and identified cis-factors and transcription factors involved in the C3-CAM transition in the common ice plant.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

CAM植物はC3植物から進化したと考えられている。C3植物のもつCAM光合成遺伝子はCAM植物と同じ反応を触媒するが,発現する時間が異なる。CAM型光合成の進化は,生物時計の制御する転写調節機構を獲得した過程とみなされる。本研究は,新しいゲノム機能解析及びゲノム編集技術を駆使して,植物が本来もっている遺伝子の発現調節部位に比較的小さな変異を挿入して炭酸固定能を改変しようとした。その成果は,ストレス耐性作物の創出,CAMの進化過程の分子機構及びCAMの生理学的意義の解明等にとって重要な知見となる。光合成の進化の過程を追認し再現するという挑戦的研究として高い可能性を有する研究である。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (28 results)

All 2024 2023 2022 2021 Other

All Journal Article (4 results) (of which Open Access: 2 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (22 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] A whole-genome shotgun assembly for genome characterization of the common ice plant (Mesembryanthemum crystallinum L.)2022

    • Author(s)
      Sato, R., Kondo, Y., and Agarie, S.
    • Journal Title

      Research Square

      Volume: 1 Pages: 1-2

    • DOI

      10.21203/rs.3.rs-2013540/v1

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Open Access
  • [Journal Article] NaCl-promoted respiration and cell division in halophilism of a halophyte, the common ice plant Mesembryanthemum crystallinum L.2022

    • Author(s)
      Sato, R., Tran, D.Q., Yoshida, K., Dang, J., Konishi, A., Ohnishi, S., Cushman, J.C. and Agarie, S.
    • Journal Title

      Journal of the Faculty of Agriculture, Kyushu University

      Volume: 67 Pages: 153-164

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Journal Article] Microbiology associated with disease on white lotus (Nelumbo nucifera Gaertn.) and application of silver nanoparticles for the control of plant pathogens In vitro2022

    • Author(s)
      Vu, N.Q.H., Quang, H.T., Hong, H.T.K. and Agarie
    • Journal Title

      Journal of the Faculty of Agriculture, Kyushu University

      Volume: 67 Pages: 165-172

    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Journal Article] Potential of Halophyte as a Crop and Genetic Resource2021

    • Author(s)
      Agarie Sakae、Sato Ryoma、Saito Kazuyuki、Morokuma Masahiro
    • Journal Title

      Japanese Journal of Crop Science

      Volume: 90 Issue: 4 Pages: 373-381

    • DOI

      10.1626/jcs.90.373

    • NAID

      40022741559

    • ISSN
      0011-1848, 1349-0990
    • Year and Date
      2021-10-05
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] アイスプラントCAM 型光合成関連遺伝子の発現制御機構に関する研究2024

    • Author(s)
      近藤侑梨・佐藤稜真・東江栄・齋藤和幸
    • Organizer
      第65回日本植物生理学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 通性CAM植物アイスプラントのC3-CAM光合成変換を制御する遺伝子群の網羅的探索2023

    • Author(s)
      佐藤稜真・竹内敬香・近藤侑梨・John C. Cushman・平川秀樹・磯部祥子・白澤健太・齋藤和幸・東江 栄
    • Organizer
      第13回 日本光合成学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] アイスプラントの地上部再分化に関わる要因解析2023

    • Author(s)
      神田れんげ・大串康太・佐藤稜真・東江栄
    • Organizer
      第40回 日本植物バイオテクノロジー学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] トランスクリプトーム解析を用いたイネの概日時計制御下にある遺伝子及び発現制御因子の探索2023

    • Author(s)
      佐藤稜真・宗岡真美・高木若葉・齋藤和幸・東江 栄
    • Organizer
      第256回日本作物学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] DMS法及びバイサルファイト法によるCAM型光合成関連遺伝子の発現制御機構の解明2023

    • Author(s)
      近藤侑梨・佐藤稜真・Cushman John C.・齋藤和幸・東江 栄
    • Organizer
      第256回日本作物学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] イネのRubisco小サブユニット遺伝子の窒素に応答した発現制御における転写因子OsDREB1Gの役割2023

    • Author(s)
      宇都宮花菜子・北川桜子・脇紀元・髙倉脩・東江 栄・齋藤和幸
    • Organizer
      第256回日本作物学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Updated chromosome-level complete genome of Mesembryanthemum crystallinum L.: insights into genome structure, molecular evolution, and non-coding regions.2023

    • Author(s)
      Ryoma Sato, Kyoka Takeuchi, Yuri Kondo, Hideki Hirakawa, Sachiko Isobe, Kenta Shirasawa, and Sakae Agarie
    • Organizer
      Taiwan-Japan Plant Biology 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DMS法によるアイスプラントCAM関連遺伝子の発現制御領域の同定2023

    • Author(s)
      近藤侑梨, 佐藤稜真, 竹内敬香, John Cushman, 齋藤和幸, 東江 栄
    • Organizer
      第255回日本作物学会講演会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] トランスクリプトーム解析によるアイスプラントのCAM型光合成駆動を制御する遺伝子群の探索2023

    • Author(s)
      佐藤稜真, 竹内敬香, 近藤侑梨, John Cushman, 齋藤和幸, 東江 栄
    • Organizer
      第255回日本作物学会講演会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] イネにおけるヒストンアセチル化酵素GCN5を介した窒素によるRubisco小サブユニット遺伝子の発現制御機構2023

    • Author(s)
      髙倉 脩, 余 文軒, 宇都宮花菜子, 東江 栄, 齋藤和幸
    • Organizer
      第255回日本作物学会講演会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] 塩生植物アイスプラントの光合成における好塩性2023

    • Author(s)
      吉田和貴, 齋藤和幸, 川満芳信, 東江 栄
    • Organizer
      第255回日本作物学会講演会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] ショートリードを用いたアイスプラントにおけるde novo ゲノムアセンブル法の確立2022

    • Author(s)
      佐藤稜真・近藤侑梨・John C. Cushman・齋藤和幸・東江栄
    • Organizer
      第253回日本作物学会講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] アイスプラントの機能性に対する緑色光の効果2022

    • Author(s)
      大林拓司・小槙誠人・工藤りか・斎藤和幸・東江栄
    • Organizer
      第253回日本作物学会講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 機能ゲノミクスを用いたエレオカリス(Eleocharis vivipara)における光合成変換機構関連遺伝子の解析2022

    • Author(s)
      吉田侃生・佐藤稜真・齋藤和幸・上野修・東江栄
    • Organizer
      第253回日本作物学会講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 機能ゲノミクスを用いたアイスプラントの好塩性機構の解明2022

    • Author(s)
      佐藤稜真・党健・近藤侑梨・John C. Cushman・齋藤和幸・東江栄
    • Organizer
      第253回日本作物学会講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] アイスプラントのNaClによる呼吸と細胞分裂の促進2022

    • Author(s)
      党健・Dan Q Tran・佐藤稜真・吉田和貴・小西絢・大西茂彦・John C. Cushman・Hoang Thi Kim Hong・齋藤和幸・東江栄
    • Organizer
      第253回日本作物学会講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 作物の好塩性機構2022

    • Author(s)
      東江栄
    • Organizer
      第253回日本作物学会講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 機能性を高めたアイスプラント新品種の開発2022

    • Author(s)
      大林 拓司・小槙 誠人・福崎 詩織・斎藤 和幸・東江 栄
    • Organizer
      第253回日本作物学会講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Chloroplast protein expression on two dimension electronic analysis (2DE) gels from ice plant under normal and drought stressed conditions2022

    • Author(s)
      Hoang Thi Kim Hong, Matthew D. Wheatley, Sakae Agarie, John C. Cushman
    • Organizer
      第253回日本作物学会講演会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Transcriptional Regulation of the Stress-Inducible Photosynthesis in the Common Ice Plant, Mesembryanthemum crystallinum L.2022

    • Author(s)
      Sakae Agarie, Kento Kuroda, Kasumi Nishikawa, Nanako Isshiki, Yoko Ide, Kazuyuki Saito, John C. Cushman
    • Organizer
      The 10th Asian Crop Science Association Conference
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] NaCl-Stimulated ATP Synthesis in a Halophyte (Mesembryanthemum crystallinum L.)2022

    • Author(s)
      Ryoma Sato, Kazuki Yoshida, Ayako Konishi, Dan Q. Tran, Kazuyuki Saito, John C. Cushman, Sakae Agarie
    • Organizer
      The 10th Asian Crop Science Association Conference
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Engineering CAM Traits into C3 crops2022

    • Author(s)
      Aoi Saito, Mie Wakabayashi, Shiori Terai, Shiori Yamabe, Satoko Kobayashi, Kazuyuki Saito, John C. Cushman, Sakae Agarie
    • Organizer
      The 10th Asian Crop Science Association Conference
    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Book] 植物バイオサイエンス2021

    • Author(s)
      川満 芳信・実岡 寛文編著・東江 栄・上田 晃弘・菊田 真由実・齋藤 和幸・諏訪 竜一・冨永 るみ・長岡 俊徳
    • Total Pages
      208
    • Publisher
      共立出版
    • ISBN
      9784320058323
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Remarks] 植物生産生理学研究室 九州大学農学部/大学院生物資源環境科学府

    • URL

      https://www.agr.kyushu-u.ac.jp/lab/shokusei/

    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2021-07-13   Modified: 2025-01-30  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi