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Structural biology studies on the effect of phospholipid contents for multi-drug transporters

Research Project

Project/Area Number 21K19333
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 47:Pharmaceutical sciences and related fields
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Kato Hiroaki  京都大学, 薬学研究科, 教授 (90204487)

Project Period (FY) 2021-07-09 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Keywords構造生物学 / 構造薬理学 / 膜タンパク質 / リン脂質膜 / トランスポーター / 多剤耐性 / リン脂質
Outline of Research at the Start

本研究では、ナノディスクに挿入した多剤排出トランスポーターが同一化合物に対して異なる薬理学的な挙動を示した原因がリン脂質組成の違いによることを詳細な立体構造解析と薬理学的機能解析によって明らかにするものである。この研究により、膜タンパク質の立体構造とその作用メカニズム対して脂質膜環境が果たしている役割が解明できるものと期待される。

Outline of Final Research Achievements

We have established a system that reconstitutes nanodiscs with phospholipids of various cell membrane compositions by targeting two types of multidrug efflux transporters, ABCB1 and ABCG2. Then, the ATP hydrolysis activity in the Nanodisc was measured. As a result, we were able to measure in detail the difference in specific activity between the presence and absence of the transport substrate. Furthermore, when we performed single-particle (CryoEM) analysis using cryogenic electron microscopy using these nanodiscs, we observed electron microscopic images that enable structure determination at 4A resolution. Therefore, as a result of conducting a three-dimensional structure analysis, we succeeded in constructing a molecular structure model.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

これまでCryoEMで立体構造解析されたことがない、2種類のABC多剤排出トランスポーターの立体構造を解析することに初めて成功した。好熱性真核生物Cyanidioschyzon merolae由来のABC多剤排出トランスポーターCmABCB1については、界面活性剤ミセル中に溶解した状態についてX線結晶構造が、すでに我々によって決定されていたことから、界面活性剤中とリン脂質膜中のCmABCB1の立体構造比較が可能となり、今後、両状態での立体構造の違いが明らかになれば、リン脂質と膜タンパク質の相互作用について新たな知見が得られるものと期待される。

Report

(3 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Structure‐based alteration of tryptophan residues of the multidrug transporter <scp>CmABCB1</scp> to assess substrate binding using fluorescence spectroscopy2022

    • Author(s)
      Inoue Yoshiki、Yamaguchi Tomohiro、Otsuka Tetsuo、Utsunomiya Yuto、Pan Dongqing、Ogawa Haruo、Kato Hiroaki
    • Journal Title

      Protein Science

      Volume: 31 Issue: 6

    • DOI

      10.1002/pro.4331

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of CmABCB1 multi-drug exporter in lipidic mesophase revealed by LCP-SFX2021

    • Author(s)
      Pan Dongqing、Oyama Ryo、Sato Tomomi、Nakane Takanori、Mizunuma Ryo、Matsuoka Keita、Joti Yasumasa、Tono Kensuke、Nango Eriko、Iwata So、Nakatsu Toru、Kato Hiroaki
    • Journal Title

      IUCrJ

      Volume: 9 Issue: 1 Pages: 134-145

    • DOI

      10.1107/s2052252521011611

    • NAID

      120007179308

    • Related Report
      2021 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ABCトランスポーターのリン脂質膜中と界面活性剤中における薬物親和性の違い2022

    • Author(s)
      相良優介、水沼 諒、小川治夫、加藤博章
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] X線結晶解析によるABCトランスポーターの多剤認識メカニズム2022

    • Author(s)
      水沼 諒、小田島 圭、三和 空知、瀧川 紘、高須 清誠、小川 治夫、加藤 博章
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] クライオ電子顕微鏡によるABC多剤排出トランスポーターと基質複合体の単粒子構造解析2022

    • Author(s)
      坂口 俊平、水沼 諒、宮田 知子、牧野 文信、難波 啓一、小川 治夫、加藤 博章
    • Organizer
      第43回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ABC多剤排出トランスポーターのCryo-EMによる構造解析2021

    • Author(s)
      坂口 俊平、水沼 諒、小川 治夫、加藤 博章
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] 立体構造に基づいたABC多剤排出トランスポーターCmABCB1の基質輸送に関わる残基の役割2021

    • Author(s)
      水沼 諒、潘 東青、小川 治夫、加藤 博章
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report
  • [Presentation] Candida albicansの多剤排出ABCトランスポーターCdr1pのクライオ電顕による単粒子解析2021

    • Author(s)
      潘 東青、筒井 隼一、宮田 知子、牧野 文信、難波 啓一、小川 治夫、加藤 博章
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
    • Related Report
      2021 Research-status Report

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Published: 2021-07-13   Modified: 2024-01-30  

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