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Comprehensive approach for isolation and characterization of viruses in wildlife

Research Project

Project/Area Number 21K19619
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 58:Society medicine, nursing, and related fields
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

Michihito Sasaki  北海道大学, 人獣共通感染症国際共同研究所, 講師 (70609403)

Project Period (FY) 2021-07-09 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2021: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Keywordsウイルス分離 / ロタウイルス / オルソレオウイルス / 病原性解析 / フルゲノム解析 / ウイルス遺伝子型分類 / ザンビア / インドネシア / 哺乳類オルソレオウイルス / 病原性 / 動物モデル / 肺炎 / ネルソンベイオルソレオウイルス / ヒト小腸モデル / シアル酸 / 野生動物 / TMPRSS2 / TMPRSS11D / 新規ウイルス / プロテアーゼ / 宿主指向性
Outline of Research at the Start

次世代シーケンサーを用いた網羅的核酸検出手法(メタゲノム解析)の普及に伴い、多様な新規ウイルスの検出が相次いでいる。新規ウイルスを対象とした研究の多くはウイルスゲノム塩基配列解析にとどまり、感染性ウイルスの分離を経て、その病原性や宿主域、自然界における存続様式といった解析まで至るものは少ない。本研究では、研究代表者が樹立した宿主プロテアーゼ強制発現細胞へ野生動物サンプルを接種し、公衆衛生上重要なウイルスを多く含むプロテアーゼ依存性ウイルスの分離を試みる。分離したウイルスの細胞指向性や病原性を解析し、ウイルスの自然界における存続様式や公衆衛生学的リスクを考察する。

Outline of Final Research Achievements

Next-generation sequencing approach enables us to easily detect viral genome sequences in various materials, whereas limited studies have gone beyond isolation of infectious viruses to characterize their virological properties such as cell tropism, host range, and pathogenicity. In this study, we isolated rotaviruses from Mastomys rodents and fruit bats in Zambia by using a newly established cell line overexpressing serine protease genes that promote infection of respiratory and gastrointestinal viruses. We also isolated Nelson Bay orthoreoviruses and mammalian orthoreoviruses from fruit bats in Indonesia. The isolated viruses were characterized by whole genome sequence analysis, growth kinetics analysis in cultured cells and animal experiments.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

研究代表者が作出したプロテアーゼ恒常発現細胞を用いて、ザンビアに生息する野生動物からロタウイルス分離に成功し、本細胞がロタウイルスの分離に有用であることが示された。コウモリの糞便から分離したロタウイルスが別種の動物(実験用マウス)に下痢症を引き起こすこと、ヒト小腸上皮細胞に感染、増殖することを明らかにし、ロタウイルスの種間伝播に関して重要な知見が得られた。また、これまで哺乳類オルソレオウイルスが東南アジアで検出されたことはなく、インドネシアに生息するコウモリから哺乳類オルソレオウイルスを分離した本研究は、東南アジアにおける哺乳類オルソレオウイルスの初検出報告となる。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • 2021 Research-status Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (7 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] ボゴール農業大学(インドネシア)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] アイルランド国立大学ダブリン校(アイルランド)

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  • [Int'l Joint Research] ボゴール農業大学(インドネシア)

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      2022 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] ザンビア大学(ザンビア)

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  • [Int'l Joint Research] アイルランド国立大学ダブリン校(アイルランド)

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      2022 Research-status Report
  • [Int'l Joint Research] ザンビア大学(ザンビア)

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  • [Int'l Joint Research] ボゴール農業大学(インドネシア)

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      2021 Research-status Report
  • [Journal Article] Isolation and Characterization of Distinct Rotavirus A in Bat and Rodent Hosts2023

    • Author(s)
      Kishimoto M, Kajihara M, Tabata K, Itakura Y, Toba S, Ozono S, Sato Y, Suzuki T, Ito N, Changula K, Qiu Y, Mori-Kajihara A, Eto Y, Harima H, Mwizabi D, Hang’ombe BM, Hall WW, Takada A, Orba Y, Sawa H, Sasaki M
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 97 Issue: 1

    • DOI

      10.1128/jvi.01455-22

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Isolation and characterization of an orthoreovirus from Indonesian fruit bats2022

    • Author(s)
      Intaruck Kittiya、Itakura Yukari、Kishimoto Mai、Chambaro Herman M.、Setiyono Agus、Handharyani Ekowati、Uemura Kentaro、Harima Hayato、Taniguchi Satoshi、Saijo Masayuki、Kimura Takashi、Orba Yasuko、Sawa Hirofumi、Sasaki Michihito
    • Journal Title

      Virology

      Volume: 575 Pages: 10-19

    • DOI

      10.1016/j.virol.2022.08.003

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Isolation and characterization of Mammalian Orthoreovirus from Pteropus vampyrus bats in Indonesia2023

    • Author(s)
      Kittiya Intaruck, Mai Kishimoto, Yukari Itakurai, Koshiro Tabata, Agus Setiyono, Ekowati Handharyani, Yasuko Orba, Hirofumi Sawa, Michihito Sasaki
    • Organizer
      第70回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Isolation and characterization of Mammalian Orthoreovirus from Pteropus vampyrus bats in Indonesia2023

    • Author(s)
      Kittiya Intaruck, Koshiro Tabata, Yukari Itakura, Nijiho Kawaguchi, Mai Kishimoto, Agus Setiyono, Ekowati Handharyani, Yasuko Orba, Hirofumi Sawa, Michihito Sasaki
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] ザンビアのエジプトルーセットオオコウモリおよびマストミスから分離されたロタウイルスAの性状解析2023

    • Author(s)
      岸本麻衣、梶原将大、高田礼人、大園誠也、鈴木忠樹、伊藤直人、大場靖子、澤洋文、佐々木道仁
    • Organizer
      第166回日本獣医学会学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Characterization and seroprevalence of a new Nelson Bay orthoreovirus isolated from Indonesian fruit bats2022

    • Author(s)
      Kittiya Intaruck, Yukari Itakura, Mai Kishimoto, Herman Moses Chambaro, Takashi Kimura, Yasuko Orba, Hirofumi Sawa, Michihito Sasaki.
    • Organizer
      The 10th Sapporo Summer Seminar for One Health (SaSSOH)
    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Characterization and serological study of Nelson Bay orthoreovirus isolated from Indonesian fruit bats2022

    • Author(s)
      Kittiya Intaruck, Yukari Itakura, Mai Kishimoto, Herman Moses Chambaro, Agus Setiyono, Ekowati Handharyani, Kentaro Uemura, Hayato Harima, Yasuko Orba, Hirofumi Sawa, Michihito Sasaki.
    • Organizer
      第69回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report
  • [Presentation] ウイルス分離先行型スクリーニングにより分離された野生動物由来ロタウイルスAの性状解析2022

    • Author(s)
      岸本 麻衣、梶原 将大、高田 礼人、伊藤 直人、大場 靖子、澤 洋文、佐々木 道仁
    • Organizer
      第69回日本ウイルス学会学術集会
    • Related Report
      2022 Research-status Report

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Published: 2021-07-13   Modified: 2025-01-30  

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