| Project Area | ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援 |
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221S0002
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Institution | National Institute of Genetics |
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Principal Investigator |
KOHARA Yuji 国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 特任教授 (70135292)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
KATO Kazuto 大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (10202011)
TOYODA Atsushi 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 特任准教授 (10267495)
KUROKI Yoko 東北大学, 東北メディカルメガバンク機構, 非常勤講師 (10344037)
SUGANO Sumio 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (60162848)
SUZUKI Yutaka 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (40323646)
HAYASHI Tetsuya 九州大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (10173014)
YAMAMOTO Ken 久留米大学, 医学部, 教授 (60274528)
TSUJI Shoji 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (70150612)
INOUE Ituro 国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 教授 (00192500)
KUROKAWA Ken 東京工業大学, 地球生命研究所, 教授 (20343246)
MORISHITA Shinichi 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (90292854)
NAKAMURA Yasukazu 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 教授 (60370920)
TABATA Satoshi 公益財団法人かずさDNA研究所, その他部局, 所長 (70197549)
KUHARA Satoshi 九州大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (00153320)
IWASAKI Wataru 東京大学, 大学院理学系研究科, 准教授 (50545019)
SESE Jun 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 創薬基盤研究部門, 主任研究員 (40361539)
TAKAHASHI Hiroki 千葉大学, 真菌医学研究センター, 准教授 (60548460)
ASAI Kiyoshi 東京大学, 新領域創成科学研究科, 教授 (30356357)
KASAHARA Masahiro 東京大学, 新領域創成科学研究科, 講師 (60376605)
SAKAKIBARA Yasubumi 慶應義塾大学, 理工学部, 教授 (10287427)
YADA Tetsushi 九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 教授 (10322728)
桑野 良三 新潟大学, 脳研究所, フェロー (20111734)
徳永 勝士 東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (40163977)
小笠原 直毅 奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (10110553)
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| Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) |
YAMAGATA Zentaro 山梨大学, 大学院医学工学総合研究部, 教授 (10210337)
MUTO Kaori 東京大学, 医科学研究所, 教授 (50345766)
IDA Ryuichi 同志社大学, 大学院グローバルスタディーズ研究科, 特別客員教授 (40127543)
MASUI Tohru 慶應義塾大学, 医学部臨床遺伝学センター, 教授 (50150082)
KURIYAMA Mariko 独立行政法人国立成育医療研究センター, 共同研究員
TAKAGI Toshihisa 東京大学, 大学院理学系研究科, 教授 (30110836)
FUJIYAMA Asao 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 教授 (60142311)
HATTORI Masahira 早稲田大学, 理工学術院, 教授 (70175537)
OGURA Yoshitoshi 九州大学, 大学院医学研究院, 准教授 (40363585)
TOKUNAGA Katsushi 東京大学, 大学院医学系研究科, 教授 (40163977)
KUWANO Ryozo 新潟大学, 脳研究所, フェロー (20111734)
OHASHI Jun 東京大学, 大学院理学系研究科, 准教授 (80301141)
ITOH Takehiko 東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 教授 (90501106)
HIRAKAWA Hideki かずさDNA研究所, 研究員 (80372746)
NOGUCHI Hideki 国立遺伝学研究所, 先端ゲノミクス推進センター, 特任准教授 (50333349)
MATSUOKA Satoshi 東京工業大学, 学術国際情報センター, 教授 (20221583)
OGASAWARA Naotake 奈良先端科学技術大学院大学, 学長 (10110553)
NAKAMURA Kensuke 前橋工科大学, 生命情報学科, 教授 (20212095)
HAMADA Michiaki 早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (00596538)
KANAYA Shigehiko 奈良先端科学技術大学院大学, 教授 (90224584)
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| Research Collaborator |
ANZAI Yuichiro 慶應義塾大学, 理工学部, 教授
OKADA Kiyotaka 自然科学研究機構, 理事
SAKAKI Yoshiyuki 静岡雙葉学園, 理事長
TAKAKU Fumimaro 日本医学会, 会長
TOYOSHIMA Kumao 理化学研究所, 研究顧問
NAKAMURA Keiko JT生命誌研究館, 館長
HOTTA Yoshiki (財)井上科学振興財団, 理事長
YONEZAWA Akinori 千葉工業大学, 人工知能・ソフトウェア技術研究センター, 所長
YOSHIKAWA Hiroshi 大阪大学, 名誉教授
YOSHIDA Mitsuaki (財)がん研究会, 理事
INOKO Hidetoshi 東海大学, 医学部, 教授
TODA Tatsushi 神戸大学, 大学院医学研究科, 教授
INAZAWA Johji 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授
GOJOBORI Takashi 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 教授
URUSHIHARA Hideko 筑波大学, 教授・名誉教授
TAKEDA Hiroyuki 東京大学, 大学院理学研究科, 教授
SHIROISHI Toshihiko 国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 教授
ITOH Takashi 九州大学, 大学院医学研究院, 教授
SATOH Noriyuki 沖縄科学技術大学院大学, 教授
MATSUDA Hideo 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 教授
GOTO Susumu 京都大学, 化学研究所, 准教授
TSUDA Masataka 東北大学, 大学院生命科学研究科, 教授
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| Project Period (FY) |
2010-04-01 – 2016-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2015)
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| Keywords | 次世代DNAシーケンサー / RNA-seq / ChIP-seq / de novo配列決定 / 個人ゲノム / リシーケンシング / GWAS / インフォームドコンセント / 次世代DNAシーケンサ |
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| Outline of Final Research Achievements |
We have provided technologies of large scale and high quality genomics and bioinformatics to many KAKENHI projects, 60 to 90 subjects every year and altogether 464 subjects, based on application and selection. This kind of support became possible by concentrating to a limited number of DNA sequencing centers under the situation that there was unexpectedly fast advancement of these technologies in the world. Our activity has led to 363 papers including the Coelacanth genome paper. The KAKENHI subjects that we supported cover all the KAKENHI items and almost divisions of life science domain. Furthermore, we have developed new methodologies to solve the problems that emerged from the support activity : One of them is the genome assembly software PLATANUS that has become a key method to decipher difficult genomes. Such a virtuous circle and the outcome show that the platform is essential and effective in life sciences.
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