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User Interface for 3D Bio-medical Image Visualization and Segmentation

Research Project

Project/Area Number 22700115
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Media informatics/Database
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

IJIRI Takashi  独立行政法人理化学研究所, 生物情報基盤構築チーム, 特別研究員 (30550347)

Project Period (FY) 2010 – 2011
Project Status Completed (Fiscal Year 2011)
Budget Amount *help
¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2011: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2010: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Keywordsコンピュータグラフィクス / ユーザインタフェース / 画像処理 / 可視化 / Volume image visualization / Volume image segmentation / User interface / Compuer Graphics / volume image visualization / user interface / Computer graphics
Research Abstract

We have presented novel user interfaces and algorithms for intuitively visualizing and segmenting three dimensional bio-medical images. We have developed a curved cross sections-based visualization tool, an axis-based segmentation tool for linear-shaped organs, and a contour-based tool for refining segmentation data. All tools are integrated into one software application, named V-Tracer. We have begun using it in medical institutions for several collaborative projects.

Report

(3 results)
  • 2011 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (33 results)

All 2012 2011 2010 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (22 results) Remarks (3 results) Patent(Industrial Property Rights) (4 results)

  • [Journal Article] Contour-based Interface for Refining Volume Segmentation2010

    • Author(s)
      Takashi Ijiri and Hideo Yokota
    • Journal Title

      Computer Graphics Forum

      Volume: 7 Pages: 2153-2160

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      井尻敬,高山健志,横田秀夫,五十嵐健夫
    • Journal Title

      映像情報メディア学会誌

      Volume: 64 Pages: 183-187

    • NAID

      110009669407

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  • [Journal Article] 柔軟物体のためのアニメーションデザイン手法2010

    • Author(s)
      井尻敬, 高山健志, 横田秀夫, 五十嵐健夫
    • Journal Title

      映像情報メディア学会誌

      Volume: 64, 2 Pages: 183-187

    • NAID

      110009669407

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      2010 Annual Research Report
  • [Journal Article] Contour-based Interface for Refining Volume Segmentation2010

    • Author(s)
      Takashi Ijiri, Hideo Yokota
    • Journal Title

      Computer Graphics Forum

      Volume: 29, 7 Pages: 2153-2160

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      井尻敬, 佐藤雄, 横田秀夫, 伊藤雅昭
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      バイオメディカルエンジニアリングワークショップ
    • Place of Presentation
      沖縄県宮古島市
    • Year and Date
      2012-02-26
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  • [Presentation] Shape Matching法を用いた心臓拍動の計算手法2011

    • Author(s)
      井尻敬,芦原貴司,梅谷信行,原口亮,横田秀夫,五十嵐健夫,中沢一雄
    • Organizer
      日本機械学会バイオエンジニアリング部門生物機械システム研究会
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2011-12-12
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      井尻敬, 芦原貴司, 梅谷信行, 原口亮, 横田秀夫, 五十嵐健夫, 中沢一雄
    • Organizer
      生物機械システム研究会(日本機械学会バイオエンジニアリング部門)
    • Place of Presentation
      大阪府吹田市
    • Year and Date
      2011-12-12
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      Takashi Ijiri, Takashi Ashihara, Nobuyuki Umetani, Takeo Igarashi, Ryo Haraguchi, Hideo Yokota, Kazuo Nakazawa
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      23rd Conference of the Society for Medical Innovation and Technology
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      Tel Aviv, Israel
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      上野大樹,井尻敬,井上雅弘,田尻雄大,大古美治,槙山和秀,山中弘行,佐野太,林成彦,中井川昇,小川毅彦,上村博司,矢尾正祐,窪田吉信
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      奈良先端科学技術大学
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      上野大樹, 井尻敬, 井上雅弘, 田尻雄大, 大古美治, 槙山和秀, 山中弘行, 佐野太, 林成彦, 中井川昇, 小川毅彦, 上村博司, 矢尾正祐, 窪田吉信
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      日本VR医学会,第11回大会
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      奈良県生駒市
    • Year and Date
      2011-08-27
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      井尻敬, 芦原貴司, 梅谷信行, 原口亮, 横田秀夫, 五十嵐健夫, 中沢一雄
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      第50回日本生体医工学会大会
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      東京都
    • Year and Date
      2011-04-29
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      Tel Aviv, Israel
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      井尻敬,芦原貴司,梅谷信行,原口亮,横田秀夫,五十嵐健夫,中沢一雄
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      第50回日本生体医工学会大会
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      東京電機大学
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  • [Presentation] 輪郭線編集による三次元抽出領域の修正インタフェース2011

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      井尻敬,横田秀夫
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      VCADシンポジウム
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      理化学研究所
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  • [Presentation] インタラクティブな心臓拍動シミュレーション2011

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      井尻敬,芦原貴司,梅谷信行,原口亮,横田秀夫,五十嵐健夫,中沢一雄
    • Organizer
      バイオメディカルインタフェースワークショップ
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      宮古島
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  • [Presentation] 三次元肛門管の領域抽出法の開発2011

    • Author(s)
      佐藤雄,井尻敬,小林達伺,横田秀夫,伊藤雅昭
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      バイオメディカルインタフェースワークショップ
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      宮古島
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  • [Presentation] 輪郭編集による三次元抽出領域の修正インタフェース2011

    • Author(s)
      井尻敬,横田秀夫
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      情報処理学会グラフィクスとCAD研究会第142回研究発表会
    • Place of Presentation
      慶応義塾大学
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  • [Presentation] インタラクティブな心臓の拍動シミュレーション手法2010

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      井尻敬, 芦原貴司, 梅谷信行, 原口亮, 横田秀夫, 五十嵐健夫, 中沢一雄
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      日本医療情報学会,第30回連合大会
    • Place of Presentation
      静岡県浜松市
    • Year and Date
      2010-11-20
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  • [Presentation] 対話的な形状編集機能と血流予測機能を備えた先天性心疾患のための説明用シェーマシステムの開発2010

    • Author(s)
      梅谷信行, 五十嵐健夫, 井尻敬, 後藤陽一, 鍵崎泰治, 黒嵜健一, 岩田倫明, 谷昇子, 原口亮, 中沢一雄
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      日本医療情報学会,第30回連合大会
    • Place of Presentation
      静岡県浜松市
    • Year and Date
      2010-11-20
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  • [Presentation] Contour-based Interface for Refining Volume Segmentation2010

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      Takashi Ijiri, Hideo Yokota
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      Hangzhou, China
    • Year and Date
      2010-09-26
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  • [Presentation] 三次元画像における抽出領域修正のためのインタフェース2010

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      井尻敬,横田秀夫,牧野内昭武
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      MIRU 2010サテライトワークショップ,細胞内画像処理
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      釧路市観光国際交流センター
    • Year and Date
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  • [Presentation] 三次元画像における抽出領域修正のためのインタフェース2010

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      井尻敬, 横田秀夫, 牧野内昭武
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      MIRU 2010サテライトワークショップ,細胞内画像処理
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      北海道,釧路市
    • Year and Date
      2010-07-26
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      アクトシティ浜松
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    • Organizer
      日本医療情報学会,第30回連合大会
    • Place of Presentation
      アクトシティ浜松
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      2011 Final Research Report
  • [Presentation] Contour-based Interface for Refining Volume Segmentation2010

    • Author(s)
      Takashi Ijiri and Hideo Yokota
    • Organizer
      Pacific Graphics2010
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      Jeju, Korea
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    • URL

      http://www.riken.jp/brict/Ijiri/

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      http://www.riken.jp/brict/Ijiri/

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  • [Patent(Industrial Property Rights)] 画像表示装置、画像表示方法、曲線特定装置、曲線特定方法、及び、記録媒体2010

    • Inventor(s)
      井尻敬、横田秀夫
    • Industrial Property Rights Holder
      理研
    • Filing Date
      2010-06-30
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      井尻敬、横田秀夫
    • Industrial Property Rights Holder
      理研
    • Filing Date
      2010-06-30
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    • Inventor(s)
      井尻敬, 横田秀夫
    • Industrial Property Rights Holder
      井尻敬, 横田秀夫
    • Industrial Property Number
      2010-149462
    • Filing Date
      2010-06-30
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    • Inventor(s)
      井尻敬, 横田秀夫
    • Industrial Property Rights Holder
      井尻敬, 横田秀夫
    • Industrial Property Number
      2010-149497
    • Filing Date
      2010-06-30
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      2010 Annual Research Report

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Published: 2010-08-23   Modified: 2016-04-21  

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