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Identification of transcription factors involved in regulating expression of plant immune receptor genes

Research Project

Project/Area Number 22K14893
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 39040:Plant protection science-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Adachi Hiroaki  京都大学, 農学研究科, 特定助教 (60909513)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Keywords植物免疫 / 免疫受容体 / NLRタンパク質 / 転写因子 / 分子ネットワーク / 転写制御 / NLR
Outline of Research at the Start

植物細胞内には、NLR免疫受容体があり、病原体分子を認識し免疫システムを活性化させる。近年、植物のNLR免疫機構の新しい概念として、異なる機能を持つ複数のNLRタンパク質が協調的に機能し、免疫応答を誘導するNLRネットワークモデルが提唱されている。しかし、それら複数のNLRが、転写レベルでどのように制御されているかは解明されていない。本研究では、ナス科モデル植物であるベンサミアナタバコを用いて、NLR遺伝子群の組織特異的発現制御に関わる転写因子を同定することを目的とする。ネットワークを構成するNLRの転写制御機構を明らかにできれば、植物の免疫受容体ネットワークの分子進化の理解に繋がる。

Outline of Final Research Achievements

Plant cells possess NLR immune receptors, which recognize pathogen effector molecules and activate the plant immune system. An emerging model suggests that multiple functionally specialized NLRs participate in NLR immune receptor networks. However, the transcriptional regulation governing the co-expression of these cooperative NLRs in plant tissues remains largely unknown. Here, we focused on the NLR immune receptor networks in the Solanaceae family and analyzed the tissue-specific expression of NLR genes to identify potential transcriptional regulators. We compiled a list of NLR genes expressed in leaf and/or root tissues and extracted cis-elements enriched in their promoter regions. Despite our efforts over the past two years, we have yet to identify transcription factors that regulate the expression of plant NLR immune receptor genes.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

植物NLR免疫系では、細胞死を伴う免疫反応を誘導することから、植物細胞にとってリスクとなり得る。しかし、植物NLR免疫系の制御機構については、未解明な点が多い。特に、複数のNLRが機能するNLRネットワークは、それぞれのNLR分子がどのように制御され、協調的に機能するのか明らかになっていない。本研究では、ナス科植物がもつNLR遺伝子の発現を制御する転写因子の探索を目的とした。研究成果として、根と葉で発現するNLR遺伝子のプロモーター領域に高頻度で存在するシス配列を同定した。今後、NLR遺伝子の転写制御機構の解明に繋がると期待される。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2023

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results)

  • [Journal Article] Jurassic NLR: Conserved and dynamic evolutionary features of the atypically ancient immune receptor ZAR12023

    • Author(s)
      Adachi Hiroaki、Sakai Toshiyuki、Kourelis Jiorgos、Pai Hsuan、Gonzalez Hernandez Jose L、Utsumi Yoshinori、Seki Motoaki、Maqbool Abbas、Kamoun Sophien
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 35 Issue: 10 Pages: 3662-3685

    • DOI

      10.1093/plcell/koad175

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] An atypical NLR protein modulates the NRC immune receptor network in Nicotiana benthamiana2023

    • Author(s)
      Adachi Hiroaki、Sakai Toshiyuki、Harant Adeline、Pai Hsuan、Honda Kodai、Toghani AmirAli、Claeys Jules、Duggan Cian、Bozkurt Tolga O.、Wu Chih-hang、Kamoun Sophien
    • Journal Title

      PLOS Genetics

      Volume: 19 Issue: 1 Pages: e1010500-e1010500

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1010500

    • Related Report
      2022 Research-status Report

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2025-01-30  

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