| Project/Area Number |
22K15082
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 43050:Genome biology-related
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
Shoji Keisuke 東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 (30880116)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
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| Keywords | piRNA / トランスポゾン / カイコ / BmN4 / piRNA cluster / piRNAクラスター |
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| Outline of Research at the Start |
piRNAはゲノム中に存在する非自己因子であるトランスポゾンを選択的に抑制する。この際、piRNAクラスターと呼ばれるゲノム中の領域がトランスポゾンを見分ける一種の記憶装置として機能する。
本研究では、カイコ培養細胞を用いて、どのようなゲノム領域がトランスポゾンを新たに”記憶”し、piRNAを産生するのか、をゲノムワイドに明らかにする。特に、今現在piRNAクラスターではないが、新たにtransgeneが挿入されるとpiRNAクラスターになる領域（potential piRNAクラスター）の網羅的な同定と特徴づけを進めることで、どのようにして新たにpiRNAクラスターになるのかを明らかにする。
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| Outline of Final Research Achievements |
In this study, we focused on piRNA clusters, which are the source of "piRNAs for transposon storage and repression. The goal of this study was to elucidate how piRNA clusters grow. As a result, we first found that specifically transposed transposons can be treated as an example of growing piRNA clusters in silkworm cultured cells. Furthermore, we found that artificial transposon-derived piRNAs and siRNAs differ in the regions in which they are produced and how they are located in the cell.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
piRNAはゲノム中に存在する非自己因子であるトランスポゾンを選択的に抑制する。この際、piRNAクラスターと呼ばれるゲノム中の領域が一種の記憶装置として機能し、piRNAクラスター中のトランスポゾン断片からpiRNAを産生することでトランスポゾンの発現を抑制しているとされている。そのため、piRNAクラスターがどの様にトランスポゾンを記憶できるのか、という問いは、生物がゲノム中に存在する非自己とどの様に折り合いをつけてきたのかを明らかにすることに他ならない。
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