| Project/Area Number |
22K15520
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 50010:Tumor biology-related
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| Research Institution | University of Tsukuba |
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Principal Investigator |
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
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| Keywords | 膵癌 / 癌関連線維芽細胞 / 腫瘍微小環境 / シングルセル解析 / CAF / 糖鎖 / 一細胞解析 |
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| Outline of Research at the Start |
難治性固形癌の代表である膵癌は、その間質組織増生が大きな特徴である。癌関連線維芽細胞(Cancer Associated Fibroblast, CAF)がその中心的な役割を担い、癌細胞を守るバリアになり、抗癌剤送達を低下させており、臨床での化学療法抵抗性の原因となっている。
「一細胞遺伝子糖鎖同時解析」という最新手法を用いて、多様性を持つ膵癌CAFそれぞれに特異的な遺伝子発現・糖鎖構造の組み合わせを解明する。そしてCAFの治療標的となる糖鎖構造を見つけ出し、新規CAF標的治療薬であるレクチン薬物複合体(Lectin-drug conjugate, LDC)作製へと発展させることを目指す。
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| Outline of Final Research Achievements |
We aimed to elucidate the glycan structures of therapeutic targets of cancer-associated fibroblasts (CAFs) in pancreatic cancer by “simultaneous single-cell gene glycan analysis (scGR-seq)”. We performed scGR-seq analysis on three clinical pancreatic cancer samples. Although we initially planned to analyze only the CAF fraction, we decided to analyze the entire tumor in order to obtain an overall picture of the tumor. Among 16 clusters classified by gene expression and glycan expression, CAFs corresponded to two clusters, iCAF (inflammatory CAF)-like and myCAF (myoblastic CAF)-like, and their specific glycans are now being verified by tissue staining.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
臨床膵癌3検体について、「一細胞遺伝子糖鎖同時解析(scGR-seq)」を行った。当初CAF分画のみの解析を予定していたが、全体像の把握のため腫瘍全体の解析とした。遺伝子発現と糖鎖発現から16のクラスターに分類した。遺伝子発現と糖鎖発現から分類した16クラスターのうち、CAFは２つに相当した。iCAF(inflammatory CAF)-likeとmyCAF (myoblastic CAF)-likeの２つのクラスターとなり、それらに特異的な糖鎖について組織染色で検証中である。今後新規CAF標的治療薬の開発への足掛かりとなることが期待される。
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