| Project/Area Number |
22K18486
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 3:History, archaeology, museology, and related fields
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| Research Institution | Kanazawa University |
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Principal Investigator |
Nishiuchi Takumi 金沢大学, 疾患モデル総合研究センター, 准教授 (20334790)
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| Project Period (FY) |
2022-06-30 – 2024-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
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| Keywords | パレオプロテオミクス / 植物種子 / 土器付着物 / 植物遺体 / タンパク質データベース / RNA-Seq / 植物遺存体 / 種子タンパク質 / 種子 / プロテオミクス |
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| Outline of Research at the Start |
植物遺体や土器付着物から検出された残存タンパク質には、植物グロブリンやグリシニン等のCupinファミリータンパク質が高頻度に見られることを明らかにしている。本研究では、出土地域や年代が異なり、また多様な植物遺体や土器付着物等の多数の出土試料を用いてタンパク質分析を行うことで、エビデンスを積み重ね、植物を含む考古学試料におけるCupinファミリータンパク質の残存性と普遍性を明らかにし、植物パレオプロテオミクスに有用な基盤データを確立する。
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| Outline of Final Research Achievements |
We attempted to develop a foundation for plant paleoproteomics, which reveals plant genera and species by detecting and identifying Cupin superfamily proteins, which are plant seed proteins that remain in carbonized seeds and carbonized food crusts attached to archaeological potteries. For carbonized rice, it was found that Japonica and Indica species could be discriminated if the samples were well preserved. For the charred food crusts adhering to archaeological potteries, Cupin family proteins from rice, soybean, and walnut were efficiently detected, and genus and species could be identified. On the other hand, RNA-Seq analysis was performed on six current acorn species for which little protein information was available, and a new protein database was created to improve the foundation for detecting more diverse plant species.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
本研究により、植物遺体を同定することで、炭化米の場合には、試料の保存状況が良ければ、ジャポニカ種とインディカ種を判別可能であることを明らかにした。また、土器付着炭化物については、Cupinファミリータンパクを効率よく検出する研究基盤を確立できたことで、考古試料について植物の属や種のレベルで同定することが可能となった。さらに、タンパク質の情報がほとんどなかった堅果類等については、現生果実を用いてRNA-Seq解析を実施し、タンパク質のデータベースを作成することで、より多様な植物種の同定が可能となり、植物パレオプロテオミクスの今後の拡張性についても示すことができた。
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