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Development of a microscope/cell sorter to identify killer T cells that attack cancer simply by observing them

Research Project

Project/Area Number 22K19285
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 43:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
Research InstitutionKindai University (2023)
The University of Tokyo (2022)

Principal Investigator

Kakimi Kazuhiro  近畿大学, 医学部, 教授 (80273358)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小林 由香利  東京大学, 医学部附属病院, 特任助教 (40866919)
長岡 孝治  東京大学, 医学部附属病院, 特任准教授 (80649799)
Project Period (FY) 2022-06-30 – 2024-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
KeywordsGMI / CTL / キラーT細胞 / AI / 機械学習 / T細胞活性化 / セルソーター / T細胞 / 画像処理 / Ghost Cytometry / Ghost Motion Imaging / がん免疫 / 腫瘍特異的T細胞 / イメージング / ゴーストサイトメトリー / フローサイトメトリー / 画像情報
Outline of Research at the Start

本研究の目的は、「見るだけでがんを攻撃するキラーT細胞を判別する顕微鏡・セルソーターを開発すること」である。動的ゴーストイメージング (GMI: Ghost Motion Imaging) 法によって計測された細胞画像情報を、画像に再構成せずにデータのまま活用し、機械学習によりその細胞特性を捉えて高速判別する新手法である。詳細なT細胞の機能分類を教師としてイメージング情報による識別の機械学習を行い、連続的に変化するT細胞をイメージ情報によってのみ識別可能にする技術を開発する。これにより、ヘテロな腫瘍浸潤リンパ球の中から、がんを攻撃するヒトキラーT細胞の判別を可能にする。

Outline of Final Research Achievements

We utilized GMI (Ghost Motion Imaging) technology to develop a novel cell analyzing and sorting system capable of identifying killer T cells that attack cancer simply by observing them. The GMI method utilizes measured cell image data directly without reconstructing images, enabling rapid identification of cell characteristics through machine learning. Using GMI technology, we established a method to differentiate T cells with different functions and differentiation states, which acquire various functions upon antigen stimulation, solely based on image information rather than conventional identification via fluorescent antibodies targeting cell surface markers.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

CAR-T細胞治療に加えて、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)治療がFDAの承認を受けた。これらのT細胞治療は、体外で培養増殖させたがん特異的T細胞を用いる治療であるため、T細胞の機能と増殖をバランスよく保持した細胞を安全に効率よく培養する必要がある。そのためには、閉鎖系の自動培養装置の開発が求められており、培養中のT細胞の状態、機能を把握する必要がある。我々の研究成果は、蛍光抗体などを用いることなく、細胞を観察しその画像情報のみでT細胞の分化度や機能を識別できることから、閉鎖培養装置に組み込み、T細胞のモニタリングを可能にし、CAR-TやTIL治療に最適な培養細胞の調製に貢献できる。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2022 Research-status Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2023 2022

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Mathematical modeling identifies LAG3 and HAVCR2 as biomarkers of T cell exhaustion in melanoma2023

    • Author(s)
      Beck Richard J.、Sloot Sander、Matsushita Hirokazu、Kakimi Kazuhiro、Beltman Joost B.
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 26 Issue: 5 Pages: 106666-106666

    • DOI

      10.1016/j.isci.2023.106666

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Immunotherapies targeting neoantigens are effective in PD-1 blockade‐resistant tumors2022

    • Author(s)
      Sun Changbo、Nagaoka Koji、Kobayashi Yukari、Maejima Kazuhiro、Nakagawa Hidewaki、Nakajima Jun、Kakimi Kazuhiro
    • Journal Title

      International Journal of Cancer

      Volume: 152 Issue: 7 Pages: 1463-1475

    • DOI

      10.1002/ijc.34382

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Principal component analysis of early immune cell dynamics during pembrolizumab treatment of advanced urothelial carcinoma2022

    • Author(s)
      Teshima Taro、Kobayashi Yukari、Kawai Taketo、Kushihara Yoshihiro、Nagaoka Koji、Miyakawa Jimpei、Akiyama Yoshiyuki、Yamada Yuta、Sato Yusuke、Yamada Daisuke、Tanaka Nobuyuki、Tsunoda Tatsuhiko、Kume Haruki、Kakimi Kazuhiro
    • Journal Title

      Oncology Letters

      Volume: 24 Issue: 2 Pages: 265-265

    • DOI

      10.3892/ol.2022.13384

    • Related Report
      2022 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 軟部肉腫におけるネオアンチゲン特異的TCRの探索.2023

    • Author(s)
      小林由香利, 長岡孝治, 佐藤靖祥, 船内雄生, 久保花織, 西江敏和, 岡本幸子, 高橋俊二, 垣見和宏
    • Organizer
      第20回日本免疫治療学会学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] scRNA-Seq, TCR-Seqデータを用いたネオアンチゲン特異的TCRの同定と、ネオアンチゲン特異的CD8+T細胞に含まれる2種類の疲弊T細胞の解析2023

    • Author(s)
      長岡孝治, 小林由香利, 加藤洋人, 齊藤知子, 戸塚義和, 竹田和由, 石川俊平, 垣見和宏
    • Organizer
      第20回日本免疫治療学会学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 養子免疫細胞療法におけるがん微小環境のエージェントベースモデルによるシミュレーション解析2023

    • Author(s)
      河西硯紀, 長岡孝治, 垣見和宏, 角田達彦
    • Organizer
      第20回日本免疫治療学会学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] scRNA-Seq,scTCR-Seqデータを用いたネオアンチゲン特異的TCRの同定とそれらを持つ2種類の疲弊T細胞の解析2023

    • Author(s)
      長岡孝治, 小林由香利, 加藤洋人, 斉藤知子, 戸塚義和, 竹田和由, 石川俊平, 垣見和宏
    • Organizer
      第27回日本がん免疫学会総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

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Published: 2022-07-05   Modified: 2025-01-30  

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