Development of a novel protocol based enrichment of glycopeptides for comprehensive glycoproteomics

• Project/Area Number: 23710246
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Living organism molecular science
• Research Institution: 公益財団法人野口研究所 (2012); Hokkaido University (2011)
• Principal Investigator: KUROGOCHI Masaki 公益財団法人野口研究所, 研究部, 研究員 (30422009)
• Project Period (FY): 2011 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2012: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2011: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
• Keywords: プロテオミクス / グライコプロテオミクス / 糖ペプチド抽出 / シアリル化糖ペプチド / 中性糖ペプチド / 酸性糖ペプチド / 質量分析計 / シアル酸糖鎖抽出 / 選択的酸化 / 糖ペプチド

Research Abstract

Separation of neutral and acidic glycopeptides has been developed using DEAE-Sepharose which has two characteristics, hydrophilic interaction (HILIC) and weak ion-exchange. By this method, neutral, sialylated, sulfated glycopeptides from human apolipoprotein B-100, bovine thyroglobulin could be isolated.

Research Products

• [Journal Article] Identification of novel serum biomarkers of hepatocellular carcinoma using glycomic analysis. (2013)
  • Author(s): Kamiyama T, Yokoo H, Furukawa JI, Kurogochi M, Togashi T, Miura N, Nakanishi K, Kamachi H, Kakisaka T, Tsuruga Y, Fujiyoshi M, Taketomi A, Nishimura SI, Todo S.
  • Journal Title: Hepatology. Volume: 印刷中 Issue: 6 Pages: 2314-2325
  • DOI: 10.1002/hep.26262
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A Strategy for Neuraminidase Inhibitors Using Mechanism- Based Labeling Information (2011)
  • Author(s): Hinou H., Miyoshi R., Takasu Y., Kai H., Kurogochi M.
  • Journal Title: Chem. Asian.J. Volume: 6 Issue: 4 Pages: 1048-1056
  • DOI: 10.1002/asia.201000594
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] An efficient approach for the characterization of mucin-type glycopeptides: the effect of O-glycosylation on the conformation of synthetic mucin peptides (2011)
  • Author(s): Hashimoto R., Fujitani N., Takegawa Y., Kurogochi M.
  • Journal Title: Chem. Eur. J. Volume: 17 Issue: 8 Pages: 2393-2404
  • DOI: 10.1002/chem.201002754
  • Peer Reviewed
• [Presentation] DEAESepharose を用いた中性・酸性糖ペプチドの分離と 解析 (2012)
  • Author(s): 黒河内政樹、天野純子
  • Organizer: 第85回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: マリンメッセ福岡(福岡)
  • Year and Date: 2012-12-15
• [Presentation] DEAE-Sepharoseを用いた中性・酸性糖ペプチドの分離と解析 (2012)
  • Author(s): 黒河内政樹、天野純子
  • Organizer: 第85回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: マリンメッセ福岡（福岡）
• [Presentation] 全自動糖鎖プロファイル診断シ ステムを用いたグライコミクスデータ解 析 (2011)
  • Author(s): 橋本亮、富樫智章、古川潤一、黒河内政 樹、大橋 哲、工藤里美、山内綾乃、三浦 信明、西村紳一 郎、岡田卓也、津田和実、橋尾範、村山大輔、見 付啓義、石井健太 郎、福島信弘、黒田寿晴、山崎 博司、濱 田和幸
  • Organizer: 第5回GFRG 研究会
  • Place of Presentation: 弘前大学医学部コミュニケーションセンター(弘前)
  • Year and Date: 2011-10-05
• [Presentation] ラット血清中のシアリル糖ペプチドの同定・解析法 (2011)
  • Author(s): 黒河内政樹、西村紳一郎
  • Organizer: 第84回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 京都国際会議場(京都)
  • Year and Date: 2011-09-24
• [Presentation] 全自動糖鎖プロファイル診断システム及びそのデータ解析について (2011)
  • Author(s): 富樫智章、古川潤一、黒河内政樹、大橋 哲、工藤 里美、山内綾乃、三浦信明、西 村紳一郎、岡田卓 也、津田和実、橋尾範、村山大輔、見付啓義、石 井健太郎、橋本 亮、福島信弘、黒田寿晴、山崎博 司、濱 田和幸
  • Organizer: 第84回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 京都国際会議場(京都)
  • Year and Date: 2011-09-24
• [Presentation] ラット血清中のシアリル糖ペプチドの同定・解析法 (2011)
  • Author(s): 黒河内政樹、西村紳一郎
  • Organizer: 第84回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 京都国際会議場（京都）
• [Presentation] 全自動糖鎖プロファイル診断システム及びそのデータ解析について (2011)
  • Author(s): 富樫智章、古川潤一、黒河内政樹、大橋哲、工藤里美、山内綾乃、三浦信明、西村紳一郎、岡田卓也、津田和実、橋尾範、村山大輔、見付啓義、石井健太郎、橋本亮、福島信弘、黒田寿晴、山崎博司、濱田和幸
  • Organizer: 第84回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 京都国際会議場（京都）
• [Presentation] 全自動糖鎖プロファイル診断システムを用いたグライコミクスデータ解析 (2011)
  • Author(s): 橋本亮、富樫智章、古川潤一、黒河内政樹、大橋哲、工藤里美、山内綾乃、三浦信明、西村紳一郎、岡田卓也、津田和実、橋尾範、村山大輔、見付啓義、石井健太郎、福島信弘、黒田寿晴、山崎博司、濱田和幸
  • Organizer: 第5回ＧＦＲＧ研究会
  • Place of Presentation: 弘前大学医学部コミュニケーションセンター（弘前）