Control of regular structure and functionalization of oligomers of bicyclic beta-proline derivative

• Project/Area Number: 23790006
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Research Field: Chemical pharmacy
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: OTANI Yuko 東京大学, 大学院・薬学系研究科, 助教 (60451853)
• Project Period (FY): 2011 – 2012
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2012)
• Budget Amount: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2012: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000); Fiscal Year 2011: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
• Keywords: オリゴマー / シス-トランス異性化 / NMR / 三級アミド / 分子動力学計算 / 規則 構造 / 二環性骨格 / 分子の架橋化 / シスートランス異性化 / 規則構造 / βｰアミノ酸 / ヘリックス / チオアミド / 非天然アミノ酸

Research Abstract

Methods for synthesis of conformationally constrained β-proline mimics, that is, bridgehead-substituted7-azabicyclo[2.2.1]heptane-2-endo-carboxylic acids was established. The oligomers take ordered structure with trans-amide bonds in solution. And cis-trans equilibrium of the cis-amide-type bicyclic dimer substituted at the bridgehead position is controlled dynamically by cross-linking reaction.

Research Products

• [Journal Article] Stereochemical Evidence for Stabilization of a Nitrogen Cation by Neighboring Chlorine or Bromine (2013)
  • Author(s): Tomohiko Ohwada
  • Journal Title: Proceedings of the National Academy of Sciences of the U.S.A. Volume: 110 Issue: 11 Pages: 4206-4211
  • DOI: 10.1073/pnas.1300381110
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Attenuated desensitization of b-adrenergic receptor by water-soluble N-nitrosamines that induce S-nitrosylation without NO release (2013)
  • Author(s): Noriko Makita*, Yoji Kabasawa*, Yuko Otani, Firman, Junichiro Sato, Makiko Hashimoto, Michio Nakaya, Hiroaki Nishihara, Masaomi Nangaku, Hitoshi Kurose, Tomohiko Ohwada, Taroh Iiri
  • Journal Title: Circ. Res Volume: 112 Issue: 2 Pages: 327-334
  • DOI: 10.1161/circresaha.112.277665
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] CDC25A-inhibitory RE derivatives bind to pocket Q1 Q2 adjacent to the catalytic site (2013)
  • Author(s): Ayako Tsuchiya, 他9名
  • Journal Title: Molecular Biosystems Volume: 9 Issue: 5 Pages: 1026-1034
  • DOI: 10.1039/c3mb00003f
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] GPR34 is a receptor for lysophosphatidylserine with a fatty acid at the sn-2 position (2012)
  • Author(s): Kitamura H, Makide K, Shuto A, Ikubo M, Inoue A, Suzuki K, Sato Y, Nakamura S, Otani Y, Ohwada T, Aoki J
  • Journal Title: J Biochem Volume: 151 Issue: 5 Pages: 511-518
  • DOI: 10.1093/jb/mvs011
  • NAID: 10031166091
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Secondary structure of homo-thiopeptides based on a bridged β-proline analogue: preferred formation of extended strand structures with trans-thioamide bonds (2012)
  • Author(s): Yuko Otani (Corresponding Author), Tetsuharu Hori, Masatoshi Kawahata, Kentaro Yamaguchi, Tomohiko Ohwada.
  • Journal Title: Tetrahedron Volume: 68 Pages: 4418-4428
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Activation of Electrophilicity of Stable Y-Delocalized Carbamate Cations in Intramolecular Aromatic Substitution Reaction: Evidence for Formation of Diprotonated Carbamates Leading to Generation of Isocyanates (2012)
  • Author(s): Hiroaki Kurouchi, Kyoko Kawamoto, Hiromichi Sugimoto, Satoshi Nakamura, Yuko Otani, and Tomohiko Ohwada.
  • Journal Title: J. Org. Chem. Volume: 77 Issue: 20 Pages: 9313-9328
  • DOI: 10.1021/jo3020566
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Visible-Light-Triggered Release of Nitric Oxide from N-Pyramidal Nitrosamines (2012)
  • Author(s): Karaki, F., et al
  • Journal Title: Chemistry-A European Journal Volume: 18 Issue: 4 Pages: 1127-1141
  • DOI: 10.1002/chem.201101427
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Molecular mechanism of pharmacological activation of BK channelsProc. Natl. (2012)
  • Author(s): Guido Gessner, Yong-Mei Cui, Yuko Otani, 他4名
  • Journal Title: Acad. Sci. U.S.A. Volume: 109 Issue: 9 Pages: 3552-3557
  • DOI: 10.1073/pnas.1114321109
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Dual-specificity phosphatase CDC25A/B inhibitor identified from a focused library with nonelectrophilic core structureACS (2012)
  • Author(s): Ayako Tsuchiya, Go Hirai, 他5名
  • Journal Title: Med. Chem. Lett. Volume: 3 Issue: 4 Pages: 294-298
  • DOI: 10.1021/ml2002778
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Discovery of a Tamoxifen-related compound that suppresses glial l-glutamate transport activity without interaction with estrogen receptors. (2012)
  • Author(s): Sato K
  • Journal Title: ACS Chem Neurosci Volume: 3 Issue: 2 Pages: 105-13
  • DOI: 10.1021/cn200091w
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Secondary Structure of Homo-thiopeptides Based on a Bridged β-Proline Analogue: Preferred Formation of Extended Strand Structures with Trans-Thioamide Bonds (2012)
  • Author(s): Yuko Otani, Tetsuharu Hori, Masatoshi Kawahata, Kentaro Yamaguchi and Tomohiko Ohwada
  • Journal Title: Tetrahedron Volume: in press
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Development of a vaccinia H1-related (VHR) phosphatase inhibitor with a nonacidic phosphate-mimicking core structure (2011)
  • Author(s): Hirai, G., Tsuchiya, A., Koyama, Y., Otani, Y., Oonuma, K., Dodo, K., Simizu, S., Osada, H. & Sodeoka, M
  • Journal Title: ChemMedChem Volume: 6 Issue: 4 Pages: 617-622
  • DOI: 10.1002/cmdc.201100107
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 生細胞に応用可能かつ高効 率的な可視光依存的ケージド NO 化合物の造最適化 (2013)
  • Author(s): フィルマン
  • Organizer: 日本薬学会第133年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • Year and Date: 2013-03-30
• [Presentation] 強酸を利用した安定なカルバメート化合物からの効率的なイソシアネートカチオン発生法の開発と芳香族求電子置換反応への応用 (2013)
  • Author(s): 黒内 寛明
  • Organizer: 日本薬学会第133年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川 県)
  • Year and Date: 2013-03-30
• [Presentation] リゾホスファチジルセリン受容体アゴニストの配座に関する研究 (2013)
  • Author(s): 中村 翔
  • Organizer: 日本薬学会第133年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • Year and Date: 2013-03-29
• [Presentation] テトラヒドロピラン骨格を用いたコンホメーションを固定したリ ゾホスファチジルセリン誘導体の合成 (2013)
  • Author(s): ジョン セジン
  • Organizer: 日本薬学会第133年会
  • Place of Presentation: パシ フィコ横浜(神奈川県)
  • Year and Date: 2013-03-29
• [Presentation] 二環性β-アミノ酸二量体の側鎖間架橋によるアミドのシス-トランス平衡の制御 (2013)
  • Author(s): 劉 シン
  • Organizer: 日本薬学会第133年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • Year and Date: 2013-03-28
• [Presentation] 規則構造を取る7-アザビシクロ[2.2.1]ヘプタンβ-アミノ酸のオリゴマーの合成 (2013)
  • Author(s): 王 思遠
  • Organizer: 日本薬学会第 133 年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • Year and Date: 2013-03-28
• [Presentation] タモキシフェンを基盤と したグルタミン酸トランスポーター阻害剤の開発 (2012)
  • Author(s): 大和田 智彦
  • Organizer: 第30回メディシナルケミストリーシンポジウム
  • Place of Presentation: タワーホール船堀(東京都)
  • Year and Date: 2012-11-28
• [Presentation] カルバメートから発生するY型共役により安定化されたカチオンの求電子性の活性化と芳香族求電子置換反応への応用 (2012)
  • Author(s): 黒内寛明
  • Organizer: 第38回反応と合成の進歩シンポジウム
  • Place of Presentation: タワーホール船堀(東京都)
  • Year and Date: 2012-11-05
• [Presentation] 可視光照射によりNOを産生する窒素ピラミッド化ニトロソアミン化合物の創製 (2012)
  • Author(s): フィルマン
  • Organizer: 第42回複素環化学討論会
  • Place of Presentation: 京都テルサ(京都府)
  • Year and Date: 2012-10-12
• [Presentation] トランス型三級アミド構造を持つ二環性β-アミノ酸の合成 (2012)
  • Author(s): 王 思遠
  • Organizer: 第42回複素環化学討論会
  • Place of Presentation: 京都テルサ(京都府)
  • Year and Date: 2012-10-12
• [Presentation] 高度に制御されたヘリックス構造をとる二環性β-アミノ酸オリゴマーの創製 (2011)
  • Author(s): 尾谷 優子
  • Organizer: 第37回反応と合成の進歩シンポジウム
  • Place of Presentation: あわぎんホール(徳島県)
  • Year and Date: 2011-11-08
• [Presentation] 受容体の生理機能解明を目指したリゾホスファチジルセリン受容体サ ブタイプ 特異的リガンドの合成と活性評価 (2011)
  • Author(s): 井久保 仁也
  • Organizer: 第37回反応と合成の進歩シンポジウム
  • Place of Presentation: あわぎんホール(徳島県)
  • Year and Date: 2011-11-08
• [Presentation] Beckmann転位の転位選択性:テトラロン構造におけるペリ位置換基の効果 (2011)
  • Author(s): 谷 紀彦
  • Organizer: 第41回複素環化学討論会
  • Place of Presentation: 熊本市民会館(熊本県)
  • Year and Date: 2011-10-21
• [Presentation] テトラロン構造におけるBeckmann転位の転位選択性:ペリ位置換基の効果の一般性 (2011)
  • Author(s): 大和田 智彦
  • Organizer: 第41回複素環化学討論会
  • Place of Presentation: 熊本市民会館(熊本県)
  • Year and Date: 2011-10-20
• [Presentation] 水中で安定なヘリックス構造を有する二環性β-プロリン誘導体オリゴマーの創製 (2011)
  • Author(s): 尾谷 優子
  • Organizer: 第22回 基礎有機化学討論会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場(茨城県)
  • Year and Date: 2011-09-23
• [Presentation] 化学構造に由来するSNO化活性化合物の合成と生物応答への応用 (2011)
  • Author(s): 大和田 智彦
  • Organizer: 生理研研究会第7回TRPチャネル研究会
  • Place of Presentation: 岡崎カンファレンスセンター(愛知県)
  • Year and Date: 2011-06-02
• [Presentation] リゾホスファチジルセリン受容体サブタイプ特異的リガンドの創製 (2011)
  • Author(s): 井久保 仁也
  • Organizer: 日本ケミカルバイオロジー学会第6回年会
  • Place of Presentation: 東京工業大学(東京都)
  • Year and Date: 2011-05-24
• [Presentation] 可視光によりuncageされるcaged-NOの創製 (2011)
  • Author(s): 大和田 智彦
  • Organizer: 第11回日本NO学会学術集会
  • Place of Presentation: 昭和薬科大学(東京都)
  • Year and Date: 2011-05-13
• [Presentation] Synthesis and the ordered secondary structure of homo-thiopeptides based on a bridged β-proline analog (2010)
  • Author(s): 尾谷 優子
  • Organizer: The 242nd ACS National Meeting
  • Place of Presentation: Denver, Colorado (USA)
• [Presentation] 二環性β－アミノ酸二量体の側鎖間架橋によるアミドのシス－トランス平衡の制御
  • Author(s): 劉 シン
  • Organizer: 日本薬学会第133年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県）
• [Presentation] 規則構造を取る７－アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン β－アミノ酸のオリゴマーの合成
  • Author(s): 王 思遠
  • Organizer: 日本薬学会第133年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県）
• [Presentation] リゾホスファチジルセリン受容体アゴニストの配座に関する研究
  • Author(s): 中村 翔
  • Organizer: 日本薬学会第133年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県）
• [Presentation] テトラヒドロピラン骨格を用いたコンホメーションを固定したリゾホスファチジルセリン誘導体の合成
  • Author(s): ジョン セジン
  • Organizer: 日本薬学会第133年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県）
• [Presentation] 生細胞に応用可能かつ高効率的な可視光依存的ケージドNO化合物の構造最適化
  • Author(s): フィルマン
  • Organizer: 日本薬学会第133年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県）
• [Presentation] 強酸を利用した安定なカルバメート化合物からの効率的なイソシアネートカチオン発生法の開発と芳香族求電子置換反応への応用
  • Author(s): 黒内 寛明
  • Organizer: 日本薬学会第133年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜（神奈川県）
• [Presentation] タモキシフェンを基盤としたグルタミン酸トランスポーター阻害剤の開発
  • Author(s): 大和田 智彦
  • Organizer: 第30回メディシナルケミストリーシンポジウム
  • Place of Presentation: タワーホール船堀（東京都）
• [Presentation] カルバメートから発生するY 型共役により安定化されたカチオンの求電子性の活性化と芳香族求電子置換反応への応用
  • Author(s): 黒内寛明
  • Organizer: 第３８回反応と合成の進歩シンポジウム
  • Place of Presentation: タワーホール船堀（東京都）
• [Presentation] 可視光照射によりNOを産生する窒素ピラミッド化ニトロソアミン化合物の創製
  • Author(s): フィルマン
  • Organizer: 第４２回複素環化学討論会
  • Place of Presentation: 京都テルサ（京都府）
• [Presentation] トランス型三級アミド構造を持つ二環性β-アミノ酸の合成
  • Author(s): 王 思遠
  • Organizer: 第４２回複素環化学討論会
  • Place of Presentation: 京都テルサ（京都府）
• [Presentation] 可視光によりuncageされるcaged-NOの創製
  • Author(s): 大和田 智彦
  • Organizer: 第１１回日本ＮＯ学会学術集会
  • Place of Presentation: 昭和薬科大学（東京都）
• [Presentation] リゾホスファチジルセリン受容体サブタイプ特異的リガンドの創製
  • Author(s): 井久保 仁也
  • Organizer: 日本ケミカルバイオロジー学会第６回年会
  • Place of Presentation: 東京工業大学（東京都）
• [Presentation] 化学構造に由来するSNO化活性化合物の合成と生物応答への応用
  • Author(s): 大和田 智彦
  • Organizer: 生理研研究会 第７回TRPチャネル研究会
  • Place of Presentation: 岡崎カンファレンスセンター（愛知県）
• [Presentation] Synthesis and the ordered secondary structure of homo-thiopeptides based on a bridged β-proline analog
  • Author(s): 尾谷 優子（Yuko Otani）
  • Organizer: The 242nd ACS National Meeting
  • Place of Presentation: Denver, Colorado (USA)
• [Presentation] 水中で安定なヘリックス構造を有する二環性β-プロリン誘導体オリゴマーの創製
  • Author(s): 尾谷 優子
  • Organizer: 第２２回 基礎有機化学討論会
  • Place of Presentation: つくば国際会議場（茨城県）
• [Presentation] Beckmann転位の転位選択性：テトラロン構造におけるペリ位置換基の効果
  • Author(s): 谷 紀彦
  • Organizer: 第４１回複素環化学討論会
  • Place of Presentation: 熊本市民会館（熊本県）
• [Presentation] テトラロン構造におけるBeckmann転位の転位選択性：ペリ位置換基の効果の一般性
  • Author(s): 大和田 智彦
  • Organizer: 第４１回複素環化学討論会
  • Place of Presentation: 熊本市民会館（熊本県）
• [Presentation] 高度に制御されたヘリックス構造をとる二環性β-アミノ酸オリゴマーの創製
  • Author(s): 尾谷 優子
  • Organizer: 第３７回反応と合成の進歩シンポジウム
  • Place of Presentation: あわぎんホール（徳島県）
• [Presentation] 受容体の生理機能解明を目指したリゾホスファチジルセリン受容体サブタイプ 特異的リガンドの合成と活性評価
  • Author(s): 井久保 仁也
  • Organizer: 第３７回反応と合成の進歩シンポジウム
  • Place of Presentation: あわぎんホール（徳島県）
• [Remarks] 東京大学大学院薬学系研究科薬化学教室 ホームページ
  • URL: http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~yakka/index.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~yakka/index.html
• [Patent(Industrial Property Rights)] リゾホスファチジルセリン受容体機能調節活性を有する化合物 (2013)
  • Inventor(s): 大和田智彦、尾谷優子、井久保仁也、中村翔、ジョンセジン
  • Industrial Property Rights Holder: 大和田智彦、尾谷優子、井久保仁也、中村翔、ジョンセジン
  • Industrial Property Rights Type: 特許
  • Industrial Property Number: 2013-017817
  • Filing Date: 2013-01-31
• [Patent(Industrial Property Rights)] 自己免疫疾患治療薬 (2012)
  • Inventor(s): 青木淳賢、巻出久美子、井上飛鳥、大和田智彦、井久保仁也、尾谷優子
  • Industrial Property Rights Holder: 青木淳賢、巻出久美子、井上飛鳥、大和田智彦、井久保仁也、尾谷優子
  • Industrial Property Rights Type: 特許
  • Filing Date: 2012-05-18
  • Overseas