Development and application of detection methods for genes like the ones for ammonia- or methane- oxidation

• Project/Area Number: 25340016
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Environmental dynamic analysis
• Research Institution: Shibaura Institute of Technology
• Principal Investigator: Fuse Hiroyuki 芝浦工業大学, システム工学部, 教授 (30357925)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2016-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2015)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2015: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2014: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2013: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
• Keywords: メタンモノオキシゲナーゼ遺伝子 / 短鎖炭化水素資化性菌 / メタン酸化細菌 / メタンモノオキシゲナーゼ / 短鎖アルカン資化性菌 / アンモニア酸化細菌 / メタン資化性菌 / メタン酸化酵素遺伝子 / アンモニア酸化酵素遺伝子 / 海洋環境

Outline of Final Research Achievements

New nonmethane hyhdrocarbon assimilating marine bacteria were isolated and pmo-like genes were found in the isolates. Those pmo-like genes of marine strains were analyzed. Primers for pmo-like genes of non-methanotrophic bacteria were created. Those pmo-like genes in the environmental samples were amplified using the primers by PCR and a new group of genes in addition to the genes in the group of ethane- or ethylene- assimilating bacteria were detected.

Research Products

• [Presentation] 上越沖メタン湧出域を含む日本近海の海水中のメタン酸化細菌の分布 (2014)
  • Author(s): 劉園, 逸見彰大, 阿久津祥吾, 四方麻妃, 塩谷達也, 江晨, 布施博之 , 寺原猛, 今田千秋, 帆秋利洋, 沖田紀子, 吉田光毅, 海野圭祐
  • Organizer: 第６回メタンハイドレート総合シンポジウム講演集
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2014-12-03 – 2014-12-04
• [Presentation] Cu-MMOを有する新規海洋性エチレン資化性細菌 (2014)
  • Author(s): 塩谷達也、寺原猛、今田千秋、羽部浩、布施博之
  • Organizer: 環境微生物系合同大会2014
  • Place of Presentation: 浜松
  • Year and Date: 2014-10-21 – 2014-10-24
• [Presentation] 海洋性エタン資化性菌の諸性質とその初発酸化酵素遺伝子に関する研究 (2014)
  • Author(s): 朝重翔, 鈴木敏弘, 羽部浩、布施博之
  • Organizer: 環境微生物系合同大会2014
  • Place of Presentation: 浜松
  • Year and Date: 2014-10-21 – 2014-10-24
• [Presentation] Methanotrophic Bacteria in Seawater around Japan. (2014)
  • Author(s): Fuse H., Henmi A., Akutsu S., Shikata M., Shioya T., Jiang C. Liu Y., Terahara T., Imada C., Yoshida K., Okita N., Habe H
  • Organizer: Molecular Basis of Microbial One-Carbon Metabolism (Gordon Research Conferences)
  • Place of Presentation: MA, USA
  • Year and Date: 2014-08-10 – 2014-08-15
• [Presentation] 第二渥美海丘の底泥と水柱におけるメタン酸化やアンモニア酸化等に係る微生物の分布特性
  • Author(s): 吉田光毅、平田敦洋、沖田紀子、帆秋利洋、逸見彰大、荒井麻理、布施博之、鋤崎 俊二、荒田直
  • Organizer: 第5回メタンハイドレート総合シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] 水柱試料を対象とした微生物検出手法の検討と新潟沖メタン湧出域水柱に生息するメタン酸化細菌
  • Author(s): 逸見彰大、阿久津祥吾、四方麻妃、塩谷達也、江晨、布施博之、寺原猛、今田千秋、吉田光毅、平田敦洋、沖田紀子、荒田直
  • Organizer: 第5回メタンハイドレート総合シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] 新潟沖メタン湧出域におけるメタン酸化細菌
  • Author(s): 逸見彰大、布施博之、吉田光毅、沖田紀子、帆秋利洋、今田千秋、寺原猛
  • Organizer: 第29回日本微生物生態学会
  • Place of Presentation: 鹿児島
• [Presentation] 海洋性短鎖炭化水素資化菌の諸性質とその初発酸化酵素遺伝子
  • Author(s): 飯島智祐、鈴木敏弘、丸山明彦、布施博之
  • Organizer: 第29回日本微生物生態学会
  • Place of Presentation: 鹿児島
• [Presentation] 海洋性アルケン資化性菌によるエポキシアルカン代謝について
  • Author(s): 古松 星来、矢澤 友規、鈴木 敏弘、布施 博之
  • Organizer: 日本農芸化学会2014年度大会
  • Place of Presentation: 東京