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Development of a new therapeutic method by genome-editing

Research Project

Project/Area Number 25670775
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeMulti-year Fund
Research Field Morphological basic dentistry
Research InstitutionKyoto University (2014)
Tokyo Medical and Dental University (2013)

Principal Investigator

NAKAGAWA Ichiro  京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (70294113)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) MARUYAMA Fumito  京都大学, 大学院医学研究科微生物感染症学分野, 准教授 (30423122)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2013: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
KeywordsA群レンサ球菌 / CRIPSR / TALEN / ZFN / 増殖抑制 / A群レンサ球菌 / CRISPR / Cas9 / ファージ / ゲノム編集 / 感染制御
Outline of Final Research Achievements

In this study, we tried to apply the Genome Editing method on the basis of the spacer sequence information of CRISPR. The Cas9 / CRISPR system of the group A streptococci (GAS) with various spacer sequences of the chromosomal DNA were constructed, and chromosomal fragments with homologous sequence were also introduced in another compatible plasmid. CRISPR/Cas system could clearly inhibit the growth of E. coli strain with matched pair of spacer sequence and the chromosomal fragment. However, the TALEN system and ZFN system could not inhibit the growth of E. coli completely. We also construct the CIRPSR/Cas9 expression plasmid for GAS. The growth of bacteria is completely inhibited by introducing the plasmid with spacer sequence of the homologous sequence of the its chromosome. These observations indicated that the CIRPSR/Cas9 system can be used not only for the destruction of foreign DNA but also its chromosome.

Report

(3 results)
  • 2014 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2013 Research-status Report
  • Research Products

    (39 results)

All 2015 2014 2013 Other

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 4 results) Presentation (27 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Intraindividual variation in core microbiota in peri-implantitis and periodontitis.2014

    • Author(s)
      N. Maruyama, F. Maruyama, Y. Takeuchi, C. Aikawa, Y. Izumi, I. Nakagawa.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 6602-6602

    • DOI

      10.1038/srep06602

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    • Author(s)
      A. Endo, T. Watanabe, N. Ogata, T. Nozawa, C. Aikawa, S. Arakawa, F. Maruyama, Y. Izumi, I. Nakagawa.
    • Journal Title

      ISME Journal

      Volume: 9 Issue: 3 Pages: 629-642

    • DOI

      10.1038/ismej.2014.155

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    • Author(s)
      K. Okada, M. Na Ubol, W. Natakuathung, A. Roobthaisong, F. Maruyama, I. Nakagawa, S. Chantaroj, S. Hamada
    • Journal Title

      PLos One

      Volume: 9 Issue: 6 Pages: e98120-e98120

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0098120

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    • Author(s)
      Goda A, Maruyama F, Michi Y, Nakagawa I, Harada K
    • Journal Title

      Clinical Microbiology and Infection

      Volume: - Issue: 5 Pages: O309-O317

    • DOI

      10.1111/1469-0691.12400

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      Okura M, Lachance C, Osaki M, Sekizaki T, Maruyama F, Nozawa T, Nakagawa I, Hamada S, Rossignol C, Gottschalk M, Takamatsu D
    • Journal Title

      Dental Medicine Research

      Volume: 33 Issue: 3 Pages: 236-241

    • DOI

      10.7881/dentalmedres.33.236

    • NAID

      130004588205

    • ISSN
      1882-0719, 2186-540X
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      Nakagawa I
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      Volume: 14 Issue: 6 Pages: 604-606

    • DOI

      10.1016/j.chom.2013.11.012

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      Ito C, Saito Y, Nozawa T, Fujii S, Sawa T, Inoue H, Matsunaga T, Khan S, Akashi S, Hashimoto R, Aikawa C, Takahashi E, Sagara H, Komatsu M, Tanaka K, Akaike T, Nakagawa I, Arimoto H.
    • Journal Title

      Mol. Cell

      Volume: 52 Issue: 6 Pages: 794-804

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2013.10.024

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      Watanabe T, Nozawa T, Aikawa C, Amano A, Maruyama F, Na kagawa I.
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      Volume: 5 Issue: 6 Pages: 1099-1114

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      10.1093/gbe/evt075

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      Okura M, Takamatsu D, Maruyama F, Nozawa T, Nakagawa I, Osaki M, Sekizaki T, Gottschalk M, Kumagai Y, Hamada S
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      Appl Environ Microbiol

      Volume: 79 Issue: 8 Pages: 2796-2806

    • DOI

      10.1128/aem.03742-12

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      Minegishi K, Aikawa C, Furukawa A, Watanabe T, Nakano T, Ogura Y, Ohtsubo Y, Kurokawa K, Hayashi T, Maruyama F, Nakagawa I, Eishi Y
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      Genome Announcement

      Volume: 1 Issue: 1 Pages: 16-12

    • DOI

      10.1128/genomea.00016-12

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      峰岸 佳菜,渡辺 孝康,丸山 史人,中川 一路,江石 義 信
    • Organizer
      第88回 日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      長良川国際会議場(岐阜)
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      第88回 日本細菌学会総会
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      長良川国際会議場(岐阜)
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      渡辺 孝康,野澤 孝志,丸山 史人,中川 一路
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      第88回 日本細菌学会総会
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      長良川国際会議場(岐阜)
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      2015-03-26 – 2015-03-28
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      山田 俊介,柴崎 真樹,渡辺 孝康,相川 知宏,野澤 孝志, 丸山 史人,中川 一路
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      第88回 日本細菌学会総会
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      長良川国際会議場(岐阜)
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      第88回 日本細菌学会総会
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      長良川国際会議場(岐阜)
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      2015-03-07 – 2015-03-09
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      第55回歯科基礎医学会学術大会・総会
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      http://www.tmd.ac.jp/grad/bac/

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Published: 2014-07-25   Modified: 2019-07-29  

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