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The search for novel biomarkers by comprehensive identification of human lipid modified proteins

Research Project

Project/Area Number 26450125
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeMulti-year Fund
Section一般
Research Field Applied biochemistry
Research InstitutionYamaguchi University

Principal Investigator

UTSUMI TOSHIHIKO  山口大学, 創成科学研究科, 教授 (20168727)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2014: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
KeywordsN-ミリストイル化 / プレニル化 / バイオマーカー探索 / 網羅的探索 / タンパク質脂質修飾 / タンパク質翻訳後修飾 / 細胞情報伝達 / 脂質修飾 / 網羅的解析
Outline of Final Research Achievements

In this study, to search for novel lipid modified proteins that can be applied for molecular biomarkers, we have established the strategy to identify the novel lipid modified proteins from human proteome by using metabolic labeling method performed in the insect cell-free protein synthesis system. By using this strategy, we next tried the comprehensive identification of human N-myristoylated proteins from whole human proteins listed in UniProt protein database. As a result, 171 novel N-myristoylated proteins were found from all human proteins. These novel N-myristoylated proteins contain not only physiologically important proteins mainly involved in the signal transduction pathways but also many disease-associated proteins that can be applied for molecular biomarkers.

Report

(4 results)
  • 2016 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2015 Research-status Report
  • 2014 Research-status Report
  • Research Products

    (31 results)

All 2017 2016 2015 2014 Other

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (20 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Identification of dually acylated proteins from complementary DNA resources by cell-free and cellular metabolic labeling.2016

    • Author(s)
      Moriya K, Kimoto M, Matsuzaki K, Kiwado A, Takamitsu E, Utsumi T
    • Journal Title

      Analytical Biochemistry

      Volume: 511 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1016/j.ab.2016.07.025

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  • [Journal Article] Phytoestrogen Suppresses Efflux of the Diagnostic Marker Protoporphyrin IX in Lung Carcinoma.2016

    • Author(s)
      Fujita H, Nagakawa K, Kobuchi H, Ogino T, Kondo Y, Inoue K, Shuin T, Utsumi T, Utsumi K, Sasaki J, Ohuchi H.
    • Journal Title

      Cancer Res

      Volume: 76 Issue: 7 Pages: 1837-1846

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-15-1484

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  • [Journal Article] The Role of Protein <i>N</i>-Myristoylation on a Wide Variety of Biological Processes2016

    • Author(s)
      内海俊彦, 守屋康子
    • Journal Title

      KAGAKU TO SEIBUTSU

      Volume: 54 Issue: 7 Pages: 484-492

    • DOI

      10.1271/kagakutoseibutsu.54.484

    • NAID

      130006772569

    • ISSN
      0453-073X, 1883-6852
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  • [Journal Article] Homozygous mutation of STXBP5L explains an autosomal recessive infantile-onset neurodegenerative disorder.2015

    • Author(s)
      R. Kumar, M.A. Corbett, N.JC. Smith, L.A. Jolly, C. Tan, D.J. Keating, M.D. Duffield, T. Utsumi, K. Moriya, K.R. Smith, A. Hoischen, K. Abbott, M.G. Harbord, A.G. Compton, J.A. Woenig, P. Arts, M. Kwint, N. Wieskamp, S. Gijsen, J.A. Veltman, M. Bahlo, J.G. Gleeson, E. Haan, J. Gecz.
    • Journal Title

      Human Molecular Genetics

      Volume: 24 Issue: 7 Pages: 2000-2010

    • DOI

      10.1093/hmg/ddu614

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    • Author(s)
      Emi Takamitsu, Motoaki Otsuka, Tatsuki Haebara, Manami Yano, Kanako Matsuzaki, Hirotsugu Kobuchi, Koko Moriya, Toshihiko Utsumi.
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 10 Issue: 8 Pages: e0136360-e0136360

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0136360

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    • Author(s)
      Kaneko K, Tabuchi M, Sueyoshi N, Ishida A, Utsumi T, Kameshita I
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry

      Volume: in press Issue: 1 Pages: 51-61

    • DOI

      10.1093/jb/mvu018

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  • [Journal Article] Cell-free identification of novel N-myristoylated proteins from complementary DNA resources using bioorthogonal myristic acid analogues.2014

    • Author(s)
      Takamitsu E, Fukunaga K, Iio Y, Moriya K, Utsumi T.
    • Journal Title

      Anal. Biochem.

      Volume: 464 Pages: 83-93

    • DOI

      10.1016/j.ab.2014.07.006

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  • [Journal Article] A Cell-Free Translocation System Using Extracts of Cultured Insect Cells to Yield Functional Membrane Proteins2014

    • Author(s)
      Toru E., Kei N., Yoko S., Satomi S., Keishi A., Satoshi S., Masaaki I., Takahiro H., Gunnar V. H., Toshihiko U., Keietsu A., Eiji A. and Nobuyuki U.
    • Journal Title

      Pros One

      Volume: 9 Issue: 12 Pages: e112874-e112874

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0112874

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  • [Presentation] 網羅的探索により見出したN-ミリストイル化された多重回膜貫通タンパク質の解析2017

    • Author(s)
      黄波戸亜哉, 松崎嘉奈子, 守屋康子, 内海俊彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
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      京都女子大学(京都府京都市)
    • Year and Date
      2017-03-17
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  • [Presentation] ミトコンドリア外膜タンパク質SAMM50 と特異的に相互作用するN-ミリストイル化タンパク質の解析2016

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      松崎嘉奈子, 岩永友花, 黄波戸亜哉, 守屋康子, 小渕浩嗣, 内海俊彦
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      第89回日本生化学会大会
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      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-25
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    • Organizer
      第 69 回日本酸化ストレス学会学術集会
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      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2016-08-30
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      Saito S, Hamamoto S, Sato Y, Uozumi N, Hashimoto K, Kudla J, Utsumi T, Moriya K, Tozawa Y, and Yamauchi S.
    • Organizer
      International workshop on Plant Membrane Biology
    • Place of Presentation
      Annapolis, USA
    • Year and Date
      2016-06-05
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  • [Presentation] ヒト多重回膜貫通タンパク質に生ずるタンパク質 N-ミリストイル化の解析2016

    • Author(s)
      黄波戸亜哉, 仁戸田紗希, 守屋康子, 内海俊彦
    • Organizer
      第 57 回 日本生化学会 中国・四国支部例会
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      高知大学医学部(高知県南国市)
    • Year and Date
      2016-05-27
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  • [Presentation] N-ミリストイル化されたミトコンドリアタンパク質 SAMM50, TOMM40, CHCHD3, CHCHD6 の間に生ずる相互作用の解析2016

    • Author(s)
      松崎嘉奈子, 岩永友花, 守屋康子, 小渕浩嗣, 内海 俊彦
    • Organizer
      第 57 回 日本生化学会 中国・四国支部例会
    • Place of Presentation
      高知大学医学部(高知県南国市)
    • Year and Date
      2016-05-27
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      竹林昂亮、齋藤俊也、内海俊彦、守屋康子、加藤恵、佐藤陽子、武藤潤、越智直樹、橋本研志、Katrin Held、Jorg Kudla、上田実、横山隆亮、西谷和彦、浜本晋、魚住信之
    • Organizer
      第57回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      岩手大学上田キャンパス (岩手県盛岡市)
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      2016-03-18
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      齋藤俊也、浜本晋、内海俊彦、守屋康子、松浦愛子、佐藤陽子、野口寛人、戸澤譲、山内清司、橋本 研志、Jorg Kudla、魚住信之
    • Organizer
      第57回日本植物生理学会年会
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      岩手大学上田キャンパス (岩手県盛岡市)
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      2016-03-18
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      矢野愛美、大塚基顕、守屋康子、内海俊彦
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      第38回日本分子生物学会年会第88回日本生化学会大会合同大会
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      神戸ポートアイランド (兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
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  • [Presentation] ミトコンドリア外膜タンパク質 SAMM50 および TOMM40 に生ずるN-ミリストイル化の解析2015

    • Author(s)
      松崎嘉奈子、高光恵美、守屋康子、内海俊彦
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      第38回日本分子生物学会年会第88回日本生化学会大会合同大会
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      神戸ポートアイランド (兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
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      矢野愛美、大塚基顕、高光恵美、守屋康子、内海俊彦
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      第56回 日本生化学会 中国・四国支部例会
    • Place of Presentation
      島根大学大学会館(島根県松江市)
    • Year and Date
      2015-05-29
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  • [Presentation] ミトコンドリア外膜タンパク質 SAMM50 および TOMM40 に生ずるN-ミリストイル化の解析2015

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      松崎嘉奈子、高光恵美、守屋康子、内海俊彦
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      第56回 日本生化学会 中国・四国支部例会
    • Place of Presentation
      島根大学大学会館(島根県松江市)
    • Year and Date
      2015-05-29
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  • [Presentation] ミトコンドリア外膜タンパク質SAMM50に生ずるタンパク質 N‐ミリストイル化の解析2015

    • Author(s)
      高光恵美、飯尾雄介、福永和貴、守屋康子、内海俊彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
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  • [Presentation] シグナルペプチドに生ずるタンパク質 N-ミリストイル化の解析2015

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      南風原 樹、大塚 基顕、林田 真梨子、高光 恵美、守屋 康子、内海 俊彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
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      久場遥、上野可南子、塩田真友、玉栄空輝、藤山加奈子、田代淳、市原直己、高坂智之、内海俊彦、山田守
    • Organizer
      日本農芸化学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
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      高光恵美、福永和貴、飯尾雄介、守屋康子、内海俊彦
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      第87回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館
    • Year and Date
      2014-10-15 – 2014-10-18
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  • [Presentation] シグナルペプチドに生じるN-ミリストイル化の解析2014

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      南風原樹、高光恵美、守屋康子、内海俊彦
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      日本農芸化学会2014年度中四国支部大会
    • Place of Presentation
      徳島大学常三島キャンパス
    • Year and Date
      2014-09-26 – 2014-09-27
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      林田真梨子、高光恵美、守屋康子、内海俊彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年度中四国支部大会
    • Place of Presentation
      徳島大学常三島キャンパス
    • Year and Date
      2014-09-26 – 2014-09-27
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    • Author(s)
      矢野愛美、大塚基顕、高光恵美、守屋康子、内海俊彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年度中四国支部大会
    • Place of Presentation
      徳島大学常三島キャンパス
    • Year and Date
      2014-09-26 – 2014-09-27
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    • Author(s)
      内海俊彦
    • Organizer
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ワークピア横浜
    • Year and Date
      2014-06-25 – 2014-06-27
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    • Invited
  • [Remarks] 山口大学農学部 生物機能科学科 内海俊彦

    • URL

      http://www.agr.yamaguchi-u.ac.jp/member/utsumi/index.html

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  • [Remarks] 山口大学農学部 生物機能科学科 内海俊彦

    • URL

      http://www.agr.yamaguchi-u.ac.jp/member/utsumi/index.html

    • Related Report
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  • [Remarks] 内海俊彦

    • URL

      http://www.agr.yamaguchi-u.ac.jp/member/utsumi/index.html

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Published: 2014-04-04   Modified: 2018-03-22  

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