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バクテリアが持つユビキチン修飾システム

Publicly Offered Research

Project AreaNew aspect of the ubiquitin system : its enormous roles in protein regulation
Project/Area Number 15H01174
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Kim Minsoo  京都大学, 白眉センター, 特定准教授 (50466835)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥9,620,000 (Direct Cost: ¥7,400,000、Indirect Cost: ¥2,220,000)
Fiscal Year 2016: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2015: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Keywordsユビキチン / エフェクター / 感染制御 / 蛋白質 / 感染症 / 病原細菌
Outline of Annual Research Achievements

赤痢菌のユビキチンリガーゼである IpaH ファミリー蛋白質は、赤痢菌に 10 種類存在し、赤痢菌感染成立に重要な役割をする病原因子である。IpaH は立体構造解析により、HECT型や RING 型といった哺乳類のユビキチンリガーゼとは異なる新しいタイプのユビキチンリガーゼ (Novel E3 Ligase: NEL 型)であることが明らかになった。しかしながら、IpaHファミリーの基質認識機構やユビキチンリガーゼの活性制御については不明である。本研究では NEL ユビキチンリガーゼの活性化機構を明らかにするために、新しくリアルタイムでユビキチン化反応をモニタリング可能な方法を開発した。詳しくは、蛍光蛋白質であるMidori-ishi CyanまたはKusabira-Orangeをユビキチンに融合した蛍光ユビキチン蛋白質作成した。E1,E2,E3(IpaH4.5)、蛍光ユビキチンを用いて、ユビキチン化反応を行い、この時に発生する蛍光のエネルギー転移を指標にして、ユビキチン化活性を測定した。その結果、IpaH4.5のユビキチン化活性をリアルタイムで測定できた。IpaH4.5が作るポリユビキチン鎖を特定するために、ユビキチンのリジン変異型と蛍光蛋白質を融合した蛍光ユビキチン蛋白質を作成し、FRET assayを行い、IpaH4.5はK6,11,48,63鎖を作ることを見いだした。他のIpaHファミリー蛋白質を用いて、ファミリー間のユビキチン化能に差があることもみいだした。さらに、E1阻害剤(UBE1-41)をこのユビキチン化反応系に添加し、FRETシグナルを測定することでIC50を算出できた。今回、開発したFRET-base ubiquitination assay はユビキチンリガーゼ活性測定、ユビキチン鎖の特定及び低分子阻害剤のスクリーニングに応用できると考えられる。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2017 2016 2015

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Manipulation of host ubiquitin-proteasome system by bacterial pathogens2017

    • Author(s)
      Kim Minsoo
    • Journal Title

      Journal of The Society of Japanese Women Scientists

      Volume: 17 Issue: 1 Pages: 8-18

    • DOI

      10.5939/sjws.17002

    • NAID

      130005465162

    • ISSN
      1349-4449, 2186-3776
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Midori-ishi Cyan/monomeric Kusabira-Orange-based fluorescence resonance energy transfer assay for characterization of various E3 ligases2016

    • Author(s)
      R. Otsubo, et al
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 21 Issue: 6 Pages: 608-623

    • DOI

      10.1111/gtc.12369

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Crystal structure of the substrate-recognition domain of the Shigella E3 ligase IpaH9.82016

    • Author(s)
      K Takagi, et al
    • Journal Title

      Acta Cryst

      Volume: F72 Issue: 4 Pages: 269-275

    • DOI

      10.1107/s2053230x16002715

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] バクテリアの病原性とユビキチン関連修飾システム2016

    • Author(s)
      M KIM
    • Journal Title

      医学のあゆみ

      Volume: 256 (8) Pages: 880-884

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] ユビキチン修飾システムの認識機構解明2017

    • Author(s)
      Kim Minsoo
    • Organizer
      日本女性科学者の会 第11回学術大会
    • Place of Presentation
      大阪科学技術センター
    • Year and Date
      2017-01-07
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] リアルタイムでユビキチン化を測定する方法の開発2016

    • Author(s)
      Kim Minsoo
    • Organizer
      第39 回 日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2016-12-01
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Regulating host immune responses with bacterial effectors2015

    • Author(s)
      Minsoo Kim
    • Organizer
      3rd International Picobiology Institute Symposium
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学
    • Year and Date
      2015-12-08
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2015-04-16   Modified: 2018-03-28  

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