システム生物学的アプローチによる希少がんの分子病態解明と臨床病態の予測

Publicly Offered Research

Project Area	Integrative Systems Understanding of Cancer for Advanced Diagnosis, Therapy and Prevention
Project/Area Number	25134719
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
Allocation Type	Single-year Grants
Review Section	Complex systems
Research Institution	National Cancer Center Japan
Principal Investigator	谷内田真一独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (20359920)
Project Period (FY)	2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status	Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help	¥13,000,000 (Direct Cost: ¥10,000,000、Indirect Cost: ¥3,000,000) Fiscal Year 2014: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000) Fiscal Year 2013: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Keywords	希少がん / エクソン解析 / コピー数解析
Outline of Annual Research Achievements	希少がんであり難治がんであるファーター乳頭部がんを研究対象とした。希少であることから、本邦6施設と米国・ジョンズホプキンス大学から研究試料を収集した。全施設の研究倫理審査委員会の承認を得た後に研究を開始した。 Discovery setとして60症例を全エクソン・シークエンス解析とコピー数解析（CGHアレイ）を行った。全エクソン解析はSureSelct-Illuminaプラットホームを用いて行った。全エクソン解析の結果、高頻度の変異が検出された92遺伝子をがん関連候補遺伝子として抽出した。 Validation setとして、日米の172例のファーター乳頭部がんを研究対象とし、92遺伝子のTargeted deep sequencingを行った。Targeted deep sequencingは、HaloPlex-Illuminaプラットホームを用いて行った。さらに全例で、CDX2、MUC2、MUC1とCK20の市販の抗体を用いて、免疫組織化学染色を行い、Intestinal typeとPancreatobiliary typeに亜分類を行った。上記の解析の結果、Intestinal typeは大腸がんに類似した遺伝子異常、Pancreatobiliary typeは膵臓がんに類似した遺伝子異常のパターンを示した。並行して、非ファーター乳頭部十二指腸がんの網羅的遺伝子解析も行い。ファーター乳頭部がんと比較検討した。
Research Progress Status	26年度が最終年度であるため、記入しない。
Strategy for Future Research Activity	26年度が最終年度であるため、記入しない。