Protein handling by molecular chaperones

2009 Fiscal Year Self-evaluation Report

• Project Area: Protein community: organization and maintenance of protein functions
• Project/Area Number: 19058004
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: Kyoto Sangyo University (2009-2011); Tokyo Institute of Technology (2007-2008)
• Principal Investigator: YOSHIDA Masasuke Tokyo Institute of Technology, 工学部, 教授 (90049073)
• Project Period (FY): 2007 – 2011
• Keywords: 分子シャペロン / GroEL / ClpB / FtsH

Research Abstract

分子シャペロンが、基質蛋白質をどのようにハンドリング(操作)しているか、基本的な方式が3つあると思われる。第1は、FtsHやClpBなどで、タンパク質をヒモにしてリングの穴の中を糸通しする場合である。第2は、GroEL/ESなどで、分子シャペロンの分子内空洞の中に変性タンパク質を閉じこめる場合である。第3は、DnaK/Jなどで、変性したタンパク質をつかまえて、はなす、これだけを行う場合である。この特定領域研究で追究するのは(第1)ポリペプチド鎖を一方向に引っ張る糸通しのメカニズム、(第2)変性タンパク質を狭い空洞に招き入れる仕組みとその中での折れたたみ方、(第3)結合と解離の制御、である。

Research Products

• [Journal Article] Probing open conformation of GroEL rings by cross-linking reveals single and double open ring structures of GroEL in ADP and ATP. (2009)
  • Author(s): Nojima T, Yoshida M.
  • Journal Title: J Biol Chem. 284(34) Pages: 22834-9
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Stability of the two wings of the coiled-coil domain of ClpB chaperone is critical for its disaggregation activity. (2009)
  • Author(s): Watanabe YH, Nakazaki Y, Suno R, Yoshida M.
  • Journal Title: Biochem J. 421(1) Pages: 71-7
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Determination of the Number of Active GroES Subunits in the Fused Heptamer GroES Required for Interactions with GroEL (2008)
  • Author(s): Nojima T, Murayama S, Yoshida M, Motojima F.
  • Journal Title: J. Biol. Chem. 283 Pages: 18385-18392
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] UncI protein can mediate ring-assembly of c-subunits of FoF1-ATP synthase in vitro (2008)
  • Author(s): Ozaki Y, Suzuki T, Kuruma Y, Ueda T, Yoshida M.
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun. 367(3) Pages: 663-6
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Ribosome protein L2 is a client protein for E. coli HtpG (2009)
  • Author(s): Miyazaki, Y., Motojima, F., Yoshida, M.
  • Organizer: 日本生化学会82回年会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2009-10-22
• [Presentation] The ATPase cycleof chaperonin gives another chance of the assisted folding to the escaped protein from the chaperonin cage (2009)
  • Author(s): Motojima, F., Yoshida, M.
  • Organizer: 日本生化学会82回年会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2009-10-22
• [Presentation] Analysis of substrate translocation activity of ClpB mutants. (2009)
  • Author(s): Nakazaki, Y., Mizuno, S., Watanabe, K., Yoshida, M., Watanabe, Y.
  • Organizer: 日本生化学会82回年会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2009-10-22
• [Presentation] Functional analysis of flexibility of GroES mobile loop. (2009)
  • Author(s): Nojima, T., Yoshida, M.
  • Organizer: 日本生化学会82回年会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2009-10-22