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2012 Fiscal Year Annual Research Report

Host cell competnecy for negative-stranded RNA viruses

Planned Research

Project AreaMolecular basis of host cell competency in virus infection
Project/Area Number 24115002
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

永田 恭介  筑波大学, 医学医療系, 教授 (40180492)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 朴 三用  横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 教授 (20291932)
Project Period (FY) 2012-06-28 – 2017-03-31
Keywordsウイルス / 宿主因子 / ゲノム複製 / 転写 / インフルエンザウイルス / RNA依存性RNAポリメラーゼ / 分子生物学 / 構造生物学
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、インフルエンザウイルスゲノムの機能制御に関わる宿主因子を同定し、それらの機能と分子構造を明らかにする。その上で、ウイルスの増殖と宿主生理機能の間で起こる宿主因子の奪い合いのメカニズムを明らかにすることである。
新規に複製されたウイルスゲノムは、ウイルスタンパク質NPと結合してribonucleoprotein (RNP)複合体を形成する。しかし、試験管内ゲノム複製反応に必須な宿主因子であるMCM複合体とNPを添加したのみでは、子孫RNP複合体は形成されない。これまで我々は、試験管内ゲノム複製系の再構成と解体により、この過程を促進する宿主因子として、スプライシングに関わる因子であるUAP56を同定し、ウイルスゲノム複製と協調してUAP56によってNPがウイルスゲノム上に配置されることを明らかにしている。そこで本年度では、UAP56とNPの複合体形成機構を解析した。まず、各種欠損変異体を用いた解析より、NPのN末端から20アミノ酸の領域がUAP56のC末端部分と結合することが明らかになった。一方、細胞内でのUAP56の標的因子であるU2AF65とNPのUAP56結合部位のalpha-ヘリックスのアミノ酸配置を比較したところ、共通して同じ表面上に疎水性アミノ酸残基が露出していることが明らかになった。さらに、保存された疎水性アミノ酸の点変異株を作出したところ、どの変異体でも顕著にUAP56との結合が低下し、ウイルス増殖が低下した。以上の結果より、NPはU2AF65とUAP56の結合を模倣することで、宿主生理機能系からUAP56をウイルスの増殖過程へとリクルートすると考えられた。また、インフルエンザウイルス感染により、スプライソソームが崩壊することも観察されており、UAP56のウイルス複製系へのリクルートにより、スプライシングが破綻していることが示唆される。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

我々が独自に構築した試験管内複製・転写系により同定した宿主因子とウイルスタンパク質の分子遺伝学的な相互作用機構を明らかにすることで、インフルエンザウイルスがどのように宿主のスプライシング装置から、宿主因子をウイルスの増殖過程へとリクルートするという新たな機構を示すことができた。

Strategy for Future Research Activity

今後は、NPとUAP56の相互作用部位の結晶構造解析を行い、さらに詳細な分子メカニズムを明らかにする。NPのUAP56結合ドメインは天然変性状態であり、UAP56と結合することで一定の構造を形成すると推測される。NPとUAP56の複合体構造を明らかにすることで、(1)変性領域を介して、どのようにターゲット分子が認識されるのか、(2)変性領域がどのように立体構造を形成するのか、など、構造生物学的にも重要な知見が得られると考えられる。さらに、スプライシング関連因子に着目して、他の宿主因子の同定も進める予定である。また、複製後の子孫ウイルスゲノムの細胞内動態に関しても解析をする予定である。

  • Research Products

    (32 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (23 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The role of the N-terminal loop in the function of the colicin E7 nuclease domain.2013

    • Author(s)
      Czene A.
    • Journal Title

      Journal of Biological Inorganic Chemistry

      Volume: 18(3) Pages: 309-321

    • DOI

      10.1007/s00775-013-0975-7.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] YB-1 functions as a porter to lead influenza virus ribonucleoprotein complexes to microtubules.2012

    • Author(s)
      Kawaguchi A.
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 86(20) Pages: 11086-11095

    • DOI

      10.1128/JVI.00453-12

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Replication-uncoupled histone deposition during adenovirus DNA replication.2012

    • Author(s)
      Komatsu T.
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 86(12) Pages: 6701-6711

    • DOI

      10.1128/JVI.00380-12

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Critical role of an antiviral stress granule containing RIG-I and PKR in viral detection and innate immunity.2012

    • Author(s)
      Onomoto K.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 7(8) Pages: e43031

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0043031

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] B23/nucleophosmin is involved in regulation of adenovirus chromatin structure at late infection stages, but not in virus replication and transcription.2012

    • Author(s)
      Samad MA.
    • Journal Title

      Journal of General Virology

      Volume: 93(6) Pages: 1328-1338

    • DOI

      10.1099/vir.0.036665-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cell tropism and pathogenicity of measles virus in monkeys.2012

    • Author(s)
      Kato SI.
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 3 Pages: 14

    • DOI

      10.3389/fmicb.2012.00014

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Function of homo- and hetero-oligomers of human nucleoplasmin/nucleophosmin family proteins NPM1, NPM2, and NPM3 during sperm chromatin remodeling.2012

    • Author(s)
      Okuwaki M.
    • Journal Title

      Nucleic Acid Research

      Volume: 40 Pages: 4861-4878

    • DOI

      10.1093/nar/gks162

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] New sandwich-type enzyme-linked immunosorbent assay for human MxA protein in a whole blood using monoclonal antibodies against GTP-binding domain for recognition of viral infection.2012

    • Author(s)
      Kawamura M.
    • Journal Title

      Journal of Clinical Laboratory Analysis

      Volume: 26 Pages: 174-183

    • DOI

      10.1002/jcla.21507

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] YB-1 is a porter to lead influenza virus ribonucleoprotein complexes to microtubules for the virus production.2013

    • Author(s)
      Kawaguchi A.
    • Organizer
      The 2nd Meeting on RNA and Biofunctions-Asis Study "RNA Biofunctions and Viruses"
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2013-01-09 – 2013-01-11
  • [Presentation] 薬剤耐性ウイルスが出現しない抗インフルエンザウイルス薬開発に向けた宿主因子依存性ウイルスRNAゲノムの複製転写機構.2012

    • Author(s)
      永田恭介
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2012-12-11 – 2012-12-14
  • [Presentation] RNA依存性RNAポリメラーゼを用いた新規レポーターシステムによるrRNA遺伝子の種特異的転写機構の解析.2012

    • Author(s)
      村野健作
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2012-12-11 – 2012-12-14
  • [Presentation] 細胞がん化に関わる核膜孔タンパク質の発現異常.2012

    • Author(s)
      齋藤祥子
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2012-12-11 – 2012-12-14
  • [Presentation] 新規宿主因子YB-1によるインフルエンザウイルスRNP複合体の微小管への輸送機構解析.2012

    • Author(s)
      川口敦史
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2012-12-11 – 2012-12-14
  • [Presentation] VprBP, a Substrate Receptor Subunit of Cullin4-DDB1 E3 Ubiquitin Ligase Complex, is Involved Ubiquitination of Histone H1.2012

    • Author(s)
      加藤広介
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2012-12-11 – 2012-12-14
  • [Presentation] EZH2はインフルエンザゲノムの核外輸送を制御する.2012

    • Author(s)
      浅賀正充
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2012-12-11 – 2012-12-14
  • [Presentation] ヒト化マウスを用いた麻疹ウイルス感染モデルマウスの作製.2012

    • Author(s)
      木村英樹
    • Organizer
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2012-11-13 – 2012-11-15
  • [Presentation] インフルエンザウイルスRNAポリメラーゼの伸長活性に及ぼすキャップ構造の意義.2012

    • Author(s)
      若井ちとせ
    • Organizer
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2012-11-13 – 2012-11-15
  • [Presentation] 細胞骨格関連因子によるインフルエンザウイルス増殖制御.2012

    • Author(s)
      熊倉充子
    • Organizer
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2012-11-13 – 2012-11-15
  • [Presentation] 新規宿主因子YB-1によるインフルエンザウイルスゲノムの細胞内輸送制御.2012

    • Author(s)
      川口敦史
    • Organizer
      第60回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2012-11-13 – 2012-11-15
  • [Presentation] YB-1 is a porter to lead influenza virus ribonucleoprotein complexes to microtubules.2012

    • Author(s)
      Kawaguchi A.
    • Organizer
      The 3rd Leading Graduate Schools International Conference (Tsukuba Global Science Week)
    • Place of Presentation
      Tsukuba
    • Year and Date
      2012-11-01 – 2012-11-02
  • [Presentation] esign of a novel artificial metallonuclease for targeting the breakpoint in Duchenne Muscular Dystrophy.2012

    • Author(s)
      Gyurcsik B.
    • Organizer
      The 3rd Leading Graduate Schools International Conference (Tsukuba Global Science Week)
    • Place of Presentation
      Tsukuba
    • Year and Date
      2012-11-01 – 2012-11-02
  • [Presentation] The Species-specific transcription mechanism of rRNA gene revealed by a novel monitoring system-using RNA-dependent RNA polymerase.2012

    • Author(s)
      Murano K.
    • Organizer
      The 7th Tsukuba Medical Science Research Meeting (Tsukuba Global Science Week)
    • Place of Presentation
      Tsukuba
    • Year and Date
      2012-11-01 – 2012-11-02
  • [Presentation] The promoter binding sites in the influenza virus polymerase PB1.2012

    • Author(s)
      Binh N.T.
    • Organizer
      The 7th Tsukuba Medical Science Research Meeting (Tsukuba Global Science Week)
    • Place of Presentation
      Tsukuba
    • Year and Date
      2012-11-01 – 2012-11-02
  • [Presentation] Function of IREF-2, a newly identified for replication of the influenza virus RNA genome.2012

    • Author(s)
      Sugiyama K.
    • Organizer
      The 7th Tsukuba Medical Science Research Meeting (Tsukuba Global Science Week)
    • Place of Presentation
      Tsukuba
    • Year and Date
      2012-11-01 – 2012-11-02
  • [Presentation] A novel function of NS1 viral protein in intracellular of the influenza virus genome.2012

    • Author(s)
      Osari S.
    • Organizer
      The 7th Tsukuba Medical Science Research Meeting (Tsukuba Global Science Week)
    • Place of Presentation
      Tsukuba
    • Year and Date
      2012-11-01 – 2012-11-02
  • [Presentation] Assembly and maintenance of the nucleolar structure by RNA and RNA binding protein.2012

    • Author(s)
      Okuwaki M.
    • Organizer
      Human Biology Symposium-Biology and Regenerative Medicine
    • Place of Presentation
      Tsukuba
    • Year and Date
      2012-10-30 – 2012-10-31
  • [Presentation] ヒストンH1シャペロンTAF-Iによるクロマチン動態制御機構の解析.2012

    • Author(s)
      加藤広介
    • Organizer
      生殖サイクル若手勉強会2012
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2012-07-25 – 2012-07-27
  • [Presentation] ウイルス研究が育んだ現代生命科学.2012

    • Author(s)
      永田恭介
    • Organizer
      第9回ウイルス学キャンプin湯河原
    • Place of Presentation
      熱海
    • Year and Date
      2012-07-10 – 2012-07-11
  • [Presentation] インフルエンザウイルスゲノムの細胞内輸送機構の解析.2012

    • Author(s)
      川口敦史
    • Organizer
      第9回ウイルス学キャンプin湯河原
    • Place of Presentation
      熱海
    • Year and Date
      2012-07-10 – 2012-07-11
  • [Presentation] インフルエンザウイルスゲノムの輸送にかかわる細胞骨格関連因子の解析.2012

    • Author(s)
      熊倉充子
    • Organizer
      第9回ウイルス学キャンプin湯河原
    • Place of Presentation
      熱海
    • Year and Date
      2012-07-10 – 2012-07-11
  • [Presentation] NS1によるインフルエンザウイルスゲノムの細胞内局在決定機構の解析.2012

    • Author(s)
      長利卓
    • Organizer
      第9回ウイルス学キャンプin湯河原
    • Place of Presentation
      熱海
    • Year and Date
      2012-07-10 – 2012-07-11
  • [Remarks] 筑波大学 感染生物学分子ウイルス学分野

    • URL

      http://www.md.tsukuba.ac.jp/basic-med/infectionbiology/virology/

URL: 

Published: 2018-02-02  

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